鎘脅迫下牦牛肝臟組織轉(zhuǎn)錄組學(xué)及蛋白組學(xué)研究
本文關(guān)鍵詞:鎘脅迫下牦牛肝臟組織轉(zhuǎn)錄組學(xué)及蛋白組學(xué)研究 出處:《青海大學(xué)》2017年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文
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【摘要】:牦牛在青藏高原牧民的日常生活中占有很重要的地位,青海省周邊礦區(qū)中的鎘(Cd~(2+))污染能夠通過牦牛的富集作用將鎘(Cd~(2+))帶入機(jī)體,鎘的危害非常大,對牦牛肉制品食用的安全性有著嚴(yán)重的影響。因此,研究鎘(Cd~(2+))在牦牛體內(nèi)的生物代謝途徑對牦牛肉的食用安全性有著重要的意義。1、鎘脅迫牦牛腎臟細(xì)胞的試驗中,用濃度為0、5、10、20、30μmol/L氯化鎘脅迫牦牛腎臟細(xì)胞,通過熒光定量PCR技術(shù)測得,當(dāng)鎘(Cd~(2+))添加5μmol/L時,腎臟細(xì)胞中的金屬硫蛋白基因(MT1)有明顯的表達(dá),重金屬鎘能夠促進(jìn)MT1 mRNA的表達(dá),隨著重金屬離子鎘脅迫強(qiáng)度的增大MT1基因的mRNA的表達(dá)量就會增加。2、以青海省大通種牛場5-6個月齡的牦牛為研究對象,以飼喂3mg/ml氯化鎘溶液的實驗組牦牛和空白組的牦牛肝臟組織構(gòu)建cDNA文庫,通過lllumina Hiseq2000高通量測序系統(tǒng)測序,通過的基因的差異性分析,共篩選到表達(dá)差異的基因16029個,表達(dá)差異顯著的基因共有384個,其中有129個基因表達(dá)水平明顯上調(diào),255個基因表達(dá)水平下調(diào)。3、通過對牦牛肝臟組織的蛋白質(zhì)組學(xué)分析,共鑒定到3173個蛋白質(zhì),并與試驗中設(shè)置的空白組牦牛肝臟組織做差異蛋白分析,篩選得到差異蛋白104個,其中68個為上調(diào)蛋白,36個為下調(diào)蛋白。4、牦牛肝臟組織的蛋白組與轉(zhuǎn)錄組做關(guān)聯(lián)分析,對表達(dá)差異顯著的384個基因和表達(dá)差異顯著的104個蛋白做關(guān)聯(lián)分析,共關(guān)聯(lián)到14個表達(dá)有顯著差異的蛋白質(zhì)。14個蛋白分別是異檸檬酸脫氫酶、羰基還原酶、組織相容性抗原、ADP-核糖基化蛋白、結(jié)合珠蛋白、膜聯(lián)蛋白A2、谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶A1、黃曲霉毒素B1醛還原酶、二甲基苯胺單氧酶、法尼基焦磷酸合成酶、雌激素硫酸轉(zhuǎn)移酶、羧酸酯酶3、脂肪酸結(jié)合蛋白、UDP-葡萄糖醛酸轉(zhuǎn)移酶2C1。
[Abstract]:Yak plays a very important role in Tibetan Plateau herdsmen's daily life, the mining area in Qinghai Province, CD (Cd~ (2+)) pollution could be enriched through the role of yak cadmium (Cd~ (2+)) into the body, the harm of cadmium is very large, has a serious impact on the safety of yak meat food. Therefore, the study of cadmium (Cd~ (2+)) in the biological metabolic pathway in Yak on food safety of yak meat has important significance of.1 test, cadmium stress in Yak kidney cells, renal cells with the concentration of stress yak 0,5,10,20,30 mol/L cadmium chloride, measured by fluorescence quantitative PCR. When the CD (Cd~ (2+)) added 5 mol/L, metallothionein gene in kidney cells (MT1) have obvious expression of CD can promote the expression of MT1 mRNA, with the expression of MT1 gene will increase the amount of heavy metal cadmium stress intensity of mRNA increased.2 in Qinghai Province Datong cattle farm in 5-6 month old yak as the research object, to construct a cDNA Library in the liver tissues of yak yak experimental group and blank group was fed 3mg/ml cadmium chloride solution, through the lllumina Hiseq2000 high-throughput sequencing sequencing system, through the analysis of differences of gene, were screened 16029 differentially expressed genes, gene expression obviously there are a total of 384, of which 129 genes expression was significantly up-regulated, and 255 genes expression of.3, through the proteomics of yak liver tissue analysis, identified 3173 proteins, and differential protein analysis and test of yak liver tissue in blank group set in the experiment, screened proteins 104, including 68 up-regulated proteins, 36 down regulated protein.4, yak liver tissue protein group and transcriptome do correlation analysis, significant differential expression of 384 genes and expressed significant difference Do the correlation analysis of 104 proteins, 14 were related to the expression of protein.14 protein are isocitrate dehydrogenase, carbonyl reductase, histocompatibility antigen, ADP- ribosylation protein, haptoglobin, annexin A2, glutathione S-transferase A1, aflatoxin B1 aldehyde reductase. Two methyl aniline monooxygenase, farnesyl pyrophosphate synthase, estrogen sulfotransferase, carboxylesterase 3, fatty acid binding protein, UDP- glucuronosyltransferase 2C1.
【學(xué)位授予單位】:青海大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:S823.85
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,本文編號:1382077
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