HBV基因變異在HBV相關(guān)原發(fā)性肝細(xì)胞癌中的臨床意義研究
發(fā)布時(shí)間:2017-08-20 22:34
本文關(guān)鍵詞:HBV基因變異在HBV相關(guān)原發(fā)性肝細(xì)胞癌中的臨床意義研究
更多相關(guān)文章: 肝細(xì)胞癌 cccDNA total DNA HBeAg HBsAg 二代測(cè)序
【摘要】:肝細(xì)胞癌(Hepatocellular carcinoma, HCC)是一種肝細(xì)胞來源的原發(fā)性肝癌。世界范圍內(nèi)HCC每年發(fā)病率約為750000例,并且HCC在男性中位居全球第五位常見腫瘤,在女性中位居第七位常見腫瘤。乙型肝炎病毒(HBV)感染是HCC發(fā)生發(fā)展的主要危險(xiǎn)因素。乙肝病毒的進(jìn)化動(dòng)態(tài)學(xué)的特點(diǎn)是高突變率(10-5核苷酸替換/位點(diǎn)/年),主要是由于乙肝病毒的易于出錯(cuò)的逆轉(zhuǎn)錄酶(reverse transcriptase, RT)和其快速的復(fù)制率(1011顆粒/天)。文獻(xiàn)報(bào)告這些大量發(fā)生的乙肝病毒突變可能會(huì)產(chǎn)生重要的生物學(xué)影響,并且研究已發(fā)現(xiàn)其與肝細(xì)胞癌的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。乙肝病毒共價(jià)閉合環(huán)狀DNA(covalently closed circular DNA, cccDNA)是HBV基因組的一種高度穩(wěn)定的存在形式。其主要作為病毒mRNA和pgRNA的轉(zhuǎn)錄模板,也是病毒感染和復(fù)制的重要標(biāo)志,被公認(rèn)為HBV持續(xù)感染和肝臟進(jìn)行性病理改變的根本原因。乙肝病毒的cccDNA和HBV基因變異一直是相關(guān)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn),而乙肝病毒cccDNA和HBV基因變異的關(guān)系及其對(duì)肝癌的風(fēng)險(xiǎn)尚不清楚。第一部分:HBsAg陰性肝細(xì)胞癌患者肝內(nèi)HBV DNAs水平研究本研究旨在探討中國(guó)HBsAg和HBeAg均陰性的原發(fā)性肝癌患者中乙肝病毒在肝細(xì)胞內(nèi)(癌與癌旁)的狀態(tài)和水平,以及HBsAg、HBeAg均陰性的原發(fā)性肝癌患者中的隱匿性乙肝感染(OBI)的臨床特征和OBI對(duì)預(yù)后的影響。我們采用實(shí)時(shí)熒光定量TaqMan PCR方法,定量檢測(cè)11對(duì)(HBsAg陰性)和57對(duì)(HBsAg陽性)腫瘤組織(TT)和癌旁組織(ANTT)的乙肝病毒共價(jià)閉合環(huán)狀DNA(cccDNA)和總DNA(tDNA)。這68例HBeAg陰性的HCC患者HCV抗體陰性、術(shù)前沒有接受過抗病毒治療。結(jié)果顯示11例HBsAg(-)患者中,36%的患者HBsAb(+) HBeAb(+) HBcAb(+)。然而,只有9%的表面抗原陰性的患者是HBsAb(-) HBeAb(+) HBcAb(+),而這種類型在表面抗原(+)組占絕大多數(shù)(93%)。11例HBsAg(-)和HBeAg(-)HCC患者的TT和ANTT HBV tDNAs都可檢測(cè)。HBsAg(-)組的乙肝病毒cccDNA和tDNA低于HBsAg(+)組。OBI的患者有較低的肝硬化的風(fēng)險(xiǎn)。結(jié)論:肝內(nèi)HBV DNAs,例如HBV cccDNA和tDNA對(duì)HCC的隱匿性乙肝感染診斷和隨訪監(jiān)測(cè)中具有重要的意義,在未來轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中可輔助臨床醫(yī)師病因分析治療、建立預(yù)防乙型肝炎病毒再激活的個(gè)體化治療方案。第二部分:HBsAg陽性肝細(xì)胞癌患者肝內(nèi)HBV DNAs水平與HBV突變的相關(guān)性研究本研究旨在探討HBV肝內(nèi)DNAs和病毒變異在HCC發(fā)生發(fā)展過程中的變化,我們進(jìn)行了較大樣本的縱向研究。首先探討在肝癌患者(HBsAg陽性)的肝內(nèi)(TT和ANTT)乙肝病毒變異和病毒水平之間的關(guān)系。其次探討HBsAg陽性的HCC患者的臨床特征和乙肝病毒變異對(duì)HCC患者術(shù)后預(yù)后的影響。我們對(duì)106例HBV相關(guān)HCC腫瘤組織和鄰近的癌旁組織通過實(shí)時(shí)熒光PCR TaqMan探針法檢測(cè)組織中HBVcccDNA和tDNAo采用PCR擴(kuò)增后測(cè)序方法檢測(cè)HBV全基因組的突變位點(diǎn)。用單變量和多變量回歸法分析影響肝癌復(fù)發(fā)和生存的風(fēng)險(xiǎn)因素。研究發(fā)現(xiàn)患者乙肝病毒基因組pre-S1區(qū)A2962G/C2964A和pre-S2區(qū)C105T變異體有顯著較高的腫瘤HBVcccDNA的水平,而BCP C1766T突變體有較低的腫瘤HBV cccDNA的水平。A2962G /C2964A突變與AFP水平較高有關(guān)。結(jié)論:本研究對(duì)揭示HBV相關(guān)原發(fā)性肝癌中乙肝病毒基因組特征,實(shí)現(xiàn)臨床個(gè)性化病程監(jiān)測(cè)和指導(dǎo)乙型肝炎病毒相關(guān)HCC患者的預(yù)后判斷提供了重要的理論依據(jù)。