發(fā)布時(shí)間：2017-12-15 07:35

  本文關(guān)鍵詞：一株洞庭湖自然保護(hù)區(qū)豆雁H6N2亞型禽流感病毒全基因組遺傳特征分析

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【摘要】：禽流感病毒(Avian influenza Virus,AIV)在野生鳥(niǎo)類中廣泛分布,特別是野生水禽被認(rèn)為是禽流感病毒主要的"基因池"。野生鳥(niǎo)類周期性遷徙活動(dòng)對(duì)禽流感病毒的傳播具有不容忽視的作用。2014年12月和2015年2月,本研究在湖南東洞庭湖國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)采集候鳥(niǎo)新鮮糞便樣本921份,共分離得到38株陽(yáng)性毒株,鑒定亞型包括H9N2、H6N2、H11N8和H12N2四種;宿主包括豆雁、白額雁、鴻雁和羅紋鴨四種,均屬雁形目。使用特異性引物對(duì)禽流感病毒各基因全長(zhǎng)片段進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-PCR)擴(kuò)增,產(chǎn)物經(jīng)二代測(cè)序獲得基因組全長(zhǎng)序列。本文選擇來(lái)自本研究的一株H6N2亞型豆雁分離株,對(duì)其全基因組序列構(gòu)建進(jìn)化樹(shù),進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析,探討該毒株的來(lái)源及與候鳥(niǎo)遷徙的關(guān)系。將H6N2亞型毒株各基因序列翻譯成相對(duì)應(yīng)氨基酸序列,進(jìn)行氨基酸位點(diǎn)分析;同時(shí)將各基因序列與GenBank發(fā)表的相應(yīng)序列進(jìn)行比較并繪制遺傳進(jìn)化樹(shù)。結(jié)果表明:H6N2亞型毒株HA蛋白裂解位點(diǎn)的氨基酸序列為PQIETR↓GLF,具有典型低致病性禽流感病毒特征;受體結(jié)合相關(guān)位點(diǎn)第226位為谷氨酰胺Q,228位為谷氨酸G,具禽源禽流感病毒特征;NA蛋白氨基酸序列不具備頸環(huán)缺失;核苷酸序列同源分析表明PB2、PA和HA基因同源性最高毒株來(lái)自野生水鳥(niǎo),PB1、NP、NA、M和NS基因同源性最高毒株來(lái)自家禽鴨;系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析表明PB1、PA、HA、NP、NA、M 和 NS 基因?qū)儆?Eurasian Gene pool(Group Ⅲ,HN573-like)分支,PB2基因?qū)儆贕s/GD-likeH5N1分支,表明本毒株可能由H6N2和H5N1亞型禽流感病毒基因的重組產(chǎn)生。本毒株的N2、PB2、PB1和PA基因與近年新興并引發(fā)家禽疫情的高致病性禽流感病毒H5N8亞型相關(guān)毒株在進(jìn)化樹(shù)上同列于一個(gè)進(jìn)化分支。綜上所述,本毒株為重組H6N2亞型禽流感病毒,基因具野鳥(niǎo)源與家禽源禽流感病毒的遺傳特征。結(jié)合本研究的流行病學(xué)調(diào)查結(jié)果,說(shuō)明洞庭湖國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)野鳥(niǎo)攜帶的禽流感病毒具有不同亞型、不同宿主交叉感染特征,加強(qiáng)對(duì)該地野鳥(niǎo)禽流感病毒監(jiān)測(cè)將有助于預(yù)防和應(yīng)對(duì)新疫情爆發(fā)。
【學(xué)位授予單位】：華東師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：S852.65

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本文編號(hào)：1291153