兒童ALL的非靶向和靶向代謝組學(xué)研究初探
發(fā)布時(shí)間:2023-06-04 20:14
背景及目的:代謝組學(xué)通過全面定性、定量地分析血液、尿液、糞便和組織中的代謝物的濃度及其代謝通路變化,最直接真實(shí)地反映人體的健康和疾病狀態(tài),以期能夠早期預(yù)警和反映疾病的程度,是系統(tǒng)生物學(xué)所有“omics”研究中最能預(yù)測(cè)表型的技術(shù)手段。本研究采用代謝組學(xué)研究技術(shù)手段和理論知識(shí),通過非靶向和靶向代謝組學(xué)研究模式分析急性淋巴細(xì)胞白血病(ALL)患兒的體液和糞便樣本,研究其內(nèi)源性小分子代謝物的變化規(guī)律,以期篩選有助于指導(dǎo)臨床診斷和治療的潛在生物標(biāo)志物。方法:第一部分實(shí)驗(yàn)中研究對(duì)象分為以下三組:對(duì)照組20例,為疑似腦炎但腦脊液(CSF)常規(guī)和生化檢查正常的CSF樣本;ALL未發(fā)生中樞轉(zhuǎn)移組31例,其中15例為CSF病理及流式檢查結(jié)果雙陰性樣本,16例為病理檢測(cè)結(jié)果陰性且CSF常規(guī)中白細(xì)胞數(shù)為0的樣本;中樞神經(jīng)系統(tǒng)白血病(CNSL)組13例,CSF病理檢測(cè)結(jié)果或者流式檢測(cè)結(jié)果為陽(yáng)性;本實(shí)驗(yàn)還對(duì)其中一例CNSL患兒不同化療階段的CSF樣本進(jìn)行了追蹤測(cè)定。我們采用非靶向代謝組學(xué)模式模式,探索最恰當(dāng)?shù)纳V和質(zhì)譜參數(shù),建立超高效液相色譜-四極桿組合軌道離子阱質(zhì)譜(UPLC-QE/MS)技術(shù)檢測(cè)上述樣本。采用...
【文章頁(yè)數(shù)】:112 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
中英文縮略詞表
第一章 綜述
1.1 代謝組學(xué)概述
1.2 代謝組學(xué)的研究方法
1.2.1 樣品的采集和制備
1.2.2 代謝物的分析與檢測(cè)
1.2.3 數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)處理和分析
1.2.4 代謝組學(xué)相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)
1.3 代謝組學(xué)在白血病研究中的應(yīng)用
1.4 結(jié)論
第二章 基于UPLC-QE/MS技術(shù)的急性淋巴細(xì)胞白血病患兒腦脊液非靶向代謝組學(xué)研究
2.1 引言
2.2 儀器與試劑
2.2.1 試劑
2.2.2 儀器
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 患兒臨床資料總結(jié)
2.3.2 溶液制備
2.3.3 CSF樣品前處理
2.3.4 色譜條件
2.3.5 質(zhì)譜條件
2.3.6 數(shù)據(jù)預(yù)處理
2.3.7 多元統(tǒng)計(jì)分析
2.4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.4.1 LC-MS代謝組學(xué)方法學(xué)考察結(jié)果
2.4.2 數(shù)據(jù)預(yù)處理
2.4.3 正離子監(jiān)測(cè)模式下的分析結(jié)果
2.4.4 負(fù)離子監(jiān)測(cè)模式下的分析結(jié)果
2.4.5 生物標(biāo)志物的篩選
2.4.6 預(yù)測(cè)中樞轉(zhuǎn)移生物標(biāo)志物的篩選
2.5 討論
2.6 本章結(jié)論
第三章 基于UPLC-MS/MS技術(shù)的ALL患兒血清和糞便膽汁酸濃度的靶向代謝組學(xué)研究
3.1 引言
3.2 材料與方法
3.2.1 樣本的采集
3.2.2 試劑
3.2.3 儀器
3.3 血清和糞便中膽汁酸含量的UPLC-MS/MS測(cè)定
3.3.1 溶液配制
3.3.2 樣本前處理
3.3.3 色譜質(zhì)譜條件
3.3.4 數(shù)據(jù)處理及多元數(shù)據(jù)分析
3.4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.4.1 膽汁酸標(biāo)準(zhǔn)溶液、血清和糞便樣本的總離子和提取離子色譜圖
3.4.2 方法學(xué)定量結(jié)果
3.4.3 多元統(tǒng)計(jì)分析
3.5 討論
3.5.1 膽汁酸與多種腫瘤的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān)
3.5.2 與ALL發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān)的膽汁酸
3.6 本章結(jié)論
全文總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
在學(xué)期間研究成果
一、發(fā)表論文
二、主要課題
三、獲得榮譽(yù)
致謝
本文編號(hào):3830937
【文章頁(yè)數(shù)】:112 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
中英文縮略詞表
第一章 綜述
1.1 代謝組學(xué)概述
1.2 代謝組學(xué)的研究方法
1.2.1 樣品的采集和制備
1.2.2 代謝物的分析與檢測(cè)
1.2.3 數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)處理和分析
1.2.4 代謝組學(xué)相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)
1.3 代謝組學(xué)在白血病研究中的應(yīng)用
1.4 結(jié)論
第二章 基于UPLC-QE/MS技術(shù)的急性淋巴細(xì)胞白血病患兒腦脊液非靶向代謝組學(xué)研究
2.1 引言
2.2 儀器與試劑
2.2.1 試劑
2.2.2 儀器
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 患兒臨床資料總結(jié)
2.3.2 溶液制備
2.3.3 CSF樣品前處理
2.3.4 色譜條件
2.3.5 質(zhì)譜條件
2.3.6 數(shù)據(jù)預(yù)處理
2.3.7 多元統(tǒng)計(jì)分析
2.4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.4.1 LC-MS代謝組學(xué)方法學(xué)考察結(jié)果
2.4.2 數(shù)據(jù)預(yù)處理
2.4.3 正離子監(jiān)測(cè)模式下的分析結(jié)果
2.4.4 負(fù)離子監(jiān)測(cè)模式下的分析結(jié)果
2.4.5 生物標(biāo)志物的篩選
2.4.6 預(yù)測(cè)中樞轉(zhuǎn)移生物標(biāo)志物的篩選
2.5 討論
2.6 本章結(jié)論
第三章 基于UPLC-MS/MS技術(shù)的ALL患兒血清和糞便膽汁酸濃度的靶向代謝組學(xué)研究
3.1 引言
3.2 材料與方法
3.2.1 樣本的采集
3.2.2 試劑
3.2.3 儀器
3.3 血清和糞便中膽汁酸含量的UPLC-MS/MS測(cè)定
3.3.1 溶液配制
3.3.2 樣本前處理
3.3.3 色譜質(zhì)譜條件
3.3.4 數(shù)據(jù)處理及多元數(shù)據(jù)分析
3.4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.4.1 膽汁酸標(biāo)準(zhǔn)溶液、血清和糞便樣本的總離子和提取離子色譜圖
3.4.2 方法學(xué)定量結(jié)果
3.4.3 多元統(tǒng)計(jì)分析
3.5 討論
3.5.1 膽汁酸與多種腫瘤的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān)
3.5.2 與ALL發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān)的膽汁酸
3.6 本章結(jié)論
全文總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
在學(xué)期間研究成果
一、發(fā)表論文
二、主要課題
三、獲得榮譽(yù)
致謝
本文編號(hào):3830937
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