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玉米大斑病菌交配型分離頻率和突變體轉(zhuǎn)錄組分析

發(fā)布時(shí)間:2021-04-09 08:33
  玉米大斑病是玉米上的重要葉部病害,其病原菌為大斑剛毛座腔菌(Setosphaeria turcica),病菌為異宗配合真菌,其具有StMAT1-1和StMAT1-2交配型基因。玉米大斑病菌基因組中僅帶有StMAT1-1基因的菌株被定名為A交配型菌株,僅含有StMAT1-2基因的菌株被定名為a交配型菌株,兩個(gè)交配型基因都有的菌株被定名為Aa菌株。前期研究發(fā)現(xiàn),不同年份中我國(guó)不同省份的玉米大斑病菌交配型組成規(guī)律難以掌握,并且缺失了交配型基因的玉米大斑病菌失去了有性生殖的能力,同時(shí)無(wú)性繁殖能力下降,表明交配型基因?qū)τ衩状蟀卟【挠行院蜔o(wú)性生殖具有重要意義。本文在前期研究基礎(chǔ)上,首先系統(tǒng)分析了 2016-2018年我國(guó)不同玉米產(chǎn)區(qū)玉米大斑病菌交配型的組成情況,對(duì)不同年份各省份的交配型組成有一個(gè)初步的認(rèn)識(shí),對(duì)野生型菌株、StMAT1-1基因缺失突變體ΔStmat1-1和StMA T1-2基因缺失突變體ΔStmat1-2進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,通過(guò)生物信息學(xué)分析方法進(jìn)行GO和KEGG富集分析,并篩選出與有性生殖相關(guān)的差異表達(dá)基因,為玉米大斑病菌有性生殖過(guò)程中交配型基因調(diào)控機(jī)制研究提供了前期基礎(chǔ)。主要結(jié)果如... 

【文章來(lái)源】:河北農(nóng)業(yè)大學(xué)河北省

【文章頁(yè)數(shù)】:44 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

玉米大斑病菌交配型分離頻率和突變體轉(zhuǎn)錄組分析


圖3樣本間表達(dá)基因Venn分析??16??

富集,基因,跨膜轉(zhuǎn)運(yùn),輔因子


component?of?membrane)和膜的固有成分(intrinsic??component?of?membrane)與細(xì)胞膜成分相關(guān)的富集顯著。在分子功能(Molecular??Function)分類(lèi)中,跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白活性(transmembrane?transporter?activity)、轉(zhuǎn)運(yùn)蛋??白活性(transporter?activity)、輔因子結(jié)合(cofactor?binding)、氧化還原酶活性??(oxidoreductase?activity)富集顯著(圖8)〇??(30?enrichment?ana}ysis(WT—\/s_StIV1AT1_G)??翻cc??m?ivjf??m?bp??alpha-amino?a-cKl?metaboHc?p-rocsss??-cciiular?amino?aci<3?meta&olic?process??organic?aciti?process?難靈警??lnt?Qral?component?of?membrane??intrinsic?compooent?of?membrane??part??trj>osm?mt>ranA?transporter?activity??tiansportai?activity??colactor?bindino??oxiUureductase?activity??tetrapyrrote?binding??rtttmfi?r>indinq??catalytic?activity??c?en^yt!>e?trinding??transition?metal?ion?transmem£>ran??

富集,基因,分支


?activity??Mtmpyrrol*?biodmg?|||??won?K>n?binding?|||??h*m??btnd丨n〇?H??dio?y〇?nMiM?ackvtty?m??copp?r?ion?Irantmambran*?Irantporlar?acVvity??FAO?t>ind??t〇?WM??hyUrolaM??r.?v?ly?acllno?on?〇lyco*yl?bonds??0.00?r?e?JS3?5^20?Tos??4〇fi1<KFOR)??圖9基因集GO富集分析??Fig.9?GO?enrichment?analysis??3.3.8差異表達(dá)基因KEGG功能富集分析??對(duì)WT-MAT1兩個(gè)樣本中差異表達(dá)基因進(jìn)行富集,只對(duì)富集程度前丨的進(jìn)h??W示。分力兩人分支,在代謝分支中P-丙氨酸代謝(beta-Alaninemetabolism)??程度?MA、乙?_?船類(lèi)代謝(Ether?lipid?metabolism?)、胳?M?酸代謝(Tyrosine??metabolism?)、戊糖和葡萄糖酸酸的相互轉(zhuǎn)化(Pentose?and?glucuronate??interconversions)甘氧酸絲氣酸和蘇氧酸的代謝(Glycine,?serine?and?threonine??metabolism)丨丨卜院代謝(Methane?metabolism)和M素代謝(Nitrogen?metabolism)??部tfiM著詁犯。在屮物體系統(tǒng)分支中,C型凝集素受體信號(hào)通路被富集,推測(cè)MAH??基因?qū)τ衩状蟀卟【顒?dòng)的物質(zhì)代謝和信號(hào)途徑有很大影響(圖10)。??/丨付WT_vs_?

【參考文獻(xiàn)】:
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碩士論文
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[4]中國(guó)玉米大斑病菌的遺傳多樣性及交配型組成分析[D]. 郭麗婕.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
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[6]核盤(pán)菌交配型相關(guān)基因mat1-1的功能驗(yàn)證[D]. 安樂(lè).吉林大學(xué) 2007



本文編號(hào):3127294

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