苦蕎種質(zhì)資源產(chǎn)量性狀和籽粒黃酮含量與SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-01-06 02:02
以230份苦蕎種質(zhì)資源為材料,在三個(gè)播種環(huán)境中調(diào)查了籽粒黃酮含量、初花期、盛花期、株高、主莖分枝數(shù)、單株粒數(shù)、單株粒重、百粒質(zhì)量、籽粒長、籽粒寬、籽粒長寬比、籽粒面積、籽粒直徑、籽粒周長和籽粒產(chǎn)量等15個(gè)性狀,并分析了這15個(gè)性狀的遺傳變異,研究了農(nóng)藝性狀對籽粒黃酮含量和籽粒產(chǎn)量的影響,篩選了籽粒黃酮含量和籽粒產(chǎn)量表現(xiàn)優(yōu)異的苦蕎種質(zhì),為高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)苦蕎的選育推薦基礎(chǔ)材料。利用59對SSR引物分析了苦蕎種質(zhì)的遺傳多樣性、群體結(jié)構(gòu)和連鎖不平衡(LD)狀況等,并且對調(diào)查性狀進(jìn)了關(guān)聯(lián)分析。所得結(jié)果如下:1.苦蕎種質(zhì)籽粒黃酮含量和產(chǎn)量性狀的變異分析除百粒質(zhì)量、籽粒周長和籽粒寬外,播種環(huán)境對其他12個(gè)性狀都產(chǎn)生了極其顯著影響。籽粒黃酮含量在2018S、2018A和2019A三個(gè)環(huán)境中的變異范圍基本保持一致,分別是1.37%2.84%、1.12%2.81%和1.08%2.83%,變異系數(shù)分別為12.06%、13.27%和14.33%,為中等變異程度,說明苦蕎種質(zhì)的籽粒黃酮含量受環(huán)境變化的影響較小,比較穩(wěn)定,有一定的改良空間。在三個(gè)環(huán)境中,...
【文章來源】:貴州師范大學(xué)貴州省
【文章頁數(shù)】:137 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
基于候選基因的關(guān)聯(lián)分析
貴州師范大學(xué)碩士學(xué)位論文18圖1基于全基因組的關(guān)聯(lián)分析Fig.1Associationanalysisbasedonwholegenome(2)候選基因關(guān)聯(lián)分析基于候選基因的關(guān)聯(lián)分析需要對目標(biāo)性狀可能的基因有一定的預(yù)測和篩選,并對候選基因進(jìn)行測序分析或者SNP檢測,利用統(tǒng)計(jì)學(xué)的方法挖掘基因與性狀之間的關(guān)系,定位與性狀緊密連鎖的基因,并篩選功能等位變異(趙惠等,2018;王瑞果,2013;段繼鳳,2013)。候選基因關(guān)聯(lián)分析需要對目標(biāo)性狀的背景知識有所了解,并有基因表達(dá)、突變體或者基因功能、代謝途徑的相關(guān)證據(jù)確定的候選基因。此方法已成功應(yīng)用于大豆(Tianetal.,2010)、水稻(Tianetal.,2009)和玉米(Yanetal.,2011)等作物的數(shù)量性狀研究中。Wen等(2015)采用候選基因關(guān)聯(lián)分析確定了2個(gè)與玉米籽粒代謝途徑相關(guān)的基因。圖2是進(jìn)行候選基因關(guān)聯(lián)分析的步驟。圖2基于候選基因的關(guān)聯(lián)分析Fig.2Associationanalysisbasedoncandidategenes
文獻(xiàn)綜述23含量與產(chǎn)量性狀進(jìn)行變異性、相關(guān)性、主成分及聚類分析,挖掘影響苦蕎種質(zhì)籽粒產(chǎn)量、籽粒黃酮含量的主要因素,篩選籽粒產(chǎn)量高、籽粒黃酮含量高且其他產(chǎn)量性狀均表現(xiàn)良好的苦蕎種質(zhì)。同時(shí)對苦蕎種質(zhì)的SSR分子標(biāo)記進(jìn)行遺傳多樣性、連鎖不平衡(LD)和群體結(jié)構(gòu)的分析,基于群體結(jié)構(gòu)分析對苦蕎種質(zhì)的籽粒黃酮含量、籽粒產(chǎn)量性狀與SSR標(biāo)記進(jìn)行3個(gè)不同播種季節(jié)下的關(guān)聯(lián)分析,檢測與籽粒黃酮含量、產(chǎn)量性狀相關(guān)聯(lián)的SSR標(biāo)記。主要內(nèi)容有如下四個(gè)部分:一、苦蕎種質(zhì)籽粒黃酮含量和產(chǎn)量相關(guān)性狀的變異分析二、高產(chǎn)、高籽粒黃酮含量的苦蕎種質(zhì)篩選三、苦蕎種質(zhì)籽粒SSR分子標(biāo)記遺傳多樣性評價(jià)及群體結(jié)構(gòu)的分析四、苦蕎種質(zhì)籽粒黃酮含量和產(chǎn)量相關(guān)性狀的關(guān)聯(lián)分析1.7.3本研究的技術(shù)路線注:虛線框的內(nèi)容是由石桃雄老師完成的。圖3本研究的技術(shù)路線Fig.3Thetechnicalrouteofthisstudy
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]甜玉米種子營養(yǎng)品質(zhì)主要性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 王長進(jìn),徐運(yùn)林,程昕昕,周毅,余海兵. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020(03)
