背景膠質(zhì)瘤是最常見的原發(fā)性惡性腦腫瘤類型,具有復(fù)發(fā)率高,死亡率高,生存期短,缺乏有效的治療策略的特點。即使包括手術(shù),放療和化療在內(nèi)的多種治療手段已有飛速發(fā)展,膠質(zhì)瘤患者的中位生存期仍未有顯著提高。尋找、鑒定新的腫瘤靶標(biāo)仍是膠質(zhì)瘤研究中亟待解決的關(guān)鍵問題。研究發(fā)現(xiàn),內(nèi)源性病毒序列（endogenous viral elements,EVEs）與人類癌癥疾病密切相關(guān),EVEs已被證實在實體腫瘤諸如黑色素瘤、乳腺癌、卵巢癌、畸胎癌、肉瘤、膀胱癌等中發(fā)揮重要作用,并可作為多種癌癥疾病的生物標(biāo)志物或免疫學(xué)靶標(biāo)。因此,針對人類EVEs的創(chuàng)新研究不僅可以加深我們對EVEs與人類疾病關(guān)系的理解,同時也有助于我們探尋新的癌癥靶標(biāo),為癌癥的診斷與靶向治療提供新的思路。內(nèi)源性博爾納樣核蛋白樣序列（endogenous borna-like N elements,EBLNs）是由博爾納病病毒（borna disease virus,BoDV）衍生而來的EVEs。迄今為止,在人類基因組中共發(fā)現(xiàn)7個EBLN（EBLN1^EBLN7）,其中EBLN2被認為與癌癥的關(guān)系最為密切。然而,尚未有研究對... 

【文章來源】：重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市

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【學(xué)位級別】：博士

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EBLN2在膠質(zhì)瘤中的表達水平及與患者預(yù)后生存關(guān)系

重慶醫(yī)科大學(xué)博士研究生學(xué)位論文25圖1.2EBLN2在膠質(zhì)瘤常見突變基因病人中的表達AEBLN2在IDH突變的膠質(zhì)瘤患者中低表達；BEBLN2在EGFR突變的膠質(zhì)瘤患者中的表達；CEBLN2在ATRX突變膠質(zhì)瘤患者中的表達；DEBLN2在TP53突變的膠質(zhì)瘤患者中的表達。*p<0.05，nsp>0.05。Figure1.2EBLN2expressioninpatientswithgliomacommonmutationgenes.AEBLN2lowexpressioninIDH-mutatedgliomapatients;BEBLN2expressioninEGFR-mutatedgliomapatients;CEBLN2expressioninATRXmutantgliomapatients;DEBLN2expressioninTP53mutantgliomapatients.*p<0.05,nsp>0.05.2.4EBLN2可作為預(yù)測神經(jīng)元型GBM的潛在標(biāo)志物為進一步探討EBLN2在膠質(zhì)瘤中表達分布特點，我們評估了TCGA基于基因表達及改變情況定義的GBM的四種分子亞型：經(jīng)典型(classical)、神經(jīng)元型(neural)、間質(zhì)型(mesenchymal)和前神經(jīng)元型(proneural)中EBLN2的表達模式。結(jié)果（圖1.3A）顯示，在CGGA數(shù)據(jù)集中，與其他亞型相比EBLN2表達在神經(jīng)元型膠質(zhì)瘤中顯著下調(diào)（p<0.0001）。為了進一步驗證這一發(fā)現(xiàn)，我們對EBLN2表達和神經(jīng)元型分子亞型進行了ROC分析，比較預(yù)測模型的特異性和敏感性，曲線下面積（Area

重慶醫(yī)科大學(xué)博士研究生學(xué)位論文26UnderCurve，AUC）為70.3%（圖1.3B）。以上結(jié)果表明EBLN2低表達可作為預(yù)測神經(jīng)元型GBM的潛在標(biāo)志物。圖1.3AEBLN2在CGGA數(shù)據(jù)集不同TCGA分子亞型中的表達；BEBLN2表達的ROC曲線可預(yù)測CGGA數(shù)據(jù)集中的Neural亞型。****p<0.0001。Figure1.3EBLN2expressionindifferentTCGAmolecularsubtypesoftheCGGADataset;BROCcurveofEBLN2expressiontopredictNeuralsubtypesintheCGGADataset.****p<0.0001.2.5EBLN2表達高相關(guān)基因的功能分析為了探討EBLN2可能在膠質(zhì)瘤的發(fā)生發(fā)展中參與的生物學(xué)過程，我們采用Pearson相關(guān)分析對CGGA數(shù)據(jù)集中325例患者的全基因組基因進行分析，富集與EBLN2表達高度相關(guān)的基因。結(jié)果顯示共有767個基因（R>0.6，P<0.05）與EBLN2表達正相關(guān)（圖1.4A）。我們進一步對與EBLN2表達高相關(guān)的基因功能進行GO功能分析（圖1.4B和C）。GO功能分析發(fā)現(xiàn)，與EBLN2表達高相關(guān)的基因生物學(xué)功能主要富集在：對血管管徑的調(diào)節(jié)、調(diào)節(jié)血管大孝血管直徑調(diào)節(jié)、抗原受體介導(dǎo)的信號通路調(diào)控、氯離子跨膜轉(zhuǎn)運、被動跨膜轉(zhuǎn)運蛋白活性、G蛋白偶聯(lián)神經(jīng)遞質(zhì)受體活性等，提示EBLN2可能通過參與調(diào)控腫瘤血管生成途徑進而在膠質(zhì)瘤的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮作用。


本文編號：3440553