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水稻OsSIG2A基因的功能初步分析

發(fā)布時(shí)間:2020-11-12 04:36
   葉綠體是光合作用過程中最重要的細(xì)胞器,它雖有自己的基因組,但需要核蛋白的導(dǎo)入為其發(fā)育提供功能和物質(zhì)基礎(chǔ)。本文研究對(duì)象是一個(gè)水稻葉色缺失突變體。突變體在葉片發(fā)育3葉期前表現(xiàn)出白化表型,光合色素含量降低,葉綠體結(jié)構(gòu)異常,發(fā)育受阻。我們用圖位克隆的方法分離到目的基因OsSIG2A,初步探究了其功能,主要研究結(jié)果如下:(1)突變體二葉期前葉色表型白化,色素含量降低,葉綠體結(jié)構(gòu)不完整,至三葉后期,葉片表型轉(zhuǎn)綠表現(xiàn)為淡綠色,接近野生型,葉綠體色素含量和結(jié)構(gòu)缺陷減小。(2)突變體白化表型是由一對(duì)隱性核基因(OsSIG2A)控制;通過圖位克隆技術(shù)將目的基因(OsSIG2A)定位在第11染色體長(zhǎng)臂上的185 kb區(qū)間內(nèi)。通過測(cè)序比對(duì)發(fā)現(xiàn),突變基因在第二外顯子上即從ATG開始第1493處堿基C替換為T。轉(zhuǎn)基因互補(bǔ)驗(yàn)證LOC_Os11g26160是目的基因,根據(jù)之前研究,該基因命名為OsSIG2A(Oryza sativa L.Sigma factor/δ2A)。該基因編碼質(zhì)體RNA聚合酶(PEP)δ因子,類似于細(xì)菌型δ~(70)因子,主要在葉片中表達(dá),定位于葉綠體。(3)OsSIG2A影響了色素合成與光合作用過程中質(zhì)體RNA聚合酶PEP依賴性基因的表達(dá)。轉(zhuǎn)錄水平分析發(fā)現(xiàn),和野生型相比,二葉期前突變體中色素合成基因表達(dá)都明顯下調(diào),由PEP轉(zhuǎn)錄的質(zhì)體基因轉(zhuǎn)錄本也同步下調(diào),而部分核編碼的質(zhì)體基因的轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)。
【學(xué)位單位】:上海師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2020
【中圖分類】:S511
【部分圖文】:

遺傳圖譜,葉綠體,遺傳圖譜,基因


第一章文獻(xiàn)綜述上海師范大學(xué)碩士學(xué)位論文2列被大小單拷貝區(qū)隔開[8]。隨著時(shí)間演變,葉綠體丟失了許多基因,但是維管植物的葉綠體仍然含有約120個(gè)基因[6]。根據(jù)基因功能可將葉綠體基因大致分為三類(表1-1):與光合作用有關(guān)、與遺傳系統(tǒng)基因表達(dá)有關(guān)和與氨基酸等生物合成相關(guān)[14]。圖1-1水稻葉綠體基因遺傳圖譜(Hiratsukaetal.1989,KannoAetal.1993)Fig.1-1GeneticmapoftheOryzasativachloroplastgenome.圓圈外面的基因是逆時(shí)針方向轉(zhuǎn)錄,圓圈內(nèi)部基因是順時(shí)針方向轉(zhuǎn)錄,箭頭表示多順反子和單順反子轉(zhuǎn)錄。Genesshownontheoutsideofthecirclearetranscribedcounter-clockwiseandthoseontheinsideofthecirclearetranscribedclockwise.Polycistronicandmonocistronictranscriptsareshownasarrowsaroundthecircle.葉綠體基因組雖小,但根據(jù)蛋白質(zhì)組學(xué)研究發(fā)現(xiàn),質(zhì)體中有2000~3000種蛋白,這些蛋白大部分是核基因編碼的產(chǎn)物[10,11,12]。葉綠體的生物合成和功能是由質(zhì)體和核基因編碼的蛋白質(zhì)產(chǎn)物共同決定的,同時(shí)也離不開質(zhì)體和胞質(zhì)之間蛋

示意圖,因子,細(xì)菌,示意圖


,每個(gè)區(qū)域又可以分為若干子區(qū)域[51],區(qū)域1位于整個(gè)肽鏈的N端,是四個(gè)保守結(jié)構(gòu)域中序列保守性最低的一段,可分為區(qū)域1.1和區(qū)域1.2兩部分,具有促進(jìn)DNA開放結(jié)構(gòu)形成的作用[52,53,54];區(qū)域2包含4個(gè)保守子區(qū)域2.1~2.4,是δ因子中最保守的區(qū)域,其同樣具有穩(wěn)定開放結(jié)構(gòu)和促進(jìn)轉(zhuǎn)錄起始的功能[55];區(qū)域3可分為3.1和3.2兩個(gè)子區(qū)域,該區(qū)域具有刺激RNA合成,提高轉(zhuǎn)錄有效性的作用[56];區(qū)域4同樣含有4.1和4.2兩個(gè)子區(qū)域,主要負(fù)責(zé)識(shí)別啟動(dòng)子的-35區(qū)域,同時(shí)作為轉(zhuǎn)錄起始調(diào)控因子的作用位點(diǎn),具有調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的作用[57-59]。如圖1-2,區(qū)域4(子區(qū)域4.2)的羧基末端部分殘基形成一個(gè)與啟動(dòng)子的-35元件連接的螺旋-轉(zhuǎn)-螺旋模體,保守區(qū)2和3的殘基協(xié)同作用以介導(dǎo)-10區(qū)的識(shí)別和DNA的解鏈,子區(qū)域2.3和2.4與-10元件密切相關(guān)。圖1-2細(xì)菌型δ70因子結(jié)構(gòu)特征示意圖[46]Fig.1-2StructuralcharacteristicsofE.coliδ70.1.5.2δ因子的類別及功能作用δ因子的主要功能是作為質(zhì)體編碼RNA聚合酶的一部分,通過識(shí)別不同的啟動(dòng)子來起始轉(zhuǎn)錄。植物葉綠體中具有幾種δ因子,其功能由于植物物種的不同也存在著差異。到目前為止,已經(jīng)在模式植物擬南芥中描述鑒定了6個(gè)δ因子(SIG1-6),根據(jù)相關(guān)研究每個(gè)δ因子在葉綠體轉(zhuǎn)錄過程中的主要功能作用

突變體,表型,色素,野生型


上海師范大學(xué)碩士學(xué)位論文第三章結(jié)果與分析25第三章結(jié)果與分析3.1突變體表型分析突變體在二葉期前(第1,2葉)葉片白化(圖3-1A),之后長(zhǎng)出第3葉也初始白化,接著第1、2葉先轉(zhuǎn)綠,隨后第3葉也開始轉(zhuǎn)綠,到三葉后期,整個(gè)葉片表現(xiàn)為綠色,與野生型“嘉花1號(hào)”相比顏色澤稍淺,但第4葉以后與野生型一致成正常綠色。葉片色素提取測(cè)定表明,與野生型相比,二葉期突變體中葉綠素a,b,類胡蘿素含量降低均非常明顯,而三葉期兩者差異減小,色素含量也得到了提升(圖3-1B,C)。圖3-1突變體表型與光和色素含量Fig.3-1Phenotypicandphotosyntheticpigmentcontentcomparisonbetweenthethemutantandwild-type(WT)A.突變體與野生型在播下初期(a)、二葉(b)、三葉(c)和三葉后期(d)的表型,(c)
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本文編號(hào):2880255

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