利用Multi-color FISH建立羊草染色體辨認體系
發(fā)布時間:2020-12-27 19:48
羊草Leymus chinensis(Trin.)Tzvel是我國境內(nèi)重要的牧草資源,被稱作禾本科牧草之王。羊草不僅具有重要的經(jīng)濟價值和生態(tài)價值,而且作為普通小麥的三級基因庫與天然進化的多倍體,也具有很高的學術(shù)價值。然而,對羊草的細胞遺傳學研究和基因組層面的解析卻相對落后,其基本基因組組成、基因組結(jié)構(gòu)、物理圖譜、系統(tǒng)進化等重要生物學信息非常有限,嚴重阻礙了生產(chǎn)中對羊草資源的評價、保護與利用。植物染色體辨認技術(shù)是植物細胞遺傳學中重要的技術(shù)方法,特別是在未實現(xiàn)全基因組測序的物種中,可以促進物種基因組結(jié)構(gòu)、系統(tǒng)發(fā)育以及染色體行為的研究,在植物基因組學研究中發(fā)揮著獨特而重要的作用。本研究以羊草為材料,通過低覆蓋率測序、生物信息學分析、多色多次FISH、單拷貝序列FISH等技術(shù)手段,建立了羊草染色體精確辨認體系,實現(xiàn)了羊草染色體辨認圖與小麥遺傳連鎖圖的關(guān)聯(lián),并對不同地域來源的羊草進行了核型比較。本研究增進了對羊草基因組結(jié)構(gòu)的了解,統(tǒng)一了羊草染色體的命名,建立起的羊草現(xiàn)代細胞遺傳學染色體精確辨認體系為進一步研究羊草及其近緣種的系統(tǒng)進化關(guān)系提供了研究工具。主要研究結(jié)果如下:(1)利用低覆蓋率測序技術(shù)...
【文章來源】:內(nèi)蒙古大學內(nèi)蒙古自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
篩選出的以串聯(lián)重復序列或rDNA序列為主的聚類及聚類分析結(jié)果
利用Multi-colorFISH建立羊草染色體辨認體系29圖3.2羊草單個重復序列熒光原位雜交結(jié)果圖Figure3.2FISHresultsofthetandemrepeatedsequencesofL.chinensis圖3.2A~J分別為5SrDNA(紅色)、18SrDNA(紅色)、26SrDNA(白色)、CL6(紅色)、CL95(綠色)、CL121(紅色)、CL151(綠色)、CL162(綠色)、CL163(綠色)、CL239(紅色)串聯(lián)重復序列的熒光原位雜交結(jié)果。標尺:10μmFigure3.2AtoJaretheFISHresultsofthetandemrepeatsof5SrDNA(red),18SrDNA(red),26SrDNA(white),CL6(red),CL95(green),CL121(red),CL151(green),CL162(green),CL163(green),CL239(red),respectively.Allthebarare10μm.
內(nèi)蒙古大學碩士學位論文32圖3.3羊草根尖有絲分裂中期染色體一次雜交結(jié)果圖Figure3.3Resultsofone-timechromosomehybridizationofL.chinensisroottipmitosis圖3.3A表示重復序列CL162(綠色)、5SrDNA(紅色)、26SrDNA(白色)在羊草根尖有絲分裂中期染色體(染色體DAPI染色后呈藍色)上的信號分布;B表示圖A中紅色信號單通道圖片,顯示5SrDNA信號在染色體上的位置及數(shù)量;C表示圖A中綠色信號單通道圖片,顯示CL162信號在染色體上的位置及數(shù)量;D表示圖A中白色信號單通道圖片,顯示26SrDNA信號在染色體上的位置及數(shù)量。標尺:10μmFigure3.3ArepresentsthesignaldistributionoftherepeatsequencesCL162(green),5SrDNA(red),and26SrDNA(white)onthemitochondrialmetaphasechromosomes(chromosomeisblueafterDAPIstaining)oftheroottipofL.chinensis;Singlechannelpictureshowingthepositionandquantityof5SrDNAsignalonthechromosome;CrepresentsthesinglechannelpictureofthegreensignalinfigureA,whichshowsthepositionandquantityofCL162signalonthechromosome;DmeansthesinglechannelpictureofthewhitesignalinfigureA,showingThepositionandnumberof26SrDNAsignalsonchromosomes.Allthebarsare10μm.
