扇脈杓蘭(Cypripedium japonicum Thunb.)內(nèi)生和根際真菌多樣性研究
發(fā)布時(shí)間:2021-05-22 16:48
蘭花種子微小,缺乏儲(chǔ)存營(yíng)養(yǎng)的胚乳。在自然環(huán)境中,只有合適的共生真菌侵染種子,才能順利萌發(fā),這是蘭科植物瀕危的原因之一。東亞特有瀕危植物扇脈杓蘭(Cypripedium japonicum Thunb.)的種群數(shù)量正在急劇減少,已被列入《野生動(dòng)植物瀕危物種國(guó)際貿(mào)易公約》(CITES)附錄I中。關(guān)于扇脈杓蘭共生真菌的相關(guān)研究非常有限,目前尚不清楚其共生真菌的多樣性和專一性關(guān)系,以及這些真菌在時(shí)間和地點(diǎn)上的動(dòng)態(tài)變化。因此,本研究選擇位于天目山(紅蛇洞、老殿、寶劍石)和清涼峰的4個(gè)扇脈杓蘭野生居群的根和根際土作為研究對(duì)象,利用Illumina MiSeq高通量測(cè)序的方法,進(jìn)行生物學(xué)和統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。探究扇脈杓蘭根際和內(nèi)生真菌的多樣性,棲息地、生長(zhǎng)階段和親緣關(guān)系三個(gè)因素對(duì)扇脈杓蘭共生真菌群落的影響。主要結(jié)果如下:1.在扇脈杓蘭(17株)根和根際土壤樣品中,共得到扇脈杓蘭內(nèi)生真菌896個(gè)OTUs(518,688條序列),隸屬于7個(gè)門、25個(gè)綱、64個(gè)目、142個(gè)科、246個(gè)屬;根際真菌5,442個(gè)OTUs(1,116,937條序列),隸屬于9個(gè)門、34個(gè)綱、115個(gè)目、296個(gè)科、695個(gè)屬。2.與扇...
【文章來(lái)源】:華東師范大學(xué)上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:136 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1.研究背景
1.1 蘭科植物概述及瀕危因素
1.1.1 蘭科植物概述
1.1.2 蘭科植物瀕,F(xiàn)狀及其原因
1.2 蘭科植物菌根真菌的研究進(jìn)展
1.2.1 蘭科菌根真菌的研究方法
1.2.2 蘭科植物的菌根真菌多樣性
1.2.3 蘭科植物的菌根真菌專一性
1.2.4 蘭科菌根真菌特異性與植物瀕危關(guān)系
1.3 扇脈杓蘭概況及真菌多樣性研究進(jìn)展
1.3.1 扇脈杓蘭概況
1.3.2 扇脈杓蘭真菌多樣性研究
1.3.3 研究的目的與意義
2.實(shí)驗(yàn)材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 采集地點(diǎn)
2.1.2 材料采集
2.2 實(shí)驗(yàn)儀器設(shè)備、試劑及藥品
2.2.1 儀器設(shè)備
2.2.2 試劑及藥品
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 材料預(yù)處理
2.3.2 基因組DNA抽提
2.3.3 PCR擴(kuò)增
2.3.4 測(cè)序
2.3.5 數(shù)據(jù)處理
2.3.6 生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析
2.3.7 統(tǒng)計(jì)學(xué)數(shù)據(jù)分析
3.結(jié)果與分析
3.1 扇脈杓蘭內(nèi)生和根際真菌結(jié)果
3.1.1 OTUs聚類分析
3.1.2 分類水平分析
3.1.3 NMDS分析
3.2 不同居群扇脈杓蘭內(nèi)生和根際真菌結(jié)果
3.2.1 生物信息學(xué)分析結(jié)果
3.2.2 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析結(jié)果
3.3 不同生長(zhǎng)階段扇脈杓蘭內(nèi)生和根際真菌結(jié)果
3.3.1 生物信息學(xué)分析結(jié)果
3.3.2 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析結(jié)果
3.4 不同物種內(nèi)生和根際真菌結(jié)果
