煙草次生代謝物合成基因簇的鑒定與分析
發(fā)布時間:2021-03-15 22:08
煙草屬植物普通煙草(Nicotiana tabacum L.)是一種重要的經(jīng)濟作物。普通煙草葉片表面能分泌產(chǎn)生豐富的次生代謝產(chǎn)物,在植物的防御反應(yīng)中扮演著重要角色,尤其是萜類植物抗毒素,因此煙草常被作為次生代謝物與生物脅迫響應(yīng)關(guān)系的研究對象。植物萜類次生代謝物的合成通常由染色體某個區(qū)間內(nèi)彼此功能相關(guān)的非同源基因進行調(diào)控,這種基因集合也被成為基因簇,區(qū)間內(nèi)所有代謝基因構(gòu)成一個完整的代謝途徑,有利于植物高效、穩(wěn)定地合成次生代謝物。植物全基因組基因簇預(yù)測是挖掘基因組重要信息的有效手段,而目前已開發(fā)的預(yù)測方法較為局限,未能充分利用轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)、代謝通路數(shù)據(jù)庫等信息進行次生代謝基因簇鑒定,從基因簇的角度解析植物基因組的特征。為此,本研究在前人的基礎(chǔ)上,以普通煙草栽培品種K326為研究對象,搭建了適用于復(fù)雜基因組作物的全基因組基因簇研究方案,并對普通煙草的次生代謝基因簇進行鑒定與分析,取得了以下結(jié)果:(1)搭建了一套適用于普通煙草基因組的次生代謝物合成基因簇分析流程,為今后應(yīng)用于其他復(fù)雜基因組提供參考(2)在普通煙草基因組中預(yù)測到1,181個基因簇,包含參與次生代謝物合成的116個,其中34個參...
【文章來源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:78 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
普通煙草中幾種次生代謝物的化學(xué)結(jié)構(gòu)
植物基因簇示意圖(以玉米DIMBOA合成基因簇為例)
已報道的植物次生代謝基因簇(部分)[21,33]
【參考文獻】:
期刊論文
[1]我國烤煙品種的發(fā)展現(xiàn)狀及對策展望[J]. 馬文廣,周義和,劉相甫,張宇曉. 中國煙草學(xué)報. 2018(01)
[2]中國煙草種質(zhì)資源創(chuàng)新研究進展[J]. 王國平,周東潔,牛永志,常愛霞,肖江海,鄭昀曄. 種子. 2017(12)
[3]植物次生代謝基因簇研究進展[J]. 呂海舟,劉琬菁,何柳,徐志超,羅紅梅. 植物科學(xué)學(xué)報. 2017(04)
[4]基因共表達網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建及分析方法研究綜述[J]. 汪濤,蔣慶華,彭佳杰,王亞東. 智能計算機與應(yīng)用. 2014(06)
[5]煙草重要基因篇:1.煙草抗病相關(guān)基因[J]. 龔達平. 中國煙草科學(xué). 2014(01)
[6]我國主要烤煙品種的親源系譜分析及育種工作建議[J]. 常愛霞,賈興華,馮全福,張玉,程立銳,楊愛國,羅成剛. 中國煙草科學(xué). 2013(01)
[7]中國烤煙種植品種現(xiàn)狀分析與展望[J]. 徐安傳,胡巍耀,李佛琳,鄧國賓,張曉龍,唐麗,胡小曼. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)). 2011(S2)
本文編號:3084894
【文章來源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:78 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
普通煙草中幾種次生代謝物的化學(xué)結(jié)構(gòu)
植物基因簇示意圖(以玉米DIMBOA合成基因簇為例)
已報道的植物次生代謝基因簇(部分)[21,33]
【參考文獻】:
期刊論文
[1]我國烤煙品種的發(fā)展現(xiàn)狀及對策展望[J]. 馬文廣,周義和,劉相甫,張宇曉. 中國煙草學(xué)報. 2018(01)
[2]中國煙草種質(zhì)資源創(chuàng)新研究進展[J]. 王國平,周東潔,牛永志,常愛霞,肖江海,鄭昀曄. 種子. 2017(12)
[3]植物次生代謝基因簇研究進展[J]. 呂海舟,劉琬菁,何柳,徐志超,羅紅梅. 植物科學(xué)學(xué)報. 2017(04)
[4]基因共表達網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建及分析方法研究綜述[J]. 汪濤,蔣慶華,彭佳杰,王亞東. 智能計算機與應(yīng)用. 2014(06)
[5]煙草重要基因篇:1.煙草抗病相關(guān)基因[J]. 龔達平. 中國煙草科學(xué). 2014(01)
[6]我國主要烤煙品種的親源系譜分析及育種工作建議[J]. 常愛霞,賈興華,馮全福,張玉,程立銳,楊愛國,羅成剛. 中國煙草科學(xué). 2013(01)
[7]中國烤煙種植品種現(xiàn)狀分析與展望[J]. 徐安傳,胡巍耀,李佛琳,鄧國賓,張曉龍,唐麗,胡小曼. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)). 2011(S2)
本文編號:3084894
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