本文關(guān)鍵詞：四種巨蠣屬牡蠣群體遺傳學研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：海洋貝類現(xiàn)今的遺傳格局是各種內(nèi)外因素在不同時空尺度綜合作用的結(jié)果,研究海洋貝類群體遺傳學有助于揭示貝類的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)現(xiàn)狀。巨蠣屬(Crassostrea)牡蠣是我國沿海的重要經(jīng)濟貝類,本研究以四個主要的經(jīng)濟種類為研究對象,采用mtDNA COI序列分析其自然群體的遺傳結(jié)構(gòu)和種群動態(tài),以期為我國牡蠣資源的保護和可持續(xù)利用提供科學依據(jù)。主要研究結(jié)果如下：1.長牡蠣群體遺傳結(jié)構(gòu)分析利用mtCOI序列分析了分布在東亞沿海12個長牡蠣(Crassostrea gigas)群體的228個樣品,結(jié)果檢測到長牡蠣群體具有中等水平的單倍型多樣度和低水平的核苷酸多樣度；群體間不存在顯著的遺傳結(jié)構(gòu),僅個別中國群體和日本群體間出現(xiàn)低程度的遺傳分化,表明群體間存在頻繁的基因交流；種群歷史動態(tài)分析表明大約5.1～4.2萬年前,長牡蠣經(jīng)歷了群體擴張事件。結(jié)果強調(diào)了棲息地的重新殖化(第四紀晚期冰期后的群體擴張)和當前基因流(幼體擴散、海流推動)對東亞沿海長牡蠣現(xiàn)今的遺傳格局有重要作用,表明所研究的牡蠣均起源于冰期的東海避難所,同屬“東海譜系”。2.葡萄牙牡蠣群體遺傳結(jié)構(gòu)分析對浙閩沿海5個葡萄牙牡蠣(C.angulata)自然群體的遺傳結(jié)構(gòu)及其種群歷史進行mtCOI序列分析,結(jié)果表明,葡萄牙牡蠣群體的遺傳多樣性處于較高水平；群體間沒有表現(xiàn)出明顯的群體遺傳結(jié)構(gòu),但寧德群體與其他群體間存在顯著的低程度遺傳差異；葡萄牙牡蠣在更新世第三次間冰期時經(jīng)歷了群體擴張。研究表明,對于成體固著生活的葡萄牙牡蠣來說,較長的浮游期以及幼體在海流作用下的自然擴散很可能是群體沒有顯著遺傳結(jié)構(gòu)的原因,寧德群體的分化可能歸因于其對“封閉”的地理位置(外圍存在多種海灣和島嶼)。3.有名巨牡蠣群體遺傳結(jié)構(gòu)分析采用mtCOI標記對西北太平洋沿海10個有名巨牡蠣(C. ariakensis)的230個個體進行研究,在種內(nèi)檢測到了2個顯著分化的系統(tǒng)發(fā)育分支,分布對應北方和南方群體；所有群體存在顯著的IBD模式。推測源自長江的巨大淡水流很可能是阻礙其幼體擴散的天然屏障,但其確切的屏障效應還有待進一步研究；就南海譜系而言,未檢測到雷州半島的阻隔效應,推測該區(qū)域的夏季上升流和頻繁的苗種異地交流可能對其遺傳均質(zhì)性起到一定作用�？紤]到兩個支系存在較大的遺傳隔離,建議在今后的資源利用和管理中,應注意將兩個支系進行區(qū)分,以免造成人為的基因滲透以及進化支系和遺傳多樣性的喪失。4.香港巨牡蠣群體遺傳結(jié)構(gòu)分析利用mtCOI標記對分布在長江以南沿海的7個香港巨牡蠣(C. hongkongensis)群體進行分析,結(jié)果表明,無論在不同海區(qū)間還是在雷州半島兩側(cè),均未檢測到顯著的遺傳異質(zhì)性,僅部分群體間存在顯著的低水平遺傳差異：群體動態(tài)分析顯示香港巨牡蠣群體經(jīng)歷了近期群體擴張事件,時間約在4.0到4.8萬年前。推測頻繁的苗種異地交流是造成其遺傳均質(zhì)性的主要影響因素,同時近岸的夏季上升流和沿岸流也起了重要的作用。
【關(guān)鍵詞】：巨蠣屬 群體遺傳結(jié)構(gòu) 遺傳多樣性 歷史冰期 線粒體COI 海流 人類活動
【學位授予單位】：中國海洋大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2015
【分類號】：S917.4
【目錄】：

• 摘要5-7
• ABSTRACT7-15
• 第一章 綜述15-35
• 1 群體遺傳學概述15-19
• 1.1 相關(guān)學科介紹15-16
• 1.2 主要研究內(nèi)容16-19
• 1.2.1 遺傳多樣性水平16-17
• 1.2.2 遺傳結(jié)構(gòu)及其影響因素17-18
• 1.2.3 基因的適應性進化或中性進化18-19
• 1.3 學科特點及應用19
• 2 海洋貝類群體遺傳學研究現(xiàn)狀19-33
• 2.1 影響海洋貝類群體遺傳結(jié)構(gòu)與系統(tǒng)地理格局的因素19-23