3.4.1 生物信息學(xué)分析結(jié)果
3.4.2 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析結(jié)果
4.討論
4.1 扇脈杓蘭內(nèi)生與根際真菌多樣性分析
4.2 不同因素對(duì)扇脈杓蘭共生真菌的影響
4.2.1 地點(diǎn)對(duì)真菌群落的影響
4.2.2 生長(zhǎng)階段對(duì)真菌群落的影響
4.2.3 分類層級(jí)對(duì)真菌群落的影響
4.3 菌根真菌與瀕危的關(guān)系
5.結(jié)論與展望
5.1 結(jié)論
5.2 展望
參考文獻(xiàn)
附錄
附錄 Ⅰ 稀釋曲線分析圖
附錄 Ⅱ 各因素下真菌OTUs的 Adonis分析
附錄 Ⅲ 攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表論文情況
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中國(guó)被子植物瀕危等級(jí)的評(píng)估[J]. 覃海寧,趙莉娜,于勝祥,劉慧圓,劉博,夏念和,彭華,李振宇,張志翔,何興金,尹林克,林余霖,劉全儒,侯元同,劉演,劉啟新,曹偉,李建強(qiáng),陳世龍,金效華,高天剛,陳文俐,馬海英,耿玉英,金孝鋒,常朝陽(yáng),蔣宏,蔡蕾,臧春鑫,武建勇,葉建飛,賴陽(yáng)均,劉冰,林秦文,薛納新. 生物多樣性. 2017(07)
[2]中國(guó)野生蘭科植物物種多樣性與地理分布[J]. 張殷波,杜昊東,金效華,馬克平. 科學(xué)通報(bào). 2015(02)
[3]野生蘭屬植物菌根真菌的分離和表型鑒定[J]. 李杰,王芝娜,匡萍,張銀潔. 亞熱帶農(nóng)業(yè)研究. 2013(04)
[4]蘭科石斛屬植物菌根共生研究進(jìn)展[J]. 陳娟,張麗春,邢詠梅,郭順星. 中國(guó)藥學(xué)雜志. 2013(19)
[5]廣西雅長(zhǎng)林區(qū)野生蘭科植物資源現(xiàn)狀與保護(hù)策略[J]. 馮昌林,鄧振海,蔡道雄,吳天貴,賈宏炎,白靈海,趙祖壯,蘇勇. 植物科學(xué)學(xué)報(bào). 2012(03)
[6]清涼峰旅游區(qū)鳥類多樣性及季節(jié)變動(dòng)[J]. 陳靜,王玉軍,武丙琳,魯慶彬. 南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2012(03)
[7]扇脈杓蘭AFLP反應(yīng)體系的建立[J]. 李全健,王彩霞,田敏,李翠新. 湖南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(01)
[8]安徽清涼峰國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)保護(hù)管理現(xiàn)狀與發(fā)展對(duì)策[J]. 方國(guó)富,邵江山,邵小平. 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2011(S2)
[9]蘭花的傳粉與保護(hù)研究[J]. 李鵬,鄭桂靈,周峰. 北方園藝. 2009(05)
[10]中國(guó)蘭科植物新資料[J]. 胡愛群,葉德平,邢福武. 植物研究. 2008(02)
博士論文
[1]蘭科菌根真菌多樣性研究及其對(duì)蘭科植物的影響[D]. 楊前宇.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2018
[2]貴州特色藥用蘭科植物杜鵑蘭和獨(dú)蒜蘭共生真菌研究與應(yīng)用[D]. 朱國(guó)勝.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[3]獨(dú)花蘭和扇脈杓蘭的傳粉生態(tài)學(xué)[D]. 孫海芹.中國(guó)科學(xué)院研究生院(植物研究所) 2005
碩士論文
[1]中國(guó)齒唇蘭屬(Odontochilus)及其近緣屬植物的系統(tǒng)分類研究[D]. 劉嚴(yán)文.華東師范大學(xué) 2018
[2]天目山常綠落葉闊葉混交林碳水通量及能量通量的特征研究[D]. 孫恒.浙江農(nóng)林大學(xué) 2017
[3]幾種蘭花根際土壤真菌及根內(nèi)生真菌研究[D]. 田佳妮.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2015
