本文關(guān)鍵詞：小麥條銹病新抗源L693抗性基因的EST分子標(biāo)記作圖與共線性片段分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：小麥條銹病是由條形柄銹菌(Puccinia striiformis f. sp. Tritic)引起的世界范圍內(nèi)廣泛發(fā)生的小麥流行病害。中國是一個人口大國,小麥?zhǔn)亲钪饕目诩Z之一,小麥條銹病對我國小麥產(chǎn)量影響尤其大。我國小麥條銹病流行體系更為復(fù)雜,條銹菌有越冬區(qū)和越夏區(qū),很難從空間和時(shí)間上阻斷,使得防控工作很難取得成效。諸多學(xué)者研究指出,選育抗病品種和發(fā)掘新的抗病資源是防治小麥條銹病最有效的途徑,不斷發(fā)現(xiàn)新的抗病基因以應(yīng)對新突變的毒性小種。歷次大的條銹病流行,迫切要求我們多樣化主栽品種,不能單一推廣某個系列小麥,只能不斷豐富抗性基因資源,抗條銹病研究是沒有止境的斗爭,任重而道遠(yuǎn)。前期的研究通過SSR分子標(biāo)記,已經(jīng)確認(rèn)抗病新品系L693的抗條銹病基因YrL693(YrYU25)在小麥1B染色體上,并篩選到多對SSR標(biāo)記,但標(biāo)記不夠多,需要通過其他分子標(biāo)記技術(shù)進(jìn)一步加密。本研究是以抗病親本L693與感病親本L661雜交得到的F2后代和F2：3家系為作圖群體。首先查找文獻(xiàn)中報(bào)道的小麥1B染色體上的EST分子標(biāo)記,進(jìn)行多態(tài)性篩選,更多的EST標(biāo)記設(shè)計(jì)需要從GrainGene網(wǎng)站下載1B染色體上EST資源,設(shè)計(jì)EST-STS標(biāo)記,用以多態(tài)性篩選。之后用連鎖EST引物對應(yīng)的EST序列與短柄草、水稻、高粱基因組進(jìn)行比較基因組學(xué)分析,確定YrL693基因所在范圍在短柄草、水稻、高粱上的共線性片段。具體實(shí)驗(yàn)結(jié)果如下：1.抗病親本L693和感病親本L661雜交得到的F1代抗病,F1代自交得到的F2代出現(xiàn)抗感分離,卡方檢驗(yàn)符合3R：1S的分離比；F2：3家系各行也出現(xiàn)抗感分離,經(jīng)卡方檢驗(yàn)符合1R：2H：1S的分離比,由此足以證明L693的抗條銹性是受一對顯性基因控制。這個L693的抗性基因暫時(shí)命名為YrL693。2.前期工作已經(jīng)通過SSR標(biāo)記將YrL693定位在1B染色體上,本研究采用EST分子標(biāo)記技術(shù)進(jìn)一步加密遺傳圖譜。經(jīng)過F2群體基因組DNA的PCR擴(kuò)增和聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測,共得到8對連鎖的EST-STS標(biāo)記：CD77、WE173、WE201、 BE443300、BE518403、BE444094、BE404005和BE405692,在構(gòu)建的遺傳連鎖圖譜上的位置分別是：1.186 cM、0.118 cM.1.011 cM、0.758 cM、0.853 cM、0.93cM、 0.948 cM和1.282 cM。其中,BE443300和BE444094分析的基因型呈3：1,其余6對分析的基因型呈1：2：1。3.用篩選到的8對EST-STS引物以及饒和斐報(bào)道的共分離EST引物L(fēng)S36對應(yīng)的EST序列,與短柄草、水稻、高粱進(jìn)行比較基因組學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)BE444094、 BE518403、LS36對應(yīng)在短柄草3號染色體上2.22Mb (Bradi3g2616-Bradi3g27877)、水稻10號染色體上3.49Mb (Os10g0396400-Os10g0456500)和高粱1號染色體上8.12Mb (Sbo1g020230-Sb01g023110)的序列呈共線性。這些共線序列上的基因可為候選基因的分析提供參考。
【關(guān)鍵詞】：小麥 條銹病 EST標(biāo)記 共線性
【學(xué)位授予單位】：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：S435.121.42
【目錄】：

• 摘要4-6
• Abstract6-10
• 1 文獻(xiàn)綜述10-23
• 1.1 小麥條銹病的危害10-11
• 1.2 中國小麥條銹病的流行體系11
• 1.3 小麥條銹病防治方法11
• 1.4 小麥抗條銹病的研究歷史11-12
• 1.5 小麥抗條銹病基因的研究12-15
• 1.6 小麥條銹病抗性遺傳研究方法15-17
• 1.6.1 基因推導(dǎo)法15-16
• 1.6.2 常規(guī)雜交法16
• 1.6.3 細(xì)胞遺傳學(xué)方法16-17
• 1.6.4 分子標(biāo)記連鎖分析法17
• 1.7 分子標(biāo)記技術(shù)的運(yùn)用17-20
• 1.7.1 RFLP分子標(biāo)記17
• 1.7.2 RAPD分子標(biāo)記17-18
• 1.7.3 AFLP分子標(biāo)記18
• 1.7.4 RGAP分子標(biāo)記18
• 1.7.5 SSR分子標(biāo)記18-19
• 1.7.6 SNP分子標(biāo)記19
• 1.7.7 EST分子標(biāo)記19-20
• 1.8 比較基因組與共線性分析20-21
• 1.9 研究目的與意義21-22
• 1.10 技術(shù)路線22-23
• 2 材料與方法23-30
• 2.1 供試材料23
• 2.1.1 親本材料23
• 2.1.2 誘發(fā)材料23
• 2.1.3 條銹菌系23
• 2.3 遺傳群體構(gòu)建23
• 2.4 小麥抗條銹病抗性鑒定23-24
• 2.5 小麥抗條銹病基因的EST標(biāo)記篩選24-28
• 2.5.1 小麥基因組DNA的提取和檢測24-25
• 2.5.2 基因組DNA的PCR擴(kuò)增25-27
• 2.5.3 聚丙烯酰胺凝膠電泳27-28
• 2.6 EST分子標(biāo)記開發(fā)28-29
• 2.6.1 YrL693基因附近ESTs序列的獲得29
• 2.6.2 ESTs引物序列的設(shè)計(jì)29
• 2.7 目的基因的EST定位29
• 2.8 比較基因組分析29-30
• 3 結(jié)果與分析30-37
• 3.1 YrL693遺傳分析30
• 3.2 EST分子標(biāo)記的設(shè)計(jì)30-31
• 3.3 EST分子標(biāo)記的鑒定31-33
• 3.4 比較基因組學(xué)分析33-34
• 3.5 YrL693與Yr24/26位點(diǎn)分析34-37
• 4 討論37-38
• 4.1 YrL693遺傳分析37
• 4.2 YrL693遺傳連鎖圖譜構(gòu)建37
• 4.3 比較基因組學(xué)研究37-38
• 5 結(jié)論38-39
• 參考文獻(xiàn)39-46
• 致謝46

【相似文獻(xiàn)】

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