癲癇血漿蛋白質(zhì)組學(xué)分析及相關(guān)基因功能鑒定
【文章頁(yè)數(shù)】:138 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖2.1 TMT定量蛋白質(zhì)組原理及技術(shù)流程
TMT(TandemMassTags)技術(shù)是由美國(guó)Thermo公司研發(fā)的一種多肽體外標(biāo)記定量技術(shù)。此類技術(shù)最多可采用10種穩(wěn)定同位素標(biāo)簽,通過特異性標(biāo)記多肽的氨基基團(tuán),然后進(jìn)行串聯(lián)質(zhì)譜分析,可同時(shí)比較多達(dá)10種不同樣本中蛋白質(zhì)的相對(duì)含量。TMT技術(shù)是常用的差異蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)、....
圖3.1本章的總體流程圖
本章的主要內(nèi)容包括以下四個(gè)方面:⑴入組病人及對(duì)照組的臨床信息采集;⑵各組血漿標(biāo)本的收集;⑶蛋白的提取及鑒定;⑷差異表達(dá)蛋白的生物信息學(xué)分析。本章的總體流程圖,如圖3.1所示。3.2實(shí)驗(yàn)材料
圖3.2.質(zhì)譜數(shù)據(jù)的質(zhì)控確認(rèn)
圖3.2中展示的是質(zhì)譜數(shù)據(jù)的質(zhì)控檢測(cè)結(jié)果。首先,我們檢測(cè)了所有鑒定到的肽段的質(zhì)量偏移(masserror)(圖3.2A)。質(zhì)量誤差以0為中軸并且集中在低于10ppm的范圍內(nèi),說明質(zhì)量誤差符合要求。其次,絕大部分的肽段長(zhǎng)度分布在8-20個(gè)氨基酸殘基之間(圖3.2B),符合胰酶消....
圖3.2.質(zhì)譜數(shù)據(jù)的質(zhì)控確認(rèn)
圖3.2.質(zhì)譜數(shù)據(jù)的質(zhì)控確認(rèn)3.3.11生物信息學(xué)分析
本文編號(hào):4042609
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