第三部分:基于二代測(cè)序的HBV pre-S基因變異在HBV相關(guān)原發(fā)性肝癌中的臨床意義研究本研究旨在一代測(cè)序的基礎(chǔ)上,通過二代測(cè)序這一高靈敏度和高通量的新技術(shù),針對(duì)具有重要功能意義的pre-S區(qū)段進(jìn)行深度測(cè)序。對(duì)HBV pre-S基因變異和原發(fā)性肝癌二者之間的相關(guān)性進(jìn)行探索,從而闡述HBV pre-S基因變異在原發(fā)性肝癌(HCC)發(fā)生發(fā)展中的作用及意義。研究發(fā)現(xiàn)在HCC和慢性乙肝患者(CHB)體內(nèi)的HBV均是以B/C混合型為主;HCC患者的pre-S區(qū)域的HBV基因復(fù)雜度明顯高于CHB患者;HBV cccDNA水平分別與HBV基因型A和B所占百分比(構(gòu)成比)成負(fù)相關(guān)(r=-0.369,P= 0.001; r=-0.274, P= 0.012),而與C型構(gòu)成比成正相關(guān)(r=0.338,P=0.002)。然而在HCC患者的癌旁組織中,HBV cccDNA水平與HBV基因型A,B和C型構(gòu)成比均無明顯相關(guān)性;在CHB組中,血清中HBV缺失片段主要集中在nt 2850-2863和nt 2-55。在HCC組中,癌與癌旁組織的HBV缺失片段主要集中在nt 2850-2863, nt 2889-2951, nt 3051-3078, nt 7-27和nt 40-54;血清中的HBV缺失片段主要集中在nt 2850-2864,nt 3152-3197和nt 40-52。文獻(xiàn)報(bào)道pre-S突變蛋白可以激活依賴內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激信號(hào)途徑和不依賴內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激信號(hào)途徑,從而參與HCC的發(fā)生發(fā)展,具體機(jī)制有待深入研究。此外,HCC患者體內(nèi)HBV pre-S區(qū)的片段缺失情況也明顯高于CHB患者。我們將二代測(cè)序技術(shù)用于乙型肝炎病毒的序列,復(fù)雜度,基因型和缺失片段等方面的研究,可以改變既往一代測(cè)序技術(shù)在HBV病毒方面的局限性和不足,不僅有利于更加真實(shí)和準(zhǔn)確地反映病毒在體內(nèi)的狀況,推進(jìn)個(gè)性化輔助診斷,還將有利于臨床指導(dǎo)隨訪、預(yù)后判斷,在臨床轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中有可能為未來的個(gè)體化治療方案的制定提供幫助。綜上所述,通過本課題的研究,我們發(fā)現(xiàn)HBV cccDNA, HBV突變與HCC的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān);肝內(nèi)HBV DNAs作為乙肝感染的重要標(biāo)志物在原發(fā)性肝細(xì)胞癌動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)、療效評(píng)價(jià)中具有潛在的應(yīng)用前景;同時(shí)二代測(cè)序技術(shù)有望對(duì)臨床個(gè)性化治療和乙型肝炎病毒有關(guān)HCC患者的預(yù)后判斷、實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)醫(yī)療提供新的重要技術(shù)手段。
【關(guān)鍵詞】:肝細(xì)胞癌 cccDNA total DNA HBeAg HBsAg 二代測(cè)序
【學(xué)位授予單位】:第二軍醫(yī)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R735.7;R512.62
【目錄】:
- 中文摘要5-8
- Abstract8-10
- 文中常用縮略詞表10-12
- 引言12-15
- 第一部分 HBsAg陰性肝細(xì)胞癌患者肝內(nèi)HBV DNAs水平研究15-29
- 一、前言15-16
- 二、材料與方法16-20
- 三、實(shí)驗(yàn)結(jié)果20-26
- 四、討論26-29
- 第二部分 HBsAg陽性肝細(xì)胞癌患者肝內(nèi)HBV DNAs水平與HBV突變的相關(guān)性研究29-46
- 一、前言29-30
- 二、材料與方法30-33
- 三、實(shí)驗(yàn)結(jié)果33-44
- 四、討論44-46
- 第三部分 基于二代測(cè)序的HBV pre-S基因變異在HBV相關(guān)原發(fā)性肝癌中的臨床意義研究46-94
- 一、前言46-48
- 二、材料與方法48-62
- 三、實(shí)驗(yàn)結(jié)果62-90
- 四、討論90-94
- 研究工作小結(jié)94-96
- References96-107
- 綜述107-119
- 參考文獻(xiàn)111-119
- 在讀期間發(fā)表論文情況119-120
- 致謝120
本文編號(hào):709304
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