第一部分:Hsa-mi R-MTCO3P38是來源于假基因MTCO3P38轉(zhuǎn)錄本的新micro RNA目的:發(fā)現(xiàn)原發(fā)性肝癌（HCC）組織中潛在的新微小RNA（micro RNA）并驗(yàn)證其序列與真實(shí)性。方法:小RNA深度測序分析肝癌患者與正常肝患者的手術(shù)后肝組織標(biāo)本,挑選差異表達(dá)于肝癌、肝癌旁組織和正常肝組織的新micro RNA（Hsa-mi R-MTCO3P38）。mi Rdeep2 2.0.0.5軟件和RNAstructure軟件對新micro RNA進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析預(yù)測。Northern blotting實(shí)驗(yàn)和DNA測序驗(yàn)證新mi RNA的序列與真實(shí)性。結(jié)果:Hsa-mi R-MTCO3P38（mi R-MTCO3P38）在肝癌組織中的深度測序讀取次數(shù)顯著低于肝癌旁組織（p<0.001,q<0.001）和正常肝組織（p<0.001,q<0.001）。Mi R-MTCO3P38位于假基因MTCO3P38序列上,經(jīng)預(yù)測具有穩(wěn)定的前體二級結(jié)構(gòu)（mi Rdeep2 score=1.4,p<0.05）。Northern blotting試驗(yàn)結(jié)果表明包含mi R-M... 

【文章來源】：武漢大學(xué)湖北省211工程院校985工程院校教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：76 頁

【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
論文創(chuàng)新點(diǎn)
摘要
ABSTRACT
1 引言
第一部分：Hsa-miR-MTCO3P38是來源于假基因MTCO3P38轉(zhuǎn)錄本的新micro-RNA
    2 材料與方法
        2.1 臨床樣本
        2.2 肝癌細(xì)胞株
        2.3 主要儀器和設(shè)備
        2.4 主要試劑
        2.5 主要溶液的配制
        2.6 實(shí)驗(yàn)過程
    3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        3.1 小RNA深度測序中miR-MTCO3P38的預(yù)測
        3.2 MiR-MTCO3P38序列和來源驗(yàn)證
        3.3 15個肝組織深度測序中miR-MTCO3P38的表達(dá)
    4 討論
第二部分：MiR-MTCO3P38在肝癌組織的表達(dá)與患者臨床資料關(guān)系及對肝癌細(xì)胞的侵襲遷移能力影響
    5 材料與方法
        5.1 臨床樣本
        5.2 人肝癌細(xì)胞系
        5.3 主要儀器和設(shè)備
        5.4 主要試劑
        5.5 主要試劑的配制
        5.6 實(shí)驗(yàn)步驟
    6 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        6.1 肝癌組織和肝癌細(xì)胞系中miR-MTCO3P38的表達(dá)
        6.2 MiR-MTCO3P38的表達(dá)和肝癌患者的臨床關(guān)系
        6.3 過表達(dá)miR-MTCO3P38對肝癌細(xì)胞生物學(xué)行為的影響
    7 討論
第三部分 ：MiR-MTCO3P38通過結(jié)合TMOD1 mRNA3’UTR下調(diào)TMOD1/MMP13通路抑制肝癌細(xì)胞侵襲遷移
    8 材料與方法
        8.1 細(xì)胞系
        8.2 主要儀器和設(shè)備
        8.3 主要試劑
        8.4 主要溶液的配制
        8.5 實(shí)驗(yàn)過程和步驟
    9 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        9.1 轉(zhuǎn)錄組學(xué)和生物信息學(xué)篩選miR-MTCO3P38 靶基因
        9.2 熒光素酶報告驗(yàn)證MiR-MTCO3P38的靶基因
        9.3 MiR-MTCO3P38通過TMOD1影響肝癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移
    10 討論
參考文獻(xiàn)
綜述 假基因調(diào)控腫瘤發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制
    參考文獻(xiàn)
攻博期間發(fā)表的科研成果
致謝



本文編號：3643142