目的:目前,我國每年出生缺陷率為5.6%左右,產(chǎn)前診斷做為二級預防措施,在降低出生缺陷率中具有重要作用。常規(guī)產(chǎn)前診斷手段包括超聲檢查,血清學篩查,介入性取材后進行遺傳學診斷等。傳統(tǒng)的介入性產(chǎn)前診斷有一定的流產(chǎn)風險,并可能出現(xiàn)宮內(nèi)感染等并發(fā)癥;血清學篩查準確度差,假陽性率可達到40%左右,許多孕婦因此而接受不必要的介入性產(chǎn)前診斷。為降低不必要的介入性取材引起的風險,快速準確的無創(chuàng)性產(chǎn)前篩查勢在必行。目前,利用二代測序技術(next-generation sequencing,NGS)無創(chuàng)性產(chǎn)前篩查(non-invasive prenatal test,NIPT)T21/18/13等染色體非整倍體疾病已經(jīng)大規(guī)模應用于臨床。大多數(shù)臨床研究只單純關注于NIPT的準確性,而未關注其實際臨床應用過程。由染色體病造成的出生缺陷中,除非整倍體外,還有一類就是由胎兒染色體拷貝數(shù)變異(copy number variations,CNVs)引起的基因組病。CNVs覆蓋人類基因組的12%左右,大部分位于基因沙漠區(qū),可以遺傳自父母或新發(fā)。大多數(shù)CNVs不會致病,但是當CNVs區(qū)域涉及到敏感基因或者其上游調(diào)控序...

【文章頁數(shù)】：70 頁

【學位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
英文縮略語
第一部分 :NIPT篩查胎兒非整倍體的臨床應用評估
    1 前言
    2 材料與方法
        2.1 研究對象
        2.2 NIPT實驗的主要試劑和儀器
            2.2.1 主要試劑
            2.2.2 主要儀器
            2.2.3 數(shù)據(jù)分析軟件
        2.3 NIPT實驗方法
            2.3.1 血漿分離
            2.3.2 胎兒游離DNA的提取
            2.3.3 文庫制備
            2.3.4 文庫qPCR定量
            2.3.5 上機樣品混合
            2.3.6 Nextseq CN500 上機文庫的變性和稀釋操作程序
        2.4 測序后數(shù)據(jù)分析
        2.5 病史資料統(tǒng)計分析
            2.5.1 病史資料的整理及分類
            2.5.2 數(shù)據(jù)的統(tǒng)計學分析
    3 結(jié)果
        3.1 病史資料的統(tǒng)計分析結(jié)果
            3.1.1 病史資料的一般特征
            3.1.2 無創(chuàng)性產(chǎn)前篩查指征及胎兒超聲的統(tǒng)計分析結(jié)果
        3.2 NIPT篩查非整倍體結(jié)果統(tǒng)計分析結(jié)果
            3.2.1 胎兒染色體為T21/18/13 高風險的病例資料統(tǒng)計分析結(jié)果
            3.2.2 胎兒性染色體異常高風險的病例資料統(tǒng)計分析結(jié)果
            3.2.3 NIPT篩查結(jié)果的統(tǒng)計學分析結(jié)果
        3.3 于NIPT篩查后接受介入性遺傳學診斷病例統(tǒng)計分析結(jié)果
    4 討論
    5 結(jié)論
第二部分 :探討NIPT篩查胎兒CNVs的臨床應用
    6 前言
    7 材料與方法
        7.1 研究對象
        7.2 主要試劑和儀器
            7.2.1 主要試劑
            7.2.2 主要儀器
            7.2.3 數(shù)據(jù)分析軟件
        7.3 NIPT篩查CNVs實驗方法
            7.3.1 血漿分離
            7.3.2 胎兒游離DNA的提取
            7.3.3 文庫制備
            7.3.4 文庫qPCR定量
            7.3.5 上機樣品混合
            7.3.6 Nextseq CN500 上機文庫的變性和稀釋操作程序
        7.4 測序后數(shù)據(jù)分析
        7.5 CNV-seq實驗方法
            7.5.1 基因組DNA的提取
            7.5.2 基因組DNA純化
            7.5.3 酶反應和純化
            7.5.4 擴增
            7.5.5 文庫純化和質(zhì)控
            7.5.6 上機測序
        7.6 測序后數(shù)據(jù)分析
        7.7 羊水染色體制備及核型分析
        7.8 病史資料統(tǒng)計分析
            7.8.1 病史資料的整理及分類
            7.8.2 數(shù)據(jù)的統(tǒng)計學分析
    8 結(jié)果
        8.1 病史資料統(tǒng)計分析結(jié)果
        8.2 NIPT結(jié)果與CNV-seq結(jié)果及胎兒核型對比分析結(jié)果
            8.2.1 NIPT異常組與CNV-seq結(jié)果及胎兒核型對比結(jié)果
            8.2.2 NIPT正常組與CNV-seq結(jié)果及胎兒核型對比結(jié)果
        8.3 NIPT篩查胎兒CNVs統(tǒng)計學分析結(jié)果
    9 討論
    10 結(jié)論
本研究創(chuàng)新性的自我評價
參考文獻
綜述
    參考文獻
攻讀學位期間取得的研究成果
致謝
個人簡歷



本文編號：3778205