[4]東亞特有珍稀蘭科植物扇脈杓蘭的遺傳多樣性與譜系地理學(xué)研究[D]. 李星霖.華東師范大學(xué) 2014
[5]扇脈杓蘭的生殖生物學(xué)研究[D]. 劉芬.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2012
[6]扇脈杓蘭(Cypripedium japonicum Thunb.) 菌根顯微結(jié)構(gòu)與內(nèi)生真菌多樣性[D]. 喬元寶.西南大學(xué) 2011
[7]四川黃龍溝優(yōu)勢(shì)蘭科植物菌根真菌多樣性研究[D]. 侯天文.北京林業(yè)大學(xué) 2010
[8]蘭科菌根真菌與植物專一性關(guān)系研究[D]. 武靜宇.河北大學(xué) 2009
本文編號(hào):3201339
【文章來(lái)源】:華東師范大學(xué)上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:136 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1.研究背景
1.1 蘭科植物概述及瀕危因素
1.1.1 蘭科植物概述
1.1.2 蘭科植物瀕,F(xiàn)狀及其原因
1.2 蘭科植物菌根真菌的研究進(jìn)展
1.2.1 蘭科菌根真菌的研究方法
1.2.2 蘭科植物的菌根真菌多樣性
1.2.3 蘭科植物的菌根真菌專一性
1.2.4 蘭科菌根真菌特異性與植物瀕危關(guān)系
1.3 扇脈杓蘭概況及真菌多樣性研究進(jìn)展
1.3.1 扇脈杓蘭概況
1.3.2 扇脈杓蘭真菌多樣性研究
1.3.3 研究的目的與意義
2.實(shí)驗(yàn)材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 采集地點(diǎn)
2.1.2 材料采集
2.2 實(shí)驗(yàn)儀器設(shè)備、試劑及藥品
2.2.1 儀器設(shè)備
2.2.2 試劑及藥品
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 材料預(yù)處理
2.3.2 基因組DNA抽提
2.3.3 PCR擴(kuò)增
2.3.4 測(cè)序
2.3.5 數(shù)據(jù)處理
2.3.6 生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析
2.3.7 統(tǒng)計(jì)學(xué)數(shù)據(jù)分析
3.結(jié)果與分析
3.1 扇脈杓蘭內(nèi)生和根際真菌結(jié)果
3.1.1 OTUs聚類分析
3.1.2 分類水平分析
3.1.3 NMDS分析
3.2 不同居群扇脈杓蘭內(nèi)生和根際真菌結(jié)果
3.2.1 生物信息學(xué)分析結(jié)果
3.2.2 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析結(jié)果
3.3 不同生長(zhǎng)階段扇脈杓蘭內(nèi)生和根際真菌結(jié)果
3.3.1 生物信息學(xué)分析結(jié)果
3.3.2 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析結(jié)果
3.4 不同物種內(nèi)生和根際真菌結(jié)果
3.4.1 生物信息學(xué)分析結(jié)果
3.4.2 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析結(jié)果
4.討論
4.1 扇脈杓蘭內(nèi)生與根際真菌多樣性分析
4.2 不同因素對(duì)扇脈杓蘭共生真菌的影響
4.2.1 地點(diǎn)對(duì)真菌群落的影響
4.2.2 生長(zhǎng)階段對(duì)真菌群落的影響
4.2.3 分類層級(jí)對(duì)真菌群落的影響
4.3 菌根真菌與瀕危的關(guān)系
5.結(jié)論與展望
5.1 結(jié)論
5.2 展望
參考文獻(xiàn)
附錄
附錄 Ⅰ 稀釋曲線分析圖
附錄 Ⅱ 各因素下真菌OTUs的 Adonis分析
附錄 Ⅲ 攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表論文情況