[2]切花菊耐寒性相關(guān)SNP位點(diǎn)挖掘與候選基因分析[J]. 范宏虹,徐婷婷,蘇江碩,孫煒,種昕冉,管志勇,房偉民,陳發(fā)棣,張飛. 園藝學(xué)報(bào). 2019(11)
[3]芫荽遺傳多樣性與性狀的關(guān)聯(lián)分析[J]. 李小梅,張景濤. 湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(21)
[4]大麥抗條紋病與SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析[J]. 司二靜,孟亞雄,李葆春,馬小樂,張宇,王化俊. 植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2019(05)
[5]甘藍(lán)型油菜每角粒數(shù)的全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 孫程明,陳鋒,陳松,彭琦,張維,易斌,張潔夫,傅廷棟. 作物學(xué)報(bào). 2020(01)
[6]長江中下游麥區(qū)小麥地方種質(zhì)千粒重全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 程宇坤,李健,姚方杰,蔣云峰,江千濤,李偉,蒲至恩,鄧梅,魏育明,陳國躍. 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(04)
[7]基于SSR的四川花生遺傳多樣性分析[J]. 侯睿,張小軍,岳福良,張小紅,李爽,劉行,張相瓊,李文均. 中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2019(25)
[8]蕎麥種質(zhì)資源概況[J]. 范昱,丁夢琦,張凱旋,楊克理,唐宇,張宗文,方溈,嚴(yán)俊,周美亮. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2019(04)
[9]普通小麥主要農(nóng)藝性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 翟俊鵬,李海霞,畢惠惠,周思遠(yuǎn),羅肖艷,陳樹林,程西永,許海霞. 作物學(xué)報(bào). 2019(10)
[10]基于超濾技術(shù)的苦蕎提取物抑制α-葡萄糖苷酶活性研究[J]. 李云龍,韓林,王敏. 中國糧油學(xué)報(bào). 2019(05)
博士論文
[1]稻米品質(zhì)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析及品質(zhì)相關(guān)基因的遺傳解析[D]. 趙達(dá).華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]基于自然群體及MAGIC群體關(guān)聯(lián)分析解析陸地棉重要農(nóng)藝性狀的遺傳基礎(chǔ)[D]. 黃聰.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[3]馬鈴薯種質(zhì)資源遺傳多樣性研究及塊莖性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 王艦.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[4]基于全基因組關(guān)聯(lián)分析的水稻分蘗角度和劍葉夾角的遺傳基礎(chǔ)解析[D]. 董海嬌.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[5]水稻籽粒相關(guān)性狀QTL鑒定與基因克隆研究[D]. 陳立凱.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[6]亞麻分子標(biāo)記的開發(fā)及產(chǎn)量相關(guān)性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 鄧欣.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
碩士論文
[1]陸地棉優(yōu)異種質(zhì)資源遺傳結(jié)構(gòu)與重要農(nóng)藝性狀關(guān)聯(lián)分析[D]. 張娜瑤.西北大學(xué) 2019
[2]小豆種質(zhì)資源抗旱性篩選鑒定及相關(guān)基因關(guān)聯(lián)分析[D]. 單云鵬.北京農(nóng)學(xué)院 2019
[3]油菜種質(zhì)資源耐寒性鑒定與全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 袁淑培.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2019
[4]利用連鎖不平衡發(fā)掘大豆灰斑病10號小種抗性位點(diǎn)[D]. 梁曉宇.黑龍江大學(xué) 2019
[5]甘蔗栽培品種的主要農(nóng)藝性狀與AFLP和SSR分子標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析[D]. 朱專為.福建農(nóng)林大學(xué) 2018
[6]寒地水稻種質(zhì)品質(zhì)特性及其連鎖不平衡分析[D]. 苗百更.佳木斯大學(xué) 2018