• 2.1.1 外在因素20-23
• 2.1.2 海洋貝類自身的生態(tài)特征23
• 2.2 海洋貝類群體遺傳學的研究現(xiàn)狀23-33
• 2.2.1 西北太平洋海區(qū)的研究現(xiàn)狀24-25
• 2.2.2 世界其他熱點海區(qū)的研究現(xiàn)狀25-33
• 3 巨蠣屬牡蠣33-35
• 3.1 長牡蠣33
• 3.2 葡萄牙牡蠣33-34
• 3.3 有名巨牡蠣34
• 3.4 香港巨牡蠣34-35
• 第二章 長牡蠣和葡萄牙牡蠣群體遺傳學研究35-65
• 第一節(jié) 長牡蠣群體遺傳結(jié)構(gòu)分析35-53
• 0 引言35-37
• 1 材料與方法37-45
• 1.1 樣品采集37-38
• 1.2 DNA的分離、物種鑒定和序列測定38-41
• 1.3 數(shù)據(jù)處理和分析41-45
• 1.3.1 序列分析41
• 1.3.2 群體遺傳結(jié)構(gòu)41
• 1.3.3 群體歷史動態(tài)分析41-42
• 1.3.4 系統(tǒng)發(fā)生分析42-45
• 2 實驗結(jié)果45-48
• 2.1 序列多樣性分析45
• 2.2 群體遺傳結(jié)構(gòu)45-47
• 2.3 群體歷史動態(tài)47-48
• 2.4 系統(tǒng)發(fā)生分析48
• 3 討論48-53
• 3.1 群體遺傳多樣性48-49
• 3.2 遺傳均質(zhì)性和群體結(jié)構(gòu)的可能解釋49-51
• 3.3 系統(tǒng)發(fā)生分析51-52
• 3.4 種群歷史動態(tài)52-53
• 第二節(jié) 葡萄牙牡蠣群體遺傳結(jié)構(gòu)分析53-65
• 0 引言53-54
• 1 材料與方法54-55
• 1.1 樣品的采集與保存54
• 1.2 DNA的分離、物種鑒定和序列測定54
• 1.3 數(shù)據(jù)處理和分析54-55
• 1.3.1 序列分析55
• 1.3.2 群體遺傳結(jié)構(gòu)和系統(tǒng)發(fā)生分析55
• 1.3.3 群體歷史動態(tài)分析55
• 2 結(jié)果與分析55-61
• 2.1 COI序列的多樣性分析55-58
• 2.2 葡萄牙牡蠣群體的遺傳結(jié)構(gòu)特征58-61
• 2.3 群體歷史動態(tài)分析61
• 3 討論61-65
• 3.1 遺傳多樣性61-62
• 3.2 種群遺傳結(jié)構(gòu)62-63
• 3.2.1 幼體自然擴散和海流作用62-63
• 3.2.2 海灣島嶼對種群分化的影響63
• 3.3 種群動態(tài)63-65
• 第三章 有名巨牡蠣和香港巨牡蠣群體遺傳學研究65-86
• 第一節(jié) 有名巨牡蠣群體遺傳結(jié)構(gòu)分析65-78
• 0 引言65
• 1 材料與方法65-69
• 1.1 樣品采集65-66
• 1.2 DNA的分離、物種鑒定和序列測定66-68
• 1.3 數(shù)據(jù)分析68-69
• 2 實驗結(jié)果69-74
• 2.1 序列多樣性69-71
• 2.2 群體遺傳結(jié)構(gòu)與系統(tǒng)發(fā)生分析71-74
• 2.3 種群歷史動態(tài)74
• 3 討論74-78
• 3.1 群體間的遺傳結(jié)構(gòu)模式74-76
• 3.1.1 長江沖淡水屏障效應的探討74-76
• 3.1.2 “半島效應”、海流和人類水產(chǎn)活動的探討76
• 3.2 種群歷史動態(tài)76-78
• 第二節(jié) 香港巨牡蠣群體遺傳結(jié)構(gòu)分析78-86
• 0 引言78
• 1 材料與方法78-80
• 1.1 樣品采集78-80
• 1.2 數(shù)據(jù)分析80
• 1.2.1 序列變異分析80
• 1.2.2 群體遺傳結(jié)構(gòu)80
• 1.2.3 群體歷史動態(tài)和系統(tǒng)發(fā)生分析80
• 2 實驗結(jié)果80-84
• 2.1 序列變異及單倍型在群體中的分布80-82
• 2.2 地理群體的遺傳結(jié)構(gòu)82
• 2.3 種群歷史動態(tài)和系統(tǒng)發(fā)生分析82-84
• 3 討論84-86
• 3.1 群體遺傳多樣性分析84
• 3.2 遺傳結(jié)構(gòu)和群體歷史動態(tài)84-86
• 參考文獻86-101
• 致謝101-102
• 個人簡歷102
• 在學期間發(fā)表的學術(shù)論文102

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