【參考文獻】:
期刊論文
[1]不同種源羊草表型差異性[J]. 李陽,魏繼平,馬紅媛. 生態(tài)學報. 2020(04)
[2]羊草種質(zhì)資源的評價與利用[J]. 劉公社,李曉霞,齊冬梅,陳雙燕,程麗琴. 科學通報. 2016(02)
[3]基于形態(tài)和葉表皮微形態(tài)特征試論國產(chǎn)賴草屬屬下類群間的系統(tǒng)關(guān)系[J]. 李兆孟,周勇輝,劉玉萍,蘇旭. 植物研究. 2016(01)
[4]賴草(Leymus secalinus(Georgi)Tzvel.)中一個染色體標記的克隆與鑒定[J]. 李媛,喻鳳,趙閆閆,竇全文. 植物遺傳資源學報. 2015(04)
[5]植物染色體標本的制備和染色體核型分析研究進展[J]. 丁鴻,邱東萍,陳少雄. 南方農(nóng)業(yè)學報. 2012(12)
[6]賴草屬植物的表型分支系統(tǒng)學分析[J]. 沙莉娜,凡星,楊瑞武,王曉麗,周永紅. 四川農(nóng)業(yè)大學學報. 2009(01)
[7]國產(chǎn)賴草屬的分類修訂[J]. 蔡聯(lián)炳,蘇旭. 植物研究. 2007(06)
[8]對羊草細胞生物學研究的回顧[J]. 馬鶴林,索培芬. 內(nèi)蒙古草業(yè). 2006(03)
[9]植物染色體核型分析常用方法概述[J]. 劉永安,馮海生,陳志國,暢喜云,劉瑞娟,竇全文,王海慶. 貴州農(nóng)業(yè)科學. 2006(01)
[10]國產(chǎn)賴草屬的葉表皮特征與組群劃分[J]. 蔡聯(lián)炳,張梅妞. 植物研究. 2005(04)
博士論文
[1]水稻基因組序列分析及比較基因組研究[D]. 張玉軍.中國科學院研究生院(上海生命科學研究院) 2003
本文編號:2942376
【文章來源】:內(nèi)蒙古大學內(nèi)蒙古自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
篩選出的以串聯(lián)重復序列或rDNA序列為主的聚類及聚類分析結(jié)果
利用Multi-colorFISH建立羊草染色體辨認體系29圖3.2羊草單個重復序列熒光原位雜交結(jié)果圖Figure3.2FISHresultsofthetandemrepeatedsequencesofL.chinensis圖3.2A~J分別為5SrDNA(紅色)、18SrDNA(紅色)、26SrDNA(白色)、CL6(紅色)、CL95(綠色)、CL121(紅色)、CL151(綠色)、CL162(綠色)、CL163(綠色)、CL239(紅色)串聯(lián)重復序列的熒光原位雜交結(jié)果。標尺:10μmFigure3.2AtoJaretheFISHresultsofthetandemrepeatsof5SrDNA(red),18SrDNA(red),26SrDNA(white),CL6(red),CL95(green),CL121(red),CL151(green),CL162(green),CL163(green),CL239(red),respectively.Allthebarare10μm.
內(nèi)蒙古大學碩士學位論文32圖3.3羊草根尖有絲分裂中期染色體一次雜交結(jié)果圖Figure3.3Resultsofone-timechromosomehybridizationofL.chinensisroottipmitosis圖3.3A表示重復序列CL162(綠色)、5SrDNA(紅色)、26SrDNA(白色)在羊草根尖有絲分裂中期染色體(染色體DAPI染色后呈藍色)上的信號分布;B表示圖A中紅色信號單通道圖片,顯示5SrDNA信號在染色體上的位置及數(shù)量;C表示圖A中綠色信號單通道圖片,顯示CL162信號在染色體上的位置及數(shù)量;D表示圖A中白色信號單通道圖片,顯示26SrDNA信號在染色體上的位置及數(shù)量。標尺:10μmFigure3.3ArepresentsthesignaldistributionoftherepeatsequencesCL162(green),5SrDNA(red),and26SrDNA(white)onthemitochondrialmetaphasechromosomes(chromosomeisblueafterDAPIstaining)oftheroottipofL.chinensis;Singlechannelpictureshowingthepositionandquantityof5SrDNAsignalonthechromosome;CrepresentsthesinglechannelpictureofthegreensignalinfigureA,whichshowsthepositionandquantityofCL162signalonthechromosome;DmeansthesinglechannelpictureofthewhitesignalinfigureA,showingThepositionandnumberof26SrDNAsignalsonchromosomes.Allthebarsare10μm.
【參考文獻】:
期刊論文
[1]不同種源羊草表型差異性[J]. 李陽,魏繼平,馬紅媛. 生態(tài)學報. 2020(04)
[2]羊草種質(zhì)資源的評價與利用[J]. 劉公社,李曉霞,齊冬梅,陳雙燕,程麗琴. 科學通報. 2016(02)
[3]基于形態(tài)和葉表皮微形態(tài)特征試論國產(chǎn)賴草屬屬下類群間的系統(tǒng)關(guān)系[J]. 李兆孟,周勇輝,劉玉萍,蘇旭. 植物研究. 2016(01)
[4]賴草(Leymus secalinus(Georgi)Tzvel.)中一個染色體標記的克隆與鑒定[J]. 李媛,喻鳳,趙閆閆,竇全文. 植物遺傳資源學報. 2015(04)
[5]植物染色體標本的制備和染色體核型分析研究進展[J]. 丁鴻,邱東萍,陳少雄. 南方農(nóng)業(yè)學報. 2012(12)
[6]賴草屬植物的表型分支系統(tǒng)學分析[J]. 沙莉娜,凡星,楊瑞武,王曉麗,周永紅. 四川農(nóng)業(yè)大學學報. 2009(01)
[7]國產(chǎn)賴草屬的分類修訂[J]. 蔡聯(lián)炳,蘇旭. 植物研究. 2007(06)
[8]對羊草細胞生物學研究的回顧[J]. 馬鶴林,索培芬. 內(nèi)蒙古草業(yè). 2006(03)
[9]植物染色體核型分析常用方法概述[J]. 劉永安,馮海生,陳志國,暢喜云,劉瑞娟,竇全文,王海慶. 貴州農(nóng)業(yè)科學. 2006(01)
[10]國產(chǎn)賴草屬的葉表皮特征與組群劃分[J]. 蔡聯(lián)炳,張梅妞. 植物研究. 2005(04)
博士論文
[1]水稻基因組序列分析及比較基因組研究[D]. 張玉軍.中國科學院研究生院(上海生命科學研究院) 2003
本文編號:2942376
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