[7]中國小豆資源的遺傳多樣性及產(chǎn)量相關(guān)性狀與SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析[D]. 吉雯雯.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[8]水稻糊化溫度控制基因ALK的遺傳多樣性及對稻米理化品質(zhì)的影響[D]. 李闖.揚(yáng)州大學(xué) 2017
[9]大豆微核心種質(zhì)群體產(chǎn)量相關(guān)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 張友誼.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[10]甘藍(lán)型油菜含油量和蛋白質(zhì)含量相關(guān)基因的定位分析[D]. 袁姜蓮.西南大學(xué) 2017
本文編號:2959711
【文章來源】:貴州師范大學(xué)貴州省
【文章頁數(shù)】:137 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
基于候選基因的關(guān)聯(lián)分析
貴州師范大學(xué)碩士學(xué)位論文18圖1基于全基因組的關(guān)聯(lián)分析Fig.1Associationanalysisbasedonwholegenome(2)候選基因關(guān)聯(lián)分析基于候選基因的關(guān)聯(lián)分析需要對目標(biāo)性狀可能的基因有一定的預(yù)測和篩選,并對候選基因進(jìn)行測序分析或者SNP檢測,利用統(tǒng)計(jì)學(xué)的方法挖掘基因與性狀之間的關(guān)系,定位與性狀緊密連鎖的基因,并篩選功能等位變異(趙惠等,2018;王瑞果,2013;段繼鳳,2013)。候選基因關(guān)聯(lián)分析需要對目標(biāo)性狀的背景知識有所了解,并有基因表達(dá)、突變體或者基因功能、代謝途徑的相關(guān)證據(jù)確定的候選基因。此方法已成功應(yīng)用于大豆(Tianetal.,2010)、水稻(Tianetal.,2009)和玉米(Yanetal.,2011)等作物的數(shù)量性狀研究中。Wen等(2015)采用候選基因關(guān)聯(lián)分析確定了2個(gè)與玉米籽粒代謝途徑相關(guān)的基因。圖2是進(jìn)行候選基因關(guān)聯(lián)分析的步驟。圖2基于候選基因的關(guān)聯(lián)分析Fig.2Associationanalysisbasedoncandidategenes
文獻(xiàn)綜述23含量與產(chǎn)量性狀進(jìn)行變異性、相關(guān)性、主成分及聚類分析,挖掘影響苦蕎種質(zhì)籽粒產(chǎn)量、籽粒黃酮含量的主要因素,篩選籽粒產(chǎn)量高、籽粒黃酮含量高且其他產(chǎn)量性狀均表現(xiàn)良好的苦蕎種質(zhì)。同時(shí)對苦蕎種質(zhì)的SSR分子標(biāo)記進(jìn)行遺傳多樣性、連鎖不平衡(LD)和群體結(jié)構(gòu)的分析,基于群體結(jié)構(gòu)分析對苦蕎種質(zhì)的籽粒黃酮含量、籽粒產(chǎn)量性狀與SSR標(biāo)記進(jìn)行3個(gè)不同播種季節(jié)下的關(guān)聯(lián)分析,檢測與籽粒黃酮含量、產(chǎn)量性狀相關(guān)聯(lián)的SSR標(biāo)記。主要內(nèi)容有如下四個(gè)部分:一、苦蕎種質(zhì)籽粒黃酮含量和產(chǎn)量相關(guān)性狀的變異分析二、高產(chǎn)、高籽粒黃酮含量的苦蕎種質(zhì)篩選三、苦蕎種質(zhì)籽粒SSR分子標(biāo)記遺傳多樣性評價(jià)及群體結(jié)構(gòu)的分析四、苦蕎種質(zhì)籽粒黃酮含量和產(chǎn)量相關(guān)性狀的關(guān)聯(lián)分析1.7.3本研究的技術(shù)路線注:虛線框的內(nèi)容是由石桃雄老師完成的。圖3本研究的技術(shù)路線Fig.3Thetechnicalrouteofthisstudy
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]甜玉米種子營養(yǎng)品質(zhì)主要性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 王長進(jìn),徐運(yùn)林,程昕昕,周毅,余海兵. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020(03)
[2]切花菊耐寒性相關(guān)SNP位點(diǎn)挖掘與候選基因分析[J]. 范宏虹,徐婷婷,蘇江碩,孫煒,種昕冉,管志勇,房偉民,陳發(fā)棣,張飛. 園藝學(xué)報(bào). 2019(11)
[3]芫荽遺傳多樣性與性狀的關(guān)聯(lián)分析[J]. 李小梅,張景濤. 湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(21)
[4]大麥抗條紋病與SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析[J]. 司二靜,孟亞雄,李葆春,馬小樂,張宇,王化俊. 植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2019(05)
[5]甘藍(lán)型油菜每角粒數(shù)的全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 孫程明,陳鋒,陳松,彭琦,張維,易斌,張潔夫,傅廷棟. 作物學(xué)報(bào). 2020(01)
