水稻劍葉維管束性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時間:2021-05-18 19:31
水稻的光合作用受到葉片維管束系統(tǒng)的影響,在此過程中,細胞分化模式對于維持葉片光合作用起著重要的作用。葉片維管束和葉肉面積與水稻產(chǎn)量密切相關(guān)。但目前對水稻葉片維管束相關(guān)性狀的遺傳分析仍知之甚少。本研究利用386份水稻種質(zhì)資源為試材,在總?cè)后w、秈稻亞群和粳稻亞群對水稻葉片大、小維管束數(shù)和面積,維管束間的距離,以及維管束間葉肉面積進行兩年的全基因組關(guān)聯(lián)分析。檢測影響水稻葉片維管束相關(guān)性狀的主效QTL,將重要QTL區(qū)間內(nèi)的所有基因的SNP進行單倍型分析,結(jié)合生物信息學(xué)分析,預(yù)測可能的候選基因。研究結(jié)果具體如下:1.水稻386份種質(zhì)資源在劍葉維管束數(shù)量和面積,維管束間的距離,以及維管束間葉肉面積上表現(xiàn)廣泛的遺傳變異。這13個葉片維管束相關(guān)性狀在水稻秈粳亞種間均存在顯著的差異。大、小維管束面積與維管束間葉肉面積呈極顯著的正相關(guān)。2.本研究利用3K RGP水稻重測序數(shù)據(jù)庫中的4.8M SNP基因型數(shù)據(jù),在總?cè)后w、秈稻亞群和粳稻亞群分別檢測到71、50和44個影響水稻葉片維管束性狀的QTL。其中70個QTL在兩年同時檢測到,5個QTL在總?cè)后w和秈稻亞群同時檢測到,26個QTL在總?cè)后w和粳稻亞群同時檢測...
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略詞表
1 前言
1.1 水稻葉片維管束相關(guān)性狀的構(gòu)造和功能
1.2 水稻葉片維管束相關(guān)性狀的發(fā)育調(diào)控機制
1.2.1 細胞機制
1.2.2 分子機制
1.2.3 植物激素的影響
1.3 全基因組關(guān)聯(lián)分析研究進展
1.3.1 全基因組關(guān)聯(lián)分析概述
1.3.2 全基因組關(guān)聯(lián)分析在水稻中的應(yīng)用
1.4 試驗的目的與意義
2 材料與方法
2.1 試驗材料
2.2 試驗設(shè)計
2.3 表型鑒定
2.4 表型數(shù)據(jù)分析
2.5 基因型數(shù)據(jù)分析
2.6 全基因組關(guān)聯(lián)分析
2.7 候選基因的單倍型分析
3 結(jié)果分析
3.1 葉片維管束性狀的表型觀察
3.1.1 表型變異
3.1.2 相關(guān)性分析
3.2 SNP的基因型與群體結(jié)構(gòu)分析
3.2.1 基因型分析
3.2.2 群體結(jié)構(gòu)分析
3.3 全基因組關(guān)聯(lián)分析
3.4 候選基因分析
3.5 QTL表達的一因多效性
4 討論
4.1 候選基因分析
4.2 水稻產(chǎn)量性狀的育種應(yīng)用
5 結(jié)論
參考文獻
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]油菜素內(nèi)酯調(diào)控植物生長發(fā)育及產(chǎn)量品質(zhì)研究進展[J]. 肖瑞雪,郭麗麗,賈琦石,郭大龍,侯小改. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(10)
[2]植物B3轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)和功能[J]. 劉穎慧,董志平. 分子植物育種. 2017(05)
[3]水稻復(fù)雜性狀研究的新途徑:水稻重要農(nóng)藝性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 侯青青,司麗珍,黃學(xué)輝,韓斌. 生命科學(xué). 2016(10)
[4]水稻ABC1基因家族的鑒定及在非生物脅迫下的表達分析[J]. 高清松,張丹,徐亮,徐辰武. 中國水稻科學(xué). 2011(01)
[5]一個水稻大葉角度突變體lla的遺傳分析及基因克隆[J]. 汪得凱,張紅心,胡國成,付亞萍,斯華敏,孫宗修. 科學(xué)通報. 2005(04)
[6]水稻理想株形育種的理論和方法初論[J]. 楊守仁,張龍步,王進民. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 1984(03)
博士論文
