本文關(guān)鍵詞：一株洞庭湖自然保護區(qū)豆雁H6N2亞型禽流感病毒全基因組遺傳特征分析

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【摘要】：禽流感病毒(Avian influenza Virus,AIV)在野生鳥類中廣泛分布,特別是野生水禽被認(rèn)為是禽流感病毒主要的"基因池"。野生鳥類周期性遷徙活動對禽流感病毒的傳播具有不容忽視的作用。2014年12月和2015年2月,本研究在湖南東洞庭湖國家級自然保護區(qū)采集候鳥新鮮糞便樣本921份,共分離得到38株陽性毒株,鑒定亞型包括H9N2、H6N2、H11N8和H12N2四種;宿主包括豆雁、白額雁、鴻雁和羅紋鴨四種,均屬雁形目。使用特異性引物對禽流感病毒各基因全長片段進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-PCR)擴增,產(chǎn)物經(jīng)二代測序獲得基因組全長序列。本文選擇來自本研究的一株H6N2亞型豆雁分離株,對其全基因組序列構(gòu)建進(jìn)化樹,進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析,探討該毒株的來源及與候鳥遷徙的關(guān)系。將H6N2亞型毒株各基因序列翻譯成相對應(yīng)氨基酸序列,進(jìn)行氨基酸位點分析;同時將各基因序列與GenBank發(fā)表的相應(yīng)序列進(jìn)行比較并繪制遺傳進(jìn)化樹。結(jié)果表明:H6N2亞型毒株HA蛋白裂解位點的氨基酸序列為PQIETR↓GLF,具有典型低致病性禽流感病毒特征;受體結(jié)合相關(guān)位點第226位為谷氨酰胺Q,228位為谷氨酸G,具禽源禽流感病毒特征;NA蛋白氨基酸序列不具備頸環(huán)缺失;核苷酸序列同源分析表明PB2、PA和HA基因同源性最高毒株來自野生水鳥,PB1、NP、NA、M和NS基因同源性最高毒株來自家禽鴨;系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明PB1、PA、HA、NP、NA、M 和 NS 基因?qū)儆?Eurasian Gene pool(Group Ⅲ,HN573-like)分支,PB2基因?qū)儆贕s/GD-likeH5N1分支,表明本毒株可能由H6N2和H5N1亞型禽流感病毒基因的重組產(chǎn)生。本毒株的N2、PB2、PB1和PA基因與近年新興并引發(fā)家禽疫情的高致病性禽流感病毒H5N8亞型相關(guān)毒株在進(jìn)化樹上同列于一個進(jìn)化分支。綜上所述,本毒株為重組H6N2亞型禽流感病毒,基因具野鳥源與家禽源禽流感病毒的遺傳特征。結(jié)合本研究的流行病學(xué)調(diào)查結(jié)果,說明洞庭湖國家級自然保護區(qū)野鳥攜帶的禽流感病毒具有不同亞型、不同宿主交叉感染特征,加強對該地野鳥禽流感病毒監(jiān)測將有助于預(yù)防和應(yīng)對新疫情爆發(fā)。
【學(xué)位授予單位】：華東師范大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號】：S852.65

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本文編號：1291153