研究背景與目的結(jié)直腸癌（Colorectal cancer,CRC）是世界上僅次于肺癌和乳腺癌的第三大常見腫瘤,在我國結(jié)直腸癌發(fā)病率和死亡率呈逐步上升趨勢,位列惡性腫瘤發(fā)病及死亡第五位。深入研究結(jié)直腸癌發(fā)生發(fā)展的機制,是早期發(fā)現(xiàn)、早期診斷和早期治療、降低結(jié)直腸癌發(fā)病率和死亡率的關(guān)鍵。越來越多的研究表明,長鏈非編碼RNA（lncRNA）與結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。但大部分傳統(tǒng)的生物學(xué)研究僅以單個lncRNA的功能為重點,很難對生物系統(tǒng)的整體進行更為全面的闡述。因此,lncRNA在結(jié)直腸癌發(fā)生、發(fā)展中的具體機制仍需要進一步探討。本課題利用加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析（Weighted gene co-expression network analysis,WGCNA）方法探索與結(jié)直腸癌發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)的基因模塊,并通過構(gòu)建轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)等策略篩選與結(jié)直腸癌相關(guān)的關(guān)鍵lncRNA分子MIR17HG,探討lncRNA MIR17HG對結(jié)直腸癌細胞生物學(xué)表型的影響及分子機制,同時對lncRNA MIR17HG在結(jié)直腸癌免疫治療中的作用及可能機制進行了初步的探索。為闡明結(jié)直腸癌發(fā)病機制、發(fā)現(xiàn)結(jié)直腸癌... 

【文章來源】：東南大學(xué)江蘇省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：174 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

圖１－３結(jié)直腸組織祥本差異ＩｎｃＲＮＡ火山圖??（Ｘ軸表示差異倍數(shù)，Ｙ軸表示Ｐ值，紅色部分基固表示尸＜?０．０５，變化倍數(shù)為２??

?東南大學(xué)博士學(xué)位論文???１－４）。與ｉＢ常組織相比，在結(jié)直腸腺瘤組織中上調(diào)的ＩｎｃＲＮＡ共１，００９條，ｍＲＮＡ??共９５７條；下調(diào)的ＩｎｃＲＮＡ共９５６條，ｍＲＮＡ共１，１７７條。與常組織相比，在??結(jié)直腸癌組織中上調(diào)的ＩｎｃＲＮＡ共３６７條，ｍＲＮＡ共１，６３１條，下調(diào)的ＩｎｃＲＮＡ??共７４８條，ｍＲＮＡ共Ｗ１條。??Ａ?Ｂ??ＣＯ??？?■?．．?００??一①?．??０?？?．?？？？？？？？？?（Ｉ）??５?３?０?２?４?６￣?－６?－４?－２?０?２?４?６??ｌｏｇ２ＦｏｌｄＣｈａｎｇｅ?ｌｏｇ２ＦｏｌｄＣｈａｎｇｅ??圖１－３結(jié)直腸組織祥本差異ＩｎｃＲＮＡ火山圖??（Ｘ軸表示差異倍數(shù)，Ｙ軸表示Ｐ值，紅色部分基固表示尸＜?０．０５，變化倍數(shù)為２??倍。Ａ為結(jié)直腸癌組織ＫＳ■．正常組織，Ｂ為結(jié)直腸腺瘤組織ＫＳ■．正常組織）??Ａ?Ｂ??Ｏ??００?■??．寸－．ｖ?ｖ＇ｌＳ?■?Ｓ＇?＇?Ｐ；?－?？??圖１－４結(jié)直腸組織樣本差異ｍＲＮＡ火山圖??（Ｘ軸表示差異倍數(shù)，Ｙ軸表示Ｐ值，紅色部分基因表示Ｐ＜?０．０５，變化倍數(shù)為２??倍＾?Ａ為結(jié)直腸癌組織ＶＳ．正常組織，Ｂ為結(jié)直腸腺瘤組織ＫＳ■．正常組織）??１８??

?．第鑕麗腸癌ＩｎｃＲＮＡ與ｍＲＮＡ：！；片的生物慎擧學(xué)分析???２結(jié)果??２．１加權(quán)基因，共表達網(wǎng)絡(luò)分析??２．１．１離群樣本刪除的去除??圖１－５表示樣本聚類分析結(jié)果及對應(yīng)臨床信息。Ｏｕｔｌｉｅｒ為紅色，表示樣本連??接度篩選閾值小于－２．５，需踢出；黑色表示樣本連接度篩選閾值大于－２．５，無需剔??除。由圖可見，未發(fā)現(xiàn)明顯離群樣本，所有樣本可進行后續(xù)分析分組為紅色表??示為結(jié)直腸腺瘤組，粉紅色為結(jié)直腸癌組織，Ｓ色為結(jié)直腸癌患者癌旁組織。性??別紅色表示男性，白色表示女性。年齡越大，顏色越深。??Ｓａｍｐｌｅ?ｄｅｎｄｒｏｇｒａｍ?ａｎｄ?ｔｒａｉｔ?ｈｅａｔｍａｐ??卜??ｄ?￣｜????ＣＤ?＿?????ｄ?－??ｉｎ?＿??ｏ?￣??寸?—?????ｄ?￣??Ｓ＞?ｏ?￣?Ｉ—??Ｘ?Ｉ?ｏｏ??＾?－?丨?ｊ—ｉ—．?召???１??５?－?ｒｉ?Ｉ?＾?＾＾１?Ａ??ＩＩ?ｚ?ｗ?＾?ｐＵ?｜?ｒｎ??§?Ｊ§?ｉ?㈥?ｈ?ｉ?Ｊ?＾??Ｚ?Ｚ?ａ?閔?１１?１?１?＾?＾?〇??ｒｏ?（〇?〇）?ｉｎ?ｏ?ｃｏ?Ｏ?ｗ??〇?〇?Ｐ芑?云芑?°??Ｏｕｔｌｉｅｒ??Ｇｒｏｕｐ??■?■Ｉ?ｊ?Ｍｌ??＾?ｉｓ?Ｉ?ｅ?ｉ＾ｒ??圖１－５結(jié)直腸組織樣本聚類結(jié)果及對應(yīng)樣本信息??２．１．２軟閾值篩選??利＿＿廚Ｐｉｃｋｓｏｆｔｔｈｒｅｓｈｏｌｄ涵數(shù)計算滿足無，Ｒ慶分布構(gòu)建需求．的軟閾值參數(shù)Ｐ。??圖１－６?Ａ?＆示不同軟閾值對應(yīng)的ｌｏｇ（ｋ）和ｌｏｇ（ｐ（ｋ））的相關(guān)系數(shù)的平方即ＳＦＴ．Ｒｓｑ?

【參考文獻】：
期刊論文
[1]Genetic and epigenetic biomarkers for diagnosis, prognosis and treatment of colorectal cancer[J]. Fabio Coppedè,Angela Lopomo,Roberto Spisni,Lucia Migliore.  World Journal of Gastroenterology. 2014(04)



本文編號：3490862