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生物品系特異性遺傳標記的可視化及應用

發(fā)布時間:2020-12-28 12:10
  當今,農(nóng)作物本身的遺傳信息,結(jié)合栽培環(huán)境,決定了其品質(zhì)特征和營養(yǎng)價值,農(nóng)作物品系遺傳物質(zhì)的一致性、穩(wěn)定性,也關系到重大的食品安全問題。生物學發(fā)展越來越迅速,遺傳標記在現(xiàn)代生物研究方面具有重要的研究價值,在農(nóng)作物育種、品種改良的鑒定中,也具有重要價值。遺傳標記比較容易測定,而研究生物特異性遺傳標記最關鍵的是將其進行可視化研究,結(jié)合當今互聯(lián)網(wǎng)的發(fā)展,將生物學與計算機科學的知識進行結(jié)合,能讓更多的人對生物從分子層次有一個更好的認識。如何能讓人們對優(yōu)良品種進行識別與選擇,是一個具有挑戰(zhàn)的事情。目前,人們對生物品種從分子層次認識比較欠缺,對優(yōu)良品質(zhì)的認識更是停留在形態(tài)上。因此,需要將計算機與生物信息知識結(jié)合,提供一個優(yōu)良品系鑒別的方法與平臺。本文主要從農(nóng)作物產(chǎn)品小麥品系實例進行研究,選擇它的遺傳標記SNP分子標記,將下載的數(shù)據(jù)運用Python技術(shù)進行過濾和篩選,獲得具有品系代表性的分子標記。構(gòu)建映射關系f,將分子標記數(shù)據(jù)映射成flame函數(shù)的參數(shù)序列,并結(jié)合當下流行的分形軟件Apophysis對小麥優(yōu)良品種的特異性遺傳標記進行可視化,最終生成可視化的分形圖案,體現(xiàn)品系的特異性特征。最后,將生物品... 

【文章來源】:青海師范大學青海省

【文章頁數(shù)】:57 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

生物品系特異性遺傳標記的可視化及應用


曼德博集合(2)迭代函數(shù)系統(tǒng)(IFS)

隨機分形,圖案,程序,手機


生物品系特異性遺傳標記的可視化及應用11圖2-2隨機分形圖案2.5分形圖形可視化應用平臺遺傳標記分形圖形應用平臺為微信小程序。信息化時代,許多諸如社交和手機應用等平臺相繼出現(xiàn),微信小程序是當前比較火熱的一款手機應用,很多小程序通過二維碼掃一掃或者直接搜索小程序名稱就可以打開應用[40],之后只要將手機主頁面往下拖動便可以再一次看到需要的小程序,如果不想要,直接拖動刪除即可。微信小程序是微信公眾平臺的小程序,它占用手機內(nèi)存很小[41],不需要安裝。微信小程序的優(yōu)勢:(1)開發(fā)門檻成本低,微信小程序適用于不同類型的手機,兼容性比較好,相比于傳統(tǒng)的APP,系統(tǒng)的維護成本更低;(2)用戶體驗較好,小程序可以隨用隨時打開,用完可以直接刪除的應用,不需要用戶再去一步一步的實現(xiàn)安裝,節(jié)省了手機的內(nèi)存空間。微信小程序現(xiàn)在用的領域比較廣闊,包含了售賣產(chǎn)品的商城,許多城市還應用在了地鐵、公交等服務,給日常生活帶來了許多方便[42]。微信小程序架構(gòu)圖如圖2-3所示。

架構(gòu)圖,程序,遺傳標記,迭代函數(shù)


青海師范大學碩士學位論文12圖2-3微信小程序架構(gòu)圖2.6本章小結(jié)本章主要介紹了本文研究的相關基本知識。第一節(jié)主要介紹了遺傳標記的概念以及分類,第二節(jié)介紹了遺傳標記分子的種類以及本文選擇SNP分子標記的優(yōu)勢,第三節(jié)介紹了常用的生物數(shù)據(jù)可視化工具,第四節(jié)介紹了幾種基于迭代函數(shù)的分形軟件以及遺傳標記分形可視化的軟件Apophysis,最后介紹了品系遺傳信息交易的平臺;A知識的介紹為后面工作的開展作了鋪墊。

【參考文獻】:
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碩士論文
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[3]面向中職信息技術(shù)師資培訓的微信小程序課程開發(fā)與研究[D]. 許智超.廣東技術(shù)師范大學 2019
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本文編號:2943729

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