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中國(guó)被子植物瀕危等級(jí)的評(píng)估[J]. 覃海寧,趙莉娜,于勝祥,劉慧圓,劉博,夏念和,彭華,李振宇,張志翔,何興金,尹林克,林余霖,劉全儒,侯元同,劉演,劉啟新,曹偉,李建強(qiáng),陳世龍,金效華,高天剛,陳文俐,馬海英,耿玉英,金孝鋒,常朝陽(yáng),蔣宏,蔡蕾,臧春鑫,武建勇,葉建飛,賴陽(yáng)均,劉冰,林秦文,薛納新. 生物多樣性. 2017(07)
[2]中國(guó)野生蘭科植物物種多樣性與地理分布[J]. 張殷波,杜昊東,金效華,馬克平. 科學(xué)通報(bào). 2015(02)
[3]野生蘭屬植物菌根真菌的分離和表型鑒定[J]. 李杰,王芝娜,匡萍,張銀潔. 亞熱帶農(nóng)業(yè)研究. 2013(04)
[4]蘭科石斛屬植物菌根共生研究進(jìn)展[J]. 陳娟,張麗春,邢詠梅,郭順星. 中國(guó)藥學(xué)雜志. 2013(19)
[5]廣西雅長(zhǎng)林區(qū)野生蘭科植物資源現(xiàn)狀與保護(hù)策略[J]. 馮昌林,鄧振海,蔡道雄,吳天貴,賈宏炎,白靈海,趙祖壯,蘇勇. 植物科學(xué)學(xué)報(bào). 2012(03)
[6]清涼峰旅游區(qū)鳥類多樣性及季節(jié)變動(dòng)[J]. 陳靜,王玉軍,武丙琳,魯慶彬. 南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2012(03)
[7]扇脈杓蘭AFLP反應(yīng)體系的建立[J]. 李全健,王彩霞,田敏,李翠新. 湖南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(01)
[8]安徽清涼峰國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)保護(hù)管理現(xiàn)狀與發(fā)展對(duì)策[J]. 方國(guó)富,邵江山,邵小平. 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2011(S2)
[9]蘭花的傳粉與保護(hù)研究[J]. 李鵬,鄭桂靈,周峰. 北方園藝. 2009(05)
[10]中國(guó)蘭科植物新資料[J]. 胡愛群,葉德平,邢福武. 植物研究. 2008(02)
博士論文
[1]蘭科菌根真菌多樣性研究及其對(duì)蘭科植物的影響[D]. 楊前宇.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2018
[2]貴州特色藥用蘭科植物杜鵑蘭和獨(dú)蒜蘭共生真菌研究與應(yīng)用[D]. 朱國(guó)勝.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[3]獨(dú)花蘭和扇脈杓蘭的傳粉生態(tài)學(xué)[D]. 孫海芹.中國(guó)科學(xué)院研究生院(植物研究所) 2005
碩士論文
[1]中國(guó)齒唇蘭屬(Odontochilus)及其近緣屬植物的系統(tǒng)分類研究[D]. 劉嚴(yán)文.華東師范大學(xué) 2018
[2]天目山常綠落葉闊葉混交林碳水通量及能量通量的特征研究[D]. 孫恒.浙江農(nóng)林大學(xué) 2017
[3]幾種蘭花根際土壤真菌及根內(nèi)生真菌研究[D]. 田佳妮.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2015
[4]東亞特有珍稀蘭科植物扇脈杓蘭的遺傳多樣性與譜系地理學(xué)研究[D]. 李星霖.華東師范大學(xué) 2014
[5]扇脈杓蘭的生殖生物學(xué)研究[D]. 劉芬.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2012
[6]扇脈杓蘭(Cypripedium japonicum Thunb.) 菌根顯微結(jié)構(gòu)與內(nèi)生真菌多樣性[D]. 喬元寶.西南大學(xué) 2011
[7]四川黃龍溝優(yōu)勢(shì)蘭科植物菌根真菌多樣性研究[D]. 侯天文.北京林業(yè)大學(xué) 2010
[8]蘭科菌根真菌與植物專一性關(guān)系研究[D]. 武靜宇.河北大學(xué) 2009
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