第一部分:潰瘍性結(jié)腸炎患者及其健康配偶腸道菌群結(jié)構(gòu)及多樣性的分析——基于16S rRNA基因測(cè)序技術(shù)的研究[目 的]利用16S rRNA基因測(cè)序技術(shù)進(jìn)行UC患者及其健康配偶腸道菌群結(jié)構(gòu)及多樣性分析,揭示UC患者及其健康配偶腸道菌群的差異性。[方 法]收集初發(fā)型、輕中度UC患者及其健康配偶各28人的糞便及腸道粘膜,共計(jì)56例,其中男性女性各28人,城市農(nóng)村各28人。提取DNA,PCR擴(kuò)增后通過(guò)Illumina測(cè)序儀(25,000tags,MiSeq 平臺(tái))進(jìn)行 16S rRNAV3-V4 區(qū)測(cè)序。對(duì)16S rRNA 測(cè)序結(jié)果進(jìn)行生物學(xué)信息分析。[結(jié) 果]1.聚類OTU與物種注釋:112個(gè)樣品共產(chǎn)生1129個(gè)OTU,門水平上,主要由擬桿菌門(Bacteroidetes)、厚壁菌門(Firmicutes)和變形菌門(Proteobacteria)組成,涉及到11個(gè)菌屬擬桿菌屬(Bacteroides)、普雷沃菌屬(Prevotella)、埃希氏桿菌屬(Escherichia)、糞桿菌屬(Faecalibacterium)、羅斯氏菌屬(Roseburia)、乳球菌屬(Lactococcus)、...

【文章頁(yè)數(shù)】：140 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

圖１總體工作流程圖??

圖８?ＵＣ患者腸道菌群的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)??５?ＵＣ患者及其健康配偶共有獨(dú)有的菌群分析??將樣本分組后的ＯＴＵ物種注釋進(jìn)行比對(duì)，發(fā)現(xiàn)健康對(duì)照組糞便樣本（ＦＨ）??

圖９?ＯＴＵ維恩圖??（ＦＨ，健康對(duì)照組糞便樣本；?ＦＵ，潰瘍性結(jié)腸炎組糞便樣本；??ＭＨ，健康對(duì)照組腸粘膜樣本；ＭＵ，潰瘍性結(jié)腸炎組腸粘膜樣本）??

圖１０腸道菌群Ａｌｐｈａ多樣性不同指數(shù)的稀釋曲線??（Ｓｈｆ，健康對(duì)照組糞便樣本；?Ｓｐｆ，潰瘍性結(jié)腸炎組糞便樣本；??

本文編號(hào)：3886125