[6]長江中下游麥區(qū)小麥地方種質(zhì)千粒重全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 程宇坤,李健,姚方杰,蔣云峰,江千濤,李偉,蒲至恩,鄧梅,魏育明,陳國躍. 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(04)
[7]基于SSR的四川花生遺傳多樣性分析[J]. 侯睿,張小軍,岳福良,張小紅,李爽,劉行,張相瓊,李文均. 中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2019(25)
[8]蕎麥種質(zhì)資源概況[J]. 范昱,丁夢琦,張凱旋,楊克理,唐宇,張宗文,方溈,嚴(yán)俊,周美亮. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2019(04)
[9]普通小麥主要農(nóng)藝性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 翟俊鵬,李海霞,畢惠惠,周思遠(yuǎn),羅肖艷,陳樹林,程西永,許海霞. 作物學(xué)報(bào). 2019(10)
[10]基于超濾技術(shù)的苦蕎提取物抑制α-葡萄糖苷酶活性研究[J]. 李云龍,韓林,王敏. 中國糧油學(xué)報(bào). 2019(05)
博士論文
[1]稻米品質(zhì)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析及品質(zhì)相關(guān)基因的遺傳解析[D]. 趙達(dá).華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]基于自然群體及MAGIC群體關(guān)聯(lián)分析解析陸地棉重要農(nóng)藝性狀的遺傳基礎(chǔ)[D]. 黃聰.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[3]馬鈴薯種質(zhì)資源遺傳多樣性研究及塊莖性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 王艦.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[4]基于全基因組關(guān)聯(lián)分析的水稻分蘗角度和劍葉夾角的遺傳基礎(chǔ)解析[D]. 董海嬌.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[5]水稻籽粒相關(guān)性狀QTL鑒定與基因克隆研究[D]. 陳立凱.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[6]亞麻分子標(biāo)記的開發(fā)及產(chǎn)量相關(guān)性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 鄧欣.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
碩士論文
[1]陸地棉優(yōu)異種質(zhì)資源遺傳結(jié)構(gòu)與重要農(nóng)藝性狀關(guān)聯(lián)分析[D]. 張娜瑤.西北大學(xué) 2019
[2]小豆種質(zhì)資源抗旱性篩選鑒定及相關(guān)基因關(guān)聯(lián)分析[D]. 單云鵬.北京農(nóng)學(xué)院 2019
[3]油菜種質(zhì)資源耐寒性鑒定與全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 袁淑培.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2019
[4]利用連鎖不平衡發(fā)掘大豆灰斑病10號小種抗性位點(diǎn)[D]. 梁曉宇.黑龍江大學(xué) 2019
[5]甘蔗栽培品種的主要農(nóng)藝性狀與AFLP和SSR分子標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析[D]. 朱專為.福建農(nóng)林大學(xué) 2018
[6]寒地水稻種質(zhì)品質(zhì)特性及其連鎖不平衡分析[D]. 苗百更.佳木斯大學(xué) 2018
[7]中國小豆資源的遺傳多樣性及產(chǎn)量相關(guān)性狀與SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析[D]. 吉雯雯.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[8]水稻糊化溫度控制基因ALK的遺傳多樣性及對稻米理化品質(zhì)的影響[D]. 李闖.揚(yáng)州大學(xué) 2017
[9]大豆微核心種質(zhì)群體產(chǎn)量相關(guān)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 張友誼.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[10]甘藍(lán)型油菜含油量和蛋白質(zhì)含量相關(guān)基因的定位分析[D]. 袁姜蓮.西南大學(xué) 2017
本文編號:2959711
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