[1]水稻苗期稻瘟病抗性的全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 王彩紅.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[2]水稻卷葉突變體的細胞形成機制以及OUL1基因的克隆和功能研究[D]. 鄒良平.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012
碩士論文
[1]水稻窄卷葉突變體nrl4的遺傳分析與基因定位[D]. 梁容.浙江大學(xué) 2017
[2]水稻矮化寬葉突變體dw1的鑒定與功能分析[D]. 廖紅香.西南大學(xué) 2016
本文編號:3194360
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略詞表
1 前言
1.1 水稻葉片維管束相關(guān)性狀的構(gòu)造和功能
1.2 水稻葉片維管束相關(guān)性狀的發(fā)育調(diào)控機制
1.2.1 細胞機制
1.2.2 分子機制
1.2.3 植物激素的影響
1.3 全基因組關(guān)聯(lián)分析研究進展
1.3.1 全基因組關(guān)聯(lián)分析概述
1.3.2 全基因組關(guān)聯(lián)分析在水稻中的應(yīng)用
1.4 試驗的目的與意義
2 材料與方法
2.1 試驗材料
2.2 試驗設(shè)計
2.3 表型鑒定
2.4 表型數(shù)據(jù)分析
2.5 基因型數(shù)據(jù)分析
2.6 全基因組關(guān)聯(lián)分析
2.7 候選基因的單倍型分析
3 結(jié)果分析
3.1 葉片維管束性狀的表型觀察
3.1.1 表型變異
3.1.2 相關(guān)性分析
3.2 SNP的基因型與群體結(jié)構(gòu)分析
3.2.1 基因型分析
3.2.2 群體結(jié)構(gòu)分析
3.3 全基因組關(guān)聯(lián)分析
3.4 候選基因分析
3.5 QTL表達的一因多效性
4 討論
4.1 候選基因分析
4.2 水稻產(chǎn)量性狀的育種應(yīng)用
5 結(jié)論
參考文獻
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]油菜素內(nèi)酯調(diào)控植物生長發(fā)育及產(chǎn)量品質(zhì)研究進展[J]. 肖瑞雪,郭麗麗,賈琦石,郭大龍,侯小改. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(10)
[2]植物B3轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)和功能[J]. 劉穎慧,董志平. 分子植物育種. 2017(05)
[3]水稻復(fù)雜性狀研究的新途徑:水稻重要農(nóng)藝性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 侯青青,司麗珍,黃學(xué)輝,韓斌. 生命科學(xué). 2016(10)
[4]水稻ABC1基因家族的鑒定及在非生物脅迫下的表達分析[J]. 高清松,張丹,徐亮,徐辰武. 中國水稻科學(xué). 2011(01)
[5]一個水稻大葉角度突變體lla的遺傳分析及基因克隆[J]. 汪得凱,張紅心,胡國成,付亞萍,斯華敏,孫宗修. 科學(xué)通報. 2005(04)
[6]水稻理想株形育種的理論和方法初論[J]. 楊守仁,張龍步,王進民. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 1984(03)
博士論文
[1]水稻苗期稻瘟病抗性的全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 王彩紅.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[2]水稻卷葉突變體的細胞形成機制以及OUL1基因的克隆和功能研究[D]. 鄒良平.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012
碩士論文
[1]水稻窄卷葉突變體nrl4的遺傳分析與基因定位[D]. 梁容.浙江大學(xué) 2017
[2]水稻矮化寬葉突變體dw1的鑒定與功能分析[D]. 廖紅香.西南大學(xué) 2016
本文編號:3194360
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