本文關(guān)鍵詞：南江黃羊瘦素基因LEP遺傳多態(tài)性及其與生長性狀的關(guān)聯(lián)分析

  更多相關(guān)文章： 山羊 瘦素基因 生長性能 多態(tài)性 關(guān)聯(lián)分析

【摘要】：瘦素基因(leptin,LEP)編碼的蛋白質(zhì)主要參與哺乳動物繁殖功能、動物體重和機(jī)體能量平衡等方面的調(diào)節(jié)。本研究以南江黃羊(n=267),簡州大耳羊(n=36),美姑山羊(n=37),藏山羊(n=41)和川南黑山羊(n=30)共5個山羊品種為試驗(yàn)材料,研究LEP基因單核苷酸的多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP),并分析南江黃羊LEP基因的SNP位點(diǎn)與生長性狀的關(guān)聯(lián)性。主要研究結(jié)果如下：1.LEP基因在5個山羊品種中共檢測到6個SNP位點(diǎn)(g.117TC,g.1642GA,g.2883GA,g.3053.TC,g.3190GA和g.3314TC).主要等位基因頻率范圍為0.583～0.987,各位點(diǎn)基因型分布存在顯著性差異。觀測雜合度和期望雜合度分別為0.026～0.533和0.026～0.497,PIC為0.025～0.370,呈低度或中度多態(tài)性,有較大的選擇潛力�？ǚ�(X2)檢驗(yàn)表明,LEP基因的6個SNP位點(diǎn)均處于哈迪-溫伯格平衡狀態(tài)(P0.05)。2.LEP基因在5個山羊品種中總共檢測到15種單倍型,主要單倍型頻率為0.083～0.244。連鎖不平衡(LD block)分析表明,兩個培育品種(南江黃羊和簡州大耳羊)的LEP基因SNP存在明顯的連鎖不平衡。3.統(tǒng)計(jì)分析表明LEP基因的6個SNP與南江黃羊生長性狀存在關(guān)聯(lián)性。在g.117TC位點(diǎn),TT基因型個體的24月齡體重和胸圍顯著高于CC基因型個體(P0.05)。在g.1642GA和g.2883GA位點(diǎn)的GG基因型個體在出生重(2.38±0.03kg,2.45±0.05 kg)和2月齡體重(10.59±0.16kg,10.71±0.26 kg)顯著高于AA基因型或GA基因型個體(P0.05)。在g.3053TC和g.3190GA位點(diǎn),突變純合基因型個體的24月齡體長顯著高于其他基因型個體(P0.05)。在g.3314TC位點(diǎn),TT型個體出生體重顯著高于其他兩種基因型個體(P0.05),而CC型個體在6月齡體長和體高顯著高于TC型個體(P0.05)。4.基因型關(guān)聯(lián)分析表明：攜帶H2H3基因型個體初生重和2月齡體重最高,其他所有生長性狀中表現(xiàn)最好是攜帶H1H5基因型的個體。5.研究結(jié)果表明,LEP基因可能是影響山羊的生長性狀的重要候選基因。該基因突變位點(diǎn)與南江黃羊的生長性狀間有一定的相關(guān)性,可以作為山羊分子育種的輔助選擇標(biāo)記。
【關(guān)鍵詞】：山羊 瘦素基因 生長性能 多態(tài)性 關(guān)聯(lián)分析
【學(xué)位授予單位】：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：S827
【目錄】：

• 摘要5-6
• Abstract6-8
• 英文符號說明8-11
• 1 文獻(xiàn)綜述11-21
• 1.1 研究背景11
• 1.2 分子標(biāo)記技術(shù)及應(yīng)用11-12
• 1.3 畜禽生長性狀的重要候選基因12-14
• 1.4 LEP基因研究概況14-17
• 1.4.1 LEP的發(fā)現(xiàn)與染色體定位14
• 1.4.2 LEP的生物學(xué)功能14-15
• 1.4.3 LEP在家畜中的研究進(jìn)展15-17
• 1.5 南江黃羊簡介17-20
• 1.5.1 南江黃羊培育史況17
• 1.5.2 南江黃羊外貌特征17
• 1.5.3 南江黃羊主要生產(chǎn)性能17-18
• 1.5.4 南江黃羊的適應(yīng)性和推廣應(yīng)用18-20
• 1.6 本研究的目的意義20-21
• 2 材料和方法21-25
• 2.1 試驗(yàn)材料21-23
• 2.1.1 血樣采集21
• 2.1.2 生產(chǎn)性能測定21
• 2.1.3 主要儀器設(shè)備與試劑21-22
• 2.1.4 數(shù)據(jù)分析軟件22-23
• 2.2 試驗(yàn)方法23-25
• 2.2.1 血液DNA提取23
• 2.2.2 血液DNA的質(zhì)量檢測23
• 2.2.3 引物設(shè)計(jì)23-24
• 2.2.4 PCR擴(kuò)增24
• 2.2.5 PCR-RFLP分析24-25
• 3 試驗(yàn)結(jié)果25-45
• 3.1 南江黃羊生長性能25-26
• 3.2 基因組DNA的質(zhì)量檢測26
• 3.3 引物序列26-28
• 3.4 目的片段擴(kuò)增結(jié)果28
• 3.5 測序與分析28-31
• 3.6 擴(kuò)增產(chǎn)物酶切分型31-32
• 3.7 LEP基因的多態(tài)性分析32-38
• 3.8 LEP基因單倍型及連鎖不平衡分析38-40
• 3.9 LEP基因SNP位點(diǎn)與南江黃羊生長性狀的關(guān)聯(lián)分析40-43
• 3.10 LEP基因型與南江黃羊生長性狀的關(guān)聯(lián)分析43-45
• 4 討論45-47
• 4.1 南江黃羊生長性狀45
• 4.2 LEP基因遺傳多態(tài)性45-46
• 4.3 單倍型分析和連鎖不平衡分析46
• 4.4 LEP基因SNP位點(diǎn)與南江黃羊生長性狀的關(guān)聯(lián)性分析46-47
• 5 結(jié)論47-49
• 參考文獻(xiàn)49-54
• 致謝54-55
• 攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文題目55

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