本文關(guān)鍵詞：甘薯bHLH基因家族的鑒定與初步分析　出處：《江蘇師范大學(xué)》2017年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

  更多相關(guān)文章： 甘薯 轉(zhuǎn)錄組測序 bHLH轉(zhuǎn)錄因子 關(guān)聯(lián)分析 花青素

【摘要】：甘薯(Ipomoea batatas(L.)Lam.)是世界第七大、我國第四大農(nóng)作物,也是目前最具潛力的經(jīng)濟(jì)作物之一,因其富含各種營養(yǎng)物質(zhì)及具有較高的工業(yè)價(jià)值。然而,甘薯是六倍體植物,其基因組比較復(fù)雜,迄今為止仍沒有可靠的參考基因組,因而阻礙了甘薯的分子遺傳與功能基因組學(xué)方面的研究進(jìn)展,相比于其他幾大農(nóng)作物,甘薯眾多農(nóng)藝性狀的分子調(diào)控機(jī)制尚不清楚。bHLH(basic helix-loop-helix)基因家族廣泛存在于動植物中,是植物中第二大基因家族。bHLH轉(zhuǎn)錄因子在動植物生長發(fā)育過程以及在植物響應(yīng)脅迫反應(yīng)中起著關(guān)鍵作用,同時(shí)還參與植物中各種物質(zhì)合成和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)。盡管目前在已經(jīng)完成基因組測序的物種鑒定到大量的bHLH轉(zhuǎn)錄因子,并研究了其中一部分基因的功能,但是大部分bHLH轉(zhuǎn)錄因子的生物學(xué)功能仍未得到闡述。本研究以甘薯塊根為研究材料,基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫鑒定了大量的bHLH轉(zhuǎn)錄因子,通過基因表達(dá)譜分析和系統(tǒng)發(fā)育樹分析探討了這些基因的分化,并將與花青素合成相關(guān)的bHLH轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)行重點(diǎn)研究。本研究主要做了如下幾個(gè)方面的工作:1、首先在多個(gè)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫進(jìn)行生物信息學(xué)分析,最終鑒定到152個(gè)非冗余的甘薯bHLH基因家族成員。通過分析這些家族成員的Pfam蛋白結(jié)構(gòu)域、Motif組成與系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系,將這些成員分為了18個(gè)亞家族。2、為了預(yù)測甘薯bHLH基因的生物學(xué)功能,我們分析了甘薯與模式植物擬南芥bHLH基因之間的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系,以鑒定相應(yīng)的甘薯直系同源,推測bHLH基因家族成員在甘薯中的功能。3、為了進(jìn)一步研究bHLH基因家族成員在甘薯中的功能分化,本實(shí)驗(yàn)分別以77個(gè)甘薯種質(zhì)的成熟塊根和兩個(gè)甘薯品種的8個(gè)不同組織為實(shí)驗(yàn)材料,進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,獲得了甘薯中bHLH基因在不同種質(zhì)和不同組織中的表達(dá)模式。4、本文以甘薯花青素作為一個(gè)案例,通過關(guān)聯(lián)分析研究了甘薯bHLH基因與甘薯塊根中花青素含量的關(guān)系。我們的關(guān)聯(lián)分析結(jié)果顯示,基因IbbHLH2與甘薯塊根中花青素含量顯著關(guān)聯(lián)(R2=0.5;P=1.64E-14);該結(jié)果通過實(shí)時(shí)定量PCR實(shí)驗(yàn)得到了驗(yàn)證,顯示IbbHLH2基因可能在調(diào)控甘薯花青素合成過程中起著關(guān)鍵作用。總而言之,本實(shí)驗(yàn)為深入研究甘薯bHLH基因的生物學(xué)功能研究奠定了重要基礎(chǔ),為研究調(diào)控甘薯花青素合成的分子機(jī)制提供了候選基因。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：江蘇師范大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號】：Q943.2;S531

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5 外經(jīng)貿(mào)部駐海南特辦;海南甘薯首次打入國際市場[N];國際商報(bào);2002年

6 省農(nóng)科院昌黎果樹所 郭恩才 韓繼成 章德明;怎樣選脫毒的甘薯品種[N];河北科技報(bào)(農(nóng)村版);2001年

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8 河北省農(nóng)科院糧油作物所 張松樹;甘薯專用品種介紹[N];河北科技報(bào);2006年

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