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cAMP-PKA調(diào)控玉米大斑病菌極性生長的分子機(jī)制

發(fā)布時(shí)間:2020-11-09 14:42
   在我國,玉米種植一直是農(nóng)業(yè)發(fā)展的基石,在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中占據(jù)很大的比例,玉米作為糧食界的三巨頭之一,一直是農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)的主導(dǎo),所以其病害對(duì)國民經(jīng)濟(jì)的影響較大。常見的病害葉部病害包括玉米圓斑病、小斑病和大斑病,本文主要針對(duì)玉米大斑病,探索其致病菌——玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)的致病原理及信號(hào)通路。玉米大斑病菌是引發(fā)玉米大斑病的病原真菌,屬典型的絲狀真菌,其致病性受cAMP信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑的調(diào)控。PKA是cAMP該信號(hào)通路的第二信使的主要效應(yīng)物,它是一個(gè)四具體,包含2個(gè)調(diào)節(jié)亞基R和2個(gè)催化亞基C。本研究主要目的是明確在玉米大斑病菌的致病過程中,PKA及其下游轉(zhuǎn)錄因子StEFG1調(diào)控病菌發(fā)育及致病性的分子機(jī)制。本研究首先驗(yàn)證了 StpkaC2與轉(zhuǎn)錄因子StEFG1的互作關(guān)系,并鑒定了 StEFG1的下游靶基因StRab1;在△SpkaC1、△SpkaC2菌株中,檢測了StRab1基因的表達(dá)水平,并利用Rab特異性抑制劑,通過分析抑制劑對(duì)病菌表型的影響,明確了 Rab對(duì)病菌極性生長的調(diào)控作用。此外,根據(jù)文獻(xiàn)克隆了 PKA下游轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子 Flo8的編碼基因StFlo8,明確了StFlo8與2個(gè)PKA催化亞基及StEFG1的關(guān)系,同時(shí),通過創(chuàng)制△Stflo8菌株,分析該基因的功能,并對(duì)其下游互作蛋白進(jìn)行了篩選。所得主要結(jié)果如下:1.通過雙分子熒光技術(shù)(BiFC)驗(yàn)證了 StEFG1與StpkaC2的互作關(guān)系。構(gòu)建 pSPYCE(M)-StpkaC2、pSPYCE(M)-StEFG1、pSPYNE(R)-StpkaC2、pSPYNE(R)-StEFG14個(gè)重組載體,兩兩組合后導(dǎo)入農(nóng)桿菌感受態(tài)細(xì)胞,使重組質(zhì)粒表達(dá),隨后注射入煙草葉片中,觀察煙草葉片中的熒光。在注射組合為pSPYCE(M)-StpkaC2::pSPYNE(R)-StEFG1的煙草葉片中能夠看到GFP的熒光信號(hào),陰性對(duì)照中則未檢測到熒光信號(hào),表明,StpkaC2與StEFG1之間存在互作關(guān)系。2.通過qPCR檢測△SpkaC1、△SpkaC2菌株中與WT菌株差異表達(dá)且與菌絲生長有關(guān)的基因,獲得protein ID為162018的基因。序列分析發(fā)現(xiàn),該基因編碼產(chǎn)物與小G蛋白R(shí)ab1同源性最高,我們將其命名為StRob1,在△SpkaC2菌株中其表達(dá)量達(dá)到WT菌株的13倍,且高于△SpkaC1菌株,與前期所得轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)相吻合。3.通過凝膠阻滯(EMSA)驗(yàn)證StEFG1與StRob1啟動(dòng)子的互作關(guān)系。生信分析發(fā)現(xiàn),StRab1啟動(dòng)子區(qū)含有StEFG1的識(shí)別序列。將StEFG1進(jìn)行原核誘導(dǎo)表達(dá),提取并純化活性蛋白,將活性蛋白與探針(含有StEFG1識(shí)別序列的StRab1啟動(dòng)子片段)溫育使之結(jié)合,使用非變性凝膠分離探針,分析二者的互作關(guān)系。探針的長度為30 bp,將探針與StEFG1蛋白進(jìn)行溫育后,在非變性凝膠的80 bp-200 bp之間出現(xiàn)三條主帶,表明蛋白與探針結(jié)合使探針的遷移速率發(fā)生改變,而作為陰性對(duì)照的BSA并沒有改變探針的遷移速率,表明StEFG1蛋白與探針的結(jié)合是特異性的。4.通過qPCR試驗(yàn)檢測StRab1基因在玉米大斑病菌侵染過程不同時(shí)期的表達(dá)量。以成熟菌絲為對(duì)照,β-tubulin基因?yàn)閮?nèi)參,孢子時(shí)期、芽管時(shí)期、附著胞時(shí)期以及侵入釘時(shí)期,該基因的相對(duì)表達(dá)量分別為:0.24、1.14、1.35、4.51。StRab1在侵入釘時(shí)期的表達(dá)水平最高,說明其可能在菌絲極性生長過程中發(fā)揮重要調(diào)控作用。5.通過抑制劑試驗(yàn)驗(yàn)證Rab與菌絲極性生長及幾丁質(zhì)合成的關(guān)系。用抑制劑處理后,△SpkaC2突變體的菌絲生長減緩,產(chǎn)孢能力得到一定的恢復(fù);使用共聚焦顯微鏡觀察經(jīng)幾丁質(zhì)熒光染料著色的菌絲體,發(fā)現(xiàn)抑制劑處理的菌絲末端熒光信號(hào)減弱,說明幾丁質(zhì)的分布減少,菌絲的末端生長受限。6.通過酵母雙雜交試驗(yàn)驗(yàn)證Stflo8與StpkaC1、Stflo8與StEFG1的互作關(guān)系。構(gòu)建pGADT7-StpkaC1/StEFG1/Stflo8、pGBKT7-StpkaC1/StEFG1/Stflo8載體,pGADT7/pGBKT7-Stflo8 與 pGADT7/pGBKT7-StpkaC1、pGADT7/pGBKT7-StEFG1重組質(zhì)粒進(jìn)行組合,轉(zhuǎn)入酵母感受態(tài)細(xì)胞后,在缺陷培養(yǎng)基上培養(yǎng),結(jié)果顯示,在SD/-Ade-His-Leu-Trp平板上只有pGADT7-StpkaC1與pGBKT7-Stflo8,pGADT7-Stflo8與 pGBKT7-StEFG1能生長,說明蛋白Stflo8與蛋白StpkaC1和StEFG1之間存在相互作用,而且這種相互作用是特異的。7.創(chuàng)制Stflo8缺失突變體,對(duì)該基因的功能進(jìn)行分析。成功構(gòu)建了Stflo8敲除載體,并將重組載體轉(zhuǎn)化入病原真菌,創(chuàng)制了Stflo8基因敲除突變體。比較基因缺失突變體與野生型的表型,分析該基因的功能。結(jié)果表明,敲除該基因后,病菌的產(chǎn)孢量幾乎為0,野生型在疏水介質(zhì)培養(yǎng)36 h能夠形成侵入釘,而突變體無法形成附著胞,同時(shí)敲除該基因后病菌的黑色素合成能力減弱。8.通過原核誘導(dǎo)表達(dá)Stflo8蛋白,利用Pull-down技術(shù)釣取該基因下游與之互作的蛋白。結(jié)果獲得240多個(gè)蛋白在ncbi中進(jìn)行比對(duì)分析,明確其功能及基因家族,統(tǒng)計(jì)發(fā)現(xiàn)其中6.67%為糖苷水解酶(glycoside hydrolase),4.44%為糖基水解酶(glycosyltransferase),2.22%為碳水化介物酯酶(carbohydrate esterase),其余蛋白質(zhì)尚未標(biāo)記其功能。綜上所述,SpkaC2通過StEFG1調(diào)控StRab1的轉(zhuǎn)錄,影響病菌的極性生長;而SpkaC1通過StFlo8間接作用于StEFG1,調(diào)控StRab1的轉(zhuǎn)錄,對(duì)病菌極性生長的影響小于SpkaC2。研究豐富了對(duì)病菌cAMP信號(hào)途徑作用機(jī)制的認(rèn)識(shí),為尋找病害防控新策略奠定了理論基礎(chǔ)。
【學(xué)位單位】:河北農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2020
【中圖分類】:S435.131
【部分圖文】:

孢子,菌株,產(chǎn)量,病菌


tem?of?A?StpkaC2\?C.?Conidium?stem?of?A?SlpkaC2 ̄C:?D.??Conidium?sieni?of?A?StpkaC2?which?disposed?hv?inhibitor.??1〇l??rrrr^?\vx??M〇?8"?FT?!?m?s^tpkaCl??、6-議發(fā)?^3?^tpkaC:?C??T3?:::::¥%??S?4?II::??;?議::??03?鐵???I?2-?II?鬥??0]^^ ̄ ̄.????圖11不同菌株孢子產(chǎn)量量化圖??I'ii!?11?QuaiHiUcd?spore?yield?ordiffcrcnl?strains??14.3?Uab抑制齊ij對(duì)病菌/L丁質(zhì)含量及分布的影響??兒T質(zhì)的是菌絲極性生長過程中細(xì)胞壁的重要組成成分,力菌絲的屮長發(fā)育??及侵染過程密切相關(guān),幾丁質(zhì)的含量及分布在病菌侵染的過程中是泠關(guān)爪要的,??w此’購調(diào)介成兒r質(zhì)的能力成為病菌侵染能力的.個(gè)_c要指標(biāo)。比較分析野-十^??型1J突變體相關(guān)能力從而間接鑒定缺失基因?qū)Σ【虏⌒缘恼{(diào)控作Hj。??八個(gè)幾I)貞A成W濃wt和A?,S7/如r2中-_UW個(gè)M的表達(dá)松式,提収七凇??人斑病保丨野z。吞m株WT、A?57/^£/C'2以及A沖?知C’2-C等菌株菌絲屮的兒廠??質(zhì),迎過檢測530nm?K的提収物溶液的波長來測記提取物中幾丁質(zhì)的含m。??提収液屮兒廠質(zhì)的含祕(mì)越高,則溶液的顏色越深,迎過對(duì)提取液進(jìn)彳Tl'l:觀觀??察發(fā)現(xiàn),及缺尖突變體幾T質(zhì)提収液的顏&比野A型更深,而其欠??變體幾M'質(zhì)捉収液的顏色則較淺,測定各蘭株兒T質(zhì)提取液在波長為6

