本文關(guān)鍵詞：抑郁癥外周血特異lncRNAs的篩選與驗(yàn)證，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的:抑郁癥是人類常見的精神障礙之一,其發(fā)病及病理機(jī)制迄今未明。非編碼RNA作為重要的表觀遺傳學(xué)調(diào)控機(jī)制之一,在其中發(fā)揮重要作用。長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)是一種數(shù)量最多、具有強(qiáng)大的基因調(diào)控功能的非編碼RNA。研究顯示,lncRNA參與神經(jīng)可塑性調(diào)節(jié),同時(shí)在其他精神疾病中存在異常表達(dá),結(jié)合“抑郁癥是一種神經(jīng)可塑性障礙的精神疾病”的既往發(fā)現(xiàn),我們提出“抑郁癥存在異常的lncRNAs表達(dá)及調(diào)控”的科學(xué)假說(shuō)。本研究中,我們?cè)谝钟舭Y外周血中開展了對(duì)抑郁癥特異lncRNAs的篩選及驗(yàn)證工作。方法:1.初篩差異lncRNAs:收集抑郁癥與正常對(duì)照各10例,在其外周血中利用生物芯片進(jìn)行l(wèi)ncRNAs與mRNAs的表達(dá)譜分析,篩選出組間差異的lncRNAs與mRNAs;2.確定候選lncRNAs:通過(guò)構(gòu)建差異lncRNAs與m RNAs的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),確定抑郁癥的候選lncRNAs;3.驗(yàn)證特異lncRNAs:選擇抗抑郁療效確切的抑郁癥及對(duì)照各27例,分析候選lncRNAs在患者治療前后的表達(dá)變化及與臨床指標(biāo)的相關(guān)性,確定抑郁癥特異lncRNAs。結(jié)果:1.初篩差異lncRNAs:1)芯片初篩結(jié)果發(fā)現(xiàn)抑郁癥存在特異的lncRNAs和mRNAs表達(dá)譜�；颊呓M與對(duì)照組相比,共發(fā)現(xiàn)2007條差異lncRNAs有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p0.05),其中包括1556條上調(diào)lncRNAs和441條下調(diào)lncRNAs。此外,有1799條差異lncRNAs為反義lncRNA。同時(shí)發(fā)現(xiàn)1766條差異mRNAs有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p0.05),其中包括759條上調(diào)mrnas和1007條下調(diào)mrnas。2)為了對(duì)芯片檢測(cè)的準(zhǔn)確性進(jìn)行驗(yàn)證,我們?cè)谠瓨颖局袑?duì)lncrna-fr344886,chr21:39641845-39641964,chr17:78355675-78355935,chr17:78354412-78354623進(jìn)行realtimepcr檢測(cè),結(jié)果顯示與芯片結(jié)果基本一致。2.確定候選lncrnas:1)建立差異lncrnas和mrnas的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)(r≥o.94),病例組共納入125條lncrnas與374條mrnas,形成499個(gè)節(jié)點(diǎn)和1050對(duì)相關(guān)關(guān)系,其中包括802個(gè)負(fù)相關(guān)關(guān)系對(duì)和248個(gè)正相關(guān)關(guān)系對(duì);對(duì)照組共納入111條lncrnas與193條mrnas,形成304個(gè)節(jié)點(diǎn)和415對(duì)相關(guān)關(guān)系,其中包括346個(gè)負(fù)相關(guān)關(guān)系對(duì)和70個(gè)正相關(guān)關(guān)系對(duì)�？梢�,病例組中mrnas與lncrnas的相互調(diào)控關(guān)系更加復(fù)雜,兩組中mrnas與lncrnas的負(fù)性調(diào)控占主導(dǎo)作用。2)在以上共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)中篩選既往報(bào)道與抑郁相關(guān)的mrnas,將與其存在共表達(dá)關(guān)系的lncrnas作為抑郁癥的候選lncrnas。在進(jìn)一步構(gòu)建的抑郁相關(guān)差異mrnas與lncrnas的共表達(dá)子網(wǎng)絡(luò)中,將病例組中“度”最高的lncrnaschr10:874695-874794,chr10:75873456-75873642,chr3:47048304-47048512,確定為抑郁癥的候選lncrnas。3)此外,對(duì)差異mrnas的go與pathway分析發(fā)現(xiàn),抑郁癥的差異基因主要與物質(zhì)新陳代謝的基本過(guò)程與神經(jīng)發(fā)育障礙疾病有關(guān)。3.驗(yàn)證特異lncrnas:另外收集抑郁癥患者50例,選擇抗抑郁療效確定的27例,在其治療8周前后的外周血中,檢測(cè)三個(gè)候選lncrnas的表達(dá)變化,并分析其與臨床特征的關(guān)系。結(jié)果顯示,與對(duì)照組相比,患者組在治療前l(fā)ncrnachr10:874695-874794表達(dá)明顯降低(p=0.0001),而治療后明顯升高(p=0.001);同時(shí)發(fā)現(xiàn)治療前后的表達(dá)水平均與hamd總分呈負(fù)相關(guān)(r=-0.588,p=0.001;r=-0.552,p=0.003);治療前的表達(dá)水平與患者注意功能呈正相關(guān)(r=-0.61,p=0.003)。chr10:75873456-75873642的表達(dá)水平雖然在治療前與對(duì)照組無(wú)明顯差異,但在治療后明顯升高(p=0.005),且與治療后即刻記憶呈正相關(guān)。結(jié)論:本研究首次發(fā)現(xiàn)抑郁癥外周血中存在特異的lncRNAs表達(dá)譜,并通過(guò)與mRNAs的共表達(dá)分析確定了抑郁癥相關(guān)的候選lncRNAs,經(jīng)臨床驗(yàn)證后發(fā)現(xiàn)lncRNA chr10:874695-874794參與了抑郁癥的發(fā)病及治療過(guò)程,并與抑郁嚴(yán)重程度及注意功能相關(guān)。這一發(fā)現(xiàn)將為抑郁癥發(fā)病機(jī)制的研究提供新的思路和參考依據(jù)。未來(lái)需要擴(kuò)大樣本及通過(guò)功能學(xué)實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證。
【關(guān)鍵詞】：抑郁癥 長(zhǎng)鏈非編碼RNA 生物芯片 共表達(dá)
【學(xué)位授予單位】：山西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：R749.4
【目錄】：

