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二倍體馬鈴薯DM及幾個野生近緣種染色體識別和比較FISH的分析

發(fā)布時間:2017-12-07 02:03

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【摘要】:馬鈴薯是世界上僅次于小麥、水稻的重要作物。雖然二倍體栽培種富利亞薯(Solanum phureja,2n=24)DM已經(jīng)完成測序工作,極大地推動了馬鈴薯基因組研究。然而由于二代測序和組裝的局限性,我們對串聯(lián)重復(fù)序列在栽培馬鈴薯及其野生近緣種染色體上的位置、分布以及豐度等信息不完全清楚。此外,現(xiàn)代細(xì)胞生物學(xué)染色體精確識別技術(shù)已廣泛在多物種中建立,相對其他作物,該技術(shù)在栽培二倍體馬鈴薯及其野生近緣種中還未建立。本文利用12個來自S.tuberosum已知連鎖群的BAC克隆,結(jié)合rDNA重復(fù)序列(5SrDNA 和 45SrDNA)、著絲粒重復(fù)序列(St18、St49、St57 和 St3-294)和亞端粒重復(fù)序列(CL14和CL34)作為探針,與DM有絲分裂中期染色體進(jìn)行熒光原位雜交,確定了這些重復(fù)序列在不同染色體連鎖群上的分布、位置和信號強(qiáng)度。建立了二倍體馬鈴薯DM染色體識別圖和遺傳連鎖圖的聯(lián)系。結(jié)合以上重復(fù)序列在染色體上的分布特點(diǎn),選取一個著絲粒重復(fù)序列(St3-238)、兩個rDNA重復(fù)序列(5SrDNA和45SrDNA)以及兩個亞端粒重復(fù)序列(CL14和CL34)作為探針并進(jìn)行多色熒光標(biāo)記,在DM有絲分裂中期同一分裂相上進(jìn)行兩次連續(xù)的多色熒光原位雜交,讓二倍體DM的每一條染色體都帶上不同的信號,達(dá)到精確識別DM的不同染色體的目的。建立了二倍體馬鈴薯一次性染色體辨認(rèn)技術(shù)。此外,將已建立的DM染色體識別體系,推廣到其他幾個二倍體野生近緣種全套染色體辨認(rèn)工作和比較FISH的分析中;發(fā)現(xiàn)重復(fù)序列St49在多個野生種中都有信號,證明它較為保守,在進(jìn)化中未發(fā)生大的變化;亞端粒重復(fù)序列CL14和CL34在幾個野生種中分布、強(qiáng)弱變化很大,說明在進(jìn)化中發(fā)生了缺失或重組。本研究對增進(jìn)二倍體馬鈴薯DM及其野生近緣種基因組的結(jié)構(gòu)的了解有意義,對推動馬鈴薯現(xiàn)代細(xì)胞遺傳學(xué)的研究有貢獻(xiàn)。該馬鈴薯染色體識別技術(shù)的建立將成為馬鈴薯染色體工程、多倍體進(jìn)化和細(xì)胞遺傳等研究的重要工具。
【學(xué)位授予單位】:內(nèi)蒙古大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:S532

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1 馬騫;利用中高度重復(fù)序列和分子標(biāo)記對栽培稻與幾個野生稻基因組的比較分析[D];中南民族大學(xué);2009年



本文編號:1260731

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