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奶牛乳樣和糞樣中幽門螺桿菌PCR檢測(cè)方法的建立及初步應(yīng)用

發(fā)布時(shí)間:2016-11-09 15:52

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《四川農(nóng)業(yè)大學(xué)》 2015年

奶牛乳樣和糞樣中幽門螺桿菌PCR檢測(cè)方法的建立及初步應(yīng)用

張于  

【摘要】:幽門螺桿菌(Helicobacter pylori, Hp)與上消化道及胃腸道外的多系統(tǒng)疾病相關(guān),但至今其感染人的傳染源和傳播途徑仍不明確。研究表明Hp可能是種食源性致病菌,而牛乳、羊乳是其中最可能的感染來(lái)源。目前,在幽門螺桿菌感染的眾多診斷方法中,聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)相關(guān)技術(shù)因靈敏度高,能檢出樣品中微量的Hp,而廣泛應(yīng)用于各臨床樣品中Hp的檢測(cè)。本試驗(yàn)分別以幽門螺桿菌16SrRNA、UreA、glmM基因?yàn)榘谢?設(shè)計(jì)特異性引物,建立奶牛乳樣和糞樣中幽門螺桿菌的PCR檢測(cè)方法,并成功應(yīng)用于奶牛臨床樣品的檢測(cè)。1、Hp PCR檢測(cè)方法的建立:根據(jù)NCBI上已公布的Hp 16S rRNA、UreA、glmM基因序列,設(shè)計(jì)特異性引物。提取H. pylori動(dòng)物模型適應(yīng)菌株SS1株菌液(1×108 CFU/ML) DNA作為PCR模板。模板濃度、退火溫度、引物濃度及循環(huán)數(shù)等PCR反應(yīng)體系及條件經(jīng)優(yōu)化后得到以下結(jié)果:25μL反應(yīng)體系中,加入2μL模板DNA,16S rRNA、UreA、glmM基因分別在退火溫度為58℃~60℃、48℃~50℃、58℃~60℃時(shí)能擴(kuò)增出777bp、411bp、294bp的目的條帶;其中上下游引物(10μM)各0.4μL~0.6μL,循環(huán)數(shù)為32~35個(gè)時(shí)擴(kuò)增效果最好。在此條件下,16S rRNA、UreA、glmM檢測(cè)的靈敏度分別為101 CFU/ML、103 CFU/ML、103 CFU/ML。同時(shí)對(duì)比乳樣、糞樣樣品基質(zhì)條件下PCR檢測(cè)靈敏度發(fā)現(xiàn),應(yīng)用UreA、glmM基因檢測(cè)人工污染的奶牛糞樣中幽門螺桿菌時(shí),靈敏性有所下降,為104 CFU/ML。由此可得,本試驗(yàn)建立的PCR方法快速、特異、靈敏、高效,為檢測(cè)奶牛攜帶幽門螺桿菌的情況奠定了基礎(chǔ)。2、Hp PCR檢測(cè)方法的應(yīng)用:采集規(guī);B(yǎng)殖及散養(yǎng)的共計(jì)41頭奶牛的乳樣和糞樣進(jìn)行檢測(cè),成功檢出Hp DNA。16S rRNA、UreA、glmM于奶牛乳樣中Hp的檢出率分別為58.34%、34.15%、14.63%,而糞樣中16S rRNA、UreA、glmM檢出率分別為19.51%、12.20%及0%。16S rRNA、UreA基因檢出率明顯高于glmM。

【關(guān)鍵詞】:
【學(xué)位授予單位】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:S852.6
【目錄】:

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  本文關(guān)鍵詞:奶牛乳樣和糞樣中幽門螺桿菌PCR檢測(cè)方法的建立及初步應(yīng)用,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

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本文編號(hào):169201

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