• 中文摘要5-8
• 英文摘要8-11
• 常用縮寫詞中英文對(duì)照表11-13
• 前言13-31
• 1 材料與方法31-47
• 1.1 臨床資料收集及評(píng)定31-33
• 1.2 實(shí)驗(yàn)室研究材料33-36
• 1.3 實(shí)驗(yàn)方法36-47
• 2 結(jié)果47-71
• 2.1 外周血lncRNA與mRNA的芯片掃描結(jié)果47-52
• 2.2 差異mRNAs與lncRNAs的生物信息學(xué)分析52-65
• 2.3 抑郁癥特異lncRNAs的臨床驗(yàn)證及意義65-71
• 3 討論71-78
• 3.1 關(guān)于研究方法的考慮71-72
• 3.2 抑郁癥特異的mRNAs與lncRNAs表達(dá)譜分析72-76
• 3.3 抑郁癥特異lncRNAs的臨床驗(yàn)證及意義76-78
• 4 結(jié)論78-80
• 參考文獻(xiàn)80-104
• 綜述104-112
• 參考文獻(xiàn)109-112
• 致謝112-113
• 在學(xué)期間承擔(dān)/參與的科研課題與研究成果113-115
• 個(gè)人簡(jiǎn)歷115

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 翟金國(guó);陳敏;趙靖平;國(guó)效峰;蘇中華;王克勤;;山東省抑郁障礙患者的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)研究[J];中國(guó)衛(wèi)生經(jīng)濟(jì);2011年10期

  本文關(guān)鍵詞：抑郁癥外周血特異lncRNAs的篩選與驗(yàn)證，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

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本文編號(hào)：384690