Hsa-miR-MTCO3P38對(duì)肝癌細(xì)胞侵襲遷移能力的影響
發(fā)布時(shí)間:2022-02-24 16:54
第一部分:Hsa-mi R-MTCO3P38是來源于假基因MTCO3P38轉(zhuǎn)錄本的新micro RNA目的:發(fā)現(xiàn)原發(fā)性肝癌(HCC)組織中潛在的新微小RNA(micro RNA)并驗(yàn)證其序列與真實(shí)性。方法:小RNA深度測序分析肝癌患者與正常肝患者的手術(shù)后肝組織標(biāo)本,挑選差異表達(dá)于肝癌、肝癌旁組織和正常肝組織的新micro RNA(Hsa-mi R-MTCO3P38)。mi Rdeep2 2.0.0.5軟件和RNAstructure軟件對(duì)新micro RNA進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析預(yù)測。Northern blotting實(shí)驗(yàn)和DNA測序驗(yàn)證新mi RNA的序列與真實(shí)性。結(jié)果:Hsa-mi R-MTCO3P38(mi R-MTCO3P38)在肝癌組織中的深度測序讀取次數(shù)顯著低于肝癌旁組織(p<0.001,q<0.001)和正常肝組織(p<0.001,q<0.001)。Mi R-MTCO3P38位于假基因MTCO3P38序列上,經(jīng)預(yù)測具有穩(wěn)定的前體二級(jí)結(jié)構(gòu)(mi Rdeep2 score=1.4,p<0.05)。Northern blotting試驗(yàn)結(jié)果表明包含mi R-M...
【文章來源】:武漢大學(xué)湖北省211工程院校985工程院校教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:76 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
論文創(chuàng)新點(diǎn)
摘要
ABSTRACT
1 引言
第一部分:Hsa-miR-MTCO3P38是來源于假基因MTCO3P38轉(zhuǎn)錄本的新micro-RNA
2 材料與方法
2.1 臨床樣本
2.2 肝癌細(xì)胞株
2.3 主要儀器和設(shè)備
2.4 主要試劑
2.5 主要溶液的配制
2.6 實(shí)驗(yàn)過程
3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.1 小RNA深度測序中miR-MTCO3P38的預(yù)測
3.2 MiR-MTCO3P38序列和來源驗(yàn)證
3.3 15個(gè)肝組織深度測序中miR-MTCO3P38的表達(dá)
4 討論
第二部分:MiR-MTCO3P38在肝癌組織的表達(dá)與患者臨床資料關(guān)系及對(duì)肝癌細(xì)胞的侵襲遷移能力影響
5 材料與方法
5.1 臨床樣本
5.2 人肝癌細(xì)胞系
5.3 主要儀器和設(shè)備
5.4 主要試劑
5.5 主要試劑的配制
5.6 實(shí)驗(yàn)步驟
6 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
6.1 肝癌組織和肝癌細(xì)胞系中miR-MTCO3P38的表達(dá)
6.2 MiR-MTCO3P38的表達(dá)和肝癌患者的臨床關(guān)系
6.3 過表達(dá)miR-MTCO3P38對(duì)肝癌細(xì)胞生物學(xué)行為的影響
7 討論
第三部分 :MiR-MTCO3P38通過結(jié)合TMOD1 mRNA3’UTR下調(diào)TMOD1/MMP13通路抑制肝癌細(xì)胞侵襲遷移
8 材料與方法
8.1 細(xì)胞系
8.2 主要儀器和設(shè)備
8.3 主要試劑
8.4 主要溶液的配制
8.5 實(shí)驗(yàn)過程和步驟
9 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
9.1 轉(zhuǎn)錄組學(xué)和生物信息學(xué)篩選miR-MTCO3P38 靶基因
9.2 熒光素酶報(bào)告驗(yàn)證MiR-MTCO3P38的靶基因
9.3 MiR-MTCO3P38通過TMOD1影響肝癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移
10 討論
參考文獻(xiàn)
綜述 假基因調(diào)控腫瘤發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制
參考文獻(xiàn)
攻博期間發(fā)表的科研成果
致謝
本文編號(hào):3643142
【文章來源】:武漢大學(xué)湖北省211工程院校985工程院校教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:76 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
論文創(chuàng)新點(diǎn)
摘要
ABSTRACT
1 引言
第一部分:Hsa-miR-MTCO3P38是來源于假基因MTCO3P38轉(zhuǎn)錄本的新micro-RNA
2 材料與方法
2.1 臨床樣本
2.2 肝癌細(xì)胞株
2.3 主要儀器和設(shè)備
2.4 主要試劑
2.5 主要溶液的配制
2.6 實(shí)驗(yàn)過程
3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.1 小RNA深度測序中miR-MTCO3P38的預(yù)測
3.2 MiR-MTCO3P38序列和來源驗(yàn)證
3.3 15個(gè)肝組織深度測序中miR-MTCO3P38的表達(dá)
4 討論
第二部分:MiR-MTCO3P38在肝癌組織的表達(dá)與患者臨床資料關(guān)系及對(duì)肝癌細(xì)胞的侵襲遷移能力影響
5 材料與方法
5.1 臨床樣本
5.2 人肝癌細(xì)胞系
5.3 主要儀器和設(shè)備
5.4 主要試劑
5.5 主要試劑的配制
5.6 實(shí)驗(yàn)步驟
6 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
6.1 肝癌組織和肝癌細(xì)胞系中miR-MTCO3P38的表達(dá)
6.2 MiR-MTCO3P38的表達(dá)和肝癌患者的臨床關(guān)系
6.3 過表達(dá)miR-MTCO3P38對(duì)肝癌細(xì)胞生物學(xué)行為的影響
7 討論
第三部分 :MiR-MTCO3P38通過結(jié)合TMOD1 mRNA3’UTR下調(diào)TMOD1/MMP13通路抑制肝癌細(xì)胞侵襲遷移
8 材料與方法
8.1 細(xì)胞系
8.2 主要儀器和設(shè)備
8.3 主要試劑
8.4 主要溶液的配制
8.5 實(shí)驗(yàn)過程和步驟
9 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
9.1 轉(zhuǎn)錄組學(xué)和生物信息學(xué)篩選miR-MTCO3P38 靶基因
9.2 熒光素酶報(bào)告驗(yàn)證MiR-MTCO3P38的靶基因
9.3 MiR-MTCO3P38通過TMOD1影響肝癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移
10 討論
參考文獻(xiàn)
綜述 假基因調(diào)控腫瘤發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制
參考文獻(xiàn)
攻博期間發(fā)表的科研成果
致謝
本文編號(hào):3643142
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