凝膠電泳,載體


?河北農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位(畢業(yè))論文???3.6?敲除突變體創(chuàng)制??3.6.1聊沾敲除載體構(gòu)建??對(duì)擴(kuò)增的同源臂進(jìn)行凝膠電泳監(jiān)測,得到兩個(gè)大小分別為520?bp、480?bp??的片段, ̄其基閃序列相符,對(duì)兩個(gè)[nj源臂片段進(jìn)行測序,通過DNAMAN進(jìn)行??比較分析,朱見突變,利用該目的片段進(jìn)行f續(xù)載體構(gòu)建工作。??識(shí)二:??圖19敲除載體同源臂1、2菌液l>CR檢測凝膠電泳檢樣??Fig.IS)?Knockout?vector?homologous?arm?1.?2?bacteria?liquiil?PCR?detection?gel?electrophoresis?sample.??3.6.2?A?Slfh)H^}\%\\??將新逑的敲除載體通過PEG介導(dǎo)的方式轉(zhuǎn)化到玉米大斑病菌中,在具有抗??中素的培奍姑屮進(jìn)行初步篩選,通過抗性篩選,得到部分轉(zhuǎn)化子,進(jìn)—步在抗性??培養(yǎng)站中純化轉(zhuǎn)化了,待轉(zhuǎn)化子能夠穩(wěn)定屮長后,進(jìn)一步進(jìn)行DNA水平的檢測,??提取轉(zhuǎn)化丫?及野屯型的基因纟丨1?DNA,以構(gòu)讓的敲除載體的質(zhì)粒為模板作為陽性??對(duì)照,以玉米人斑病調(diào)野中型軸W組DNA為模板作為陰性對(duì)照,對(duì)同源臂 ̄篩??選標(biāo)記的連接部位進(jìn)行擴(kuò)增,結(jié)見V小,把/H?佘株轉(zhuǎn)化子中,釕…株能夠擴(kuò)增??,lll,人小為926bp的條帶,lR^a式驗(yàn)M,^到扣M的試驗(yàn)結(jié)見,獲得?株陽性轉(zhuǎn)??化子,將該轉(zhuǎn)化子進(jìn)-步純化f進(jìn)行炎型觀察以分析基因功能。??圖20?l)NA水平驗(yàn)證轉(zhuǎn)化子電泳檢樣圖??l?ii!?20?DNA?level?\cnlicalion?imcrlcr?electrophoresis?diagram??從左到右依次為MmkT

樣圖,樣圖,電泳,模板


部分轉(zhuǎn)化子,進(jìn)—步在抗性??培養(yǎng)站中純化轉(zhuǎn)化了,待轉(zhuǎn)化子能夠穩(wěn)定屮長后,進(jìn)一步進(jìn)行DNA水平的檢測,??提取轉(zhuǎn)化丫?及野屯型的基因纟丨1?DNA,以構(gòu)讓的敲除載體的質(zhì)粒為模板作為陽性??對(duì)照,以玉米人斑病調(diào)野中型軸W組DNA為模板作為陰性對(duì)照,對(duì)同源臂 ̄篩??選標(biāo)記的連接部位進(jìn)行擴(kuò)增,結(jié)見V小,把/H?佘株轉(zhuǎn)化子中,釕…株能夠擴(kuò)增??,lll,人小為926bp的條帶,lR^a式驗(yàn)M,^到扣M的試驗(yàn)結(jié)見,獲得?株陽性轉(zhuǎn)??化子,將該轉(zhuǎn)化子進(jìn)-步純化f進(jìn)行炎型觀察以分析基因功能。??圖20?l)NA水平驗(yàn)證轉(zhuǎn)化子電泳檢樣圖??l?ii!?20?DNA?level?\cnlicalion?imcrlcr?electrophoresis?diagram??從左到右依次為MmkT,陽性對(duì)照,陰性對(duì)照,轉(zhuǎn)化子??34??
【參考文獻(xiàn)】

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