兩個(gè)水稻黃綠葉基因的圖位克隆
發(fā)布時(shí)間:2017-04-11 14:22
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【摘要】:實(shí)驗(yàn)室在中恢8015經(jīng)60Co-γ輻射獲得的突變體材料庫中發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)黃綠葉突變體w390和g160,本文對這兩個(gè)突變體進(jìn)行了形態(tài)學(xué)鑒定、光合特性測定、圖位克隆等方面的研究,為進(jìn)一步闡明水稻葉色的分子機(jī)理提供了基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:w390在全生育期均呈黃綠色;葉片中檢測不到葉綠素b的存在,葉綠素a和類胡蘿卜素的含量較野生型分別降低了50.6%和44.8%;透射電鏡結(jié)果顯示,突變體中類囊體數(shù)量明顯減少,基粒垛疊方向異常。農(nóng)藝性狀調(diào)查結(jié)果顯示,突變體的株高、單株有效穗數(shù)、每穗總粒數(shù)和每穗實(shí)粒數(shù)較野生型分別降低了12.0%、22.3%、18.5%和27.6%。采用突變體與粳稻日本晴雜交構(gòu)建的F2群體進(jìn)行遺傳分析,結(jié)果表明該突變性狀受一對隱性核基因控制(χ2=0.57χ20.05=3.84,P=0.4494)。利用該群體中的黃綠葉隱性單株將突變基因定位至水稻第10染色體上長臂約71.8-kb的基因組區(qū)域內(nèi)。序列比對發(fā)現(xiàn),位于該區(qū)域內(nèi)的Os CAO1在第8外顯子發(fā)生了2個(gè)單堿基突變,導(dǎo)致第394和396位的亮氨酸和甘氨酸分別突變?yōu)榻M氨酸和谷氨酸,說明w390是Os CAO1的一個(gè)新的功能喪失型等位突變體。利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測野生型和突變體中15個(gè)葉色相關(guān)基因的表達(dá),結(jié)果顯示,僅類胡蘿卜素合成途徑關(guān)鍵基因Os CRTIS在野生型與突變體中存在臨界差異(P=0.0367),說明Os CAO1的突變并未在轉(zhuǎn)錄水平上改變?nèi)~色相關(guān)基因的表達(dá)。g160也是一個(gè)全生育期葉片均呈黃綠色的突變體。與野生型相比,突變體的總光合色素、葉綠素a和葉綠素b的含量分別降低了38.6%、44.7%和41.7%,而類胡蘿卜素未發(fā)生顯著變化。突變體的凈光合速率、最大量子產(chǎn)量、實(shí)際量子產(chǎn)量和相對電子傳遞率也分別比野生型降低了56.3%、37.7%、60.0%和55.5%。采用突變體與粳稻02428雜交構(gòu)建的F2群體進(jìn)行遺傳分析,表明該突變性狀受一對隱性核基因控制(χ2=0.21χ20.05=3.84,P=0.5960)。利用該F2群體及其衍生的F3群體將突變基因定位至水稻第7染色體上長臂約121.5-kb的區(qū)域內(nèi)。該區(qū)域未見葉色相關(guān)基因的報(bào)道,所以該突變基因是一個(gè)控制水稻葉色的新基因,我們將其命名為g160。該區(qū)間共包含24個(gè)ORFs,序列對比發(fā)現(xiàn)突變體中基因ORF23的第五外顯子上存在一個(gè)8-bp的缺失,導(dǎo)致移碼突變,于是我們將其作為g160的候選基因。針對ORF23構(gòu)建了互補(bǔ)、過表達(dá)和干涉轉(zhuǎn)基因T0植株,為該基因的功能驗(yàn)證提供基礎(chǔ)。
【關(guān)鍵詞】:基因 黃綠葉 水稻 突變體 圖位克隆
【學(xué)位授予單位】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:S511;Q943.2
【目錄】:
- 摘要5-6
- Abstract6-11
- 第一章 引言11-18
- 1.1 水稻葉色突變體的來源和類型11
- 1.2 水稻葉色基因的克隆11-17
- 1.2.1 葉綠體分化基因的定位和克隆12-13
- 1.2.2 葉綠素合成和降解基因克隆13-16
- 1.2.3 其他葉色相關(guān)的基因16-17
- 1.3 本文的意義17-18
- 第二章 水稻黃綠葉基因w390的圖位克隆18-28
- 2.1 材料與方法18-20
- 2.1.1 水稻材料18
- 2.1.2 表型考察與農(nóng)藝性狀考察18
- 2.1.3 光和色素含量測定18
- 2.1.4 葉綠體電鏡觀察18-19
- 2.1.5 DNA提取19
- 2.1.6 群體構(gòu)建19
- 2.1.7 PCR反應(yīng)體系及程序19
- 2.1.8 瓊脂糖凝膠電泳19
- 2.1.9 候選基因分析19-20
- 2.1.10 三維結(jié)構(gòu)預(yù)測20
- 2.1.11 RNA提取20
- 2.1.12 cDNA反轉(zhuǎn)錄20
- 2.1.13 實(shí)時(shí)熒光定量PCR20
- 2.2 結(jié)果與分析20-26
- 2.2.1 突變體的生理特征和主要農(nóng)藝性狀20-22
- 2.2.2 電鏡觀察22-23
- 2.2.3 突變體基因的圖位克隆23
- 2.2.4 基因預(yù)測23-24
- 2.2.5 野生型和突變體CAO1蛋白的三維結(jié)構(gòu)預(yù)測24-25
- 2.2.6 葉色相關(guān)基因的表達(dá)分析25-26
- 2.3 討論26-28
- 第三章 一個(gè)水稻新黃綠葉突變體基因g160的圖位克隆28-35
- 3.1 材料與方法28-30
- 3.1.1 水稻材料28
- 3.1.2 表型考察28
- 3.1.3 光和色素含量測定28
- 3.1.4 光合速率測定28
- 3.1.5 葉綠素?zé)晒鉁y定28-29
- 3.1.6 葉綠體電鏡觀察29
- 3.1.7 群體構(gòu)建與基因定位29
- 3.1.8 候選基因分析及序列比對29
- 3.1.9 RNA提取和反轉(zhuǎn)錄29-30
- 3.1.10 目的片段和載體連接30
- 3.1.11 載體構(gòu)建30
- 3.2 結(jié)果與分析30-34
- 3.2.1 表型與光合色素含量30-31
- 3.2.2 光合作用特性指標(biāo)測定31-32
- 3.2.3 突變基因的定位32
- 3.2.4 候選基因分析32-33
- 3.2.5 獲得轉(zhuǎn)基因T0植株33-34
- 3.3 討論34-35
- 第四章 結(jié)論35-36
- 4.1. w390是OsCAO1的一個(gè)新等位基因35
- 4.2. g160是一個(gè)控制水稻葉色的新基因35-36
- 參考文獻(xiàn)36-41
- 致謝41-42
- 作者簡歷42
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號:299291
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