背景膠質(zhì)瘤是最常見(jiàn)的原發(fā)性惡性腦腫瘤類型,具有復(fù)發(fā)率高,死亡率高,生存期短,缺乏有效的治療策略的特點(diǎn)。即使包括手術(shù),放療和化療在內(nèi)的多種治療手段已有飛速發(fā)展,膠質(zhì)瘤患者的中位生存期仍未有顯著提高。尋找、鑒定新的腫瘤靶標(biāo)仍是膠質(zhì)瘤研究中亟待解決的關(guān)鍵問(wèn)題。研究發(fā)現(xiàn),內(nèi)源性病毒序列（endogenous viral elements,EVEs）與人類癌癥疾病密切相關(guān),EVEs已被證實(shí)在實(shí)體腫瘤諸如黑色素瘤、乳腺癌、卵巢癌、畸胎癌、肉瘤、膀胱癌等中發(fā)揮重要作用,并可作為多種癌癥疾病的生物標(biāo)志物或免疫學(xué)靶標(biāo)。因此,針對(duì)人類EVEs的創(chuàng)新研究不僅可以加深我們對(duì)EVEs與人類疾病關(guān)系的理解,同時(shí)也有助于我們探尋新的癌癥靶標(biāo),為癌癥的診斷與靶向治療提供新的思路。內(nèi)源性博爾納樣核蛋白樣序列（endogenous borna-like N elements,EBLNs）是由博爾納病病毒（borna disease virus,BoDV）衍生而來(lái)的EVEs。迄今為止,在人類基因組中共發(fā)現(xiàn)7個(gè)EBLN（EBLN1^EBLN7）,其中EBLN2被認(rèn)為與癌癥的關(guān)系最為密切。然而,尚未有研究對(duì)... 

【文章來(lái)源】：重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市

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【學(xué)位級(jí)別】：博士

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EBLN2在膠質(zhì)瘤中的表達(dá)水平及與患者預(yù)后生存關(guān)系

重慶醫(yī)科大學(xué)博士研究生學(xué)位論文25圖1.2EBLN2在膠質(zhì)瘤常見(jiàn)突變基因病人中的表達(dá)AEBLN2在IDH突變的膠質(zhì)瘤患者中低表達(dá)；BEBLN2在EGFR突變的膠質(zhì)瘤患者中的表達(dá)；CEBLN2在ATRX突變膠質(zhì)瘤患者中的表達(dá)；DEBLN2在TP53突變的膠質(zhì)瘤患者中的表達(dá)。*p<0.05，nsp>0.05。Figure1.2EBLN2expressioninpatientswithgliomacommonmutationgenes.AEBLN2lowexpressioninIDH-mutatedgliomapatients;BEBLN2expressioninEGFR-mutatedgliomapatients;CEBLN2expressioninATRXmutantgliomapatients;DEBLN2expressioninTP53mutantgliomapatients.*p<0.05,nsp>0.05.2.4EBLN2可作為預(yù)測(cè)神經(jīng)元型GBM的潛在標(biāo)志物為進(jìn)一步探討EBLN2在膠質(zhì)瘤中表達(dá)分布特點(diǎn)，我們?cè)u(píng)估了TCGA基于基因表達(dá)及改變情況定義的GBM的四種分子亞型：經(jīng)典型(classical)、神經(jīng)元型(neural)、間質(zhì)型(mesenchymal)和前神經(jīng)元型(proneural)中EBLN2的表達(dá)模式。結(jié)果（圖1.3A）顯示，在CGGA數(shù)據(jù)集中，與其他亞型相比EBLN2表達(dá)在神經(jīng)元型膠質(zhì)瘤中顯著下調(diào)（p<0.0001）。為了進(jìn)一步驗(yàn)證這一發(fā)現(xiàn)，我們對(duì)EBLN2表達(dá)和神經(jīng)元型分子亞型進(jìn)行了ROC分析，比較預(yù)測(cè)模型的特異性和敏感性，曲線下面積（Area

重慶醫(yī)科大學(xué)博士研究生學(xué)位論文26UnderCurve，AUC）為70.3%（圖1.3B）。以上結(jié)果表明EBLN2低表達(dá)可作為預(yù)測(cè)神經(jīng)元型GBM的潛在標(biāo)志物。圖1.3AEBLN2在CGGA數(shù)據(jù)集不同TCGA分子亞型中的表達(dá)；BEBLN2表達(dá)的ROC曲線可預(yù)測(cè)CGGA數(shù)據(jù)集中的Neural亞型。****p<0.0001。Figure1.3EBLN2expressionindifferentTCGAmolecularsubtypesoftheCGGADataset;BROCcurveofEBLN2expressiontopredictNeuralsubtypesintheCGGADataset.****p<0.0001.2.5EBLN2表達(dá)高相關(guān)基因的功能分析為了探討EBLN2可能在膠質(zhì)瘤的發(fā)生發(fā)展中參與的生物學(xué)過(guò)程，我們采用Pearson相關(guān)分析對(duì)CGGA數(shù)據(jù)集中325例患者的全基因組基因進(jìn)行分析，富集與EBLN2表達(dá)高度相關(guān)的基因。結(jié)果顯示共有767個(gè)基因（R>0.6，P<0.05）與EBLN2表達(dá)正相關(guān)（圖1.4A）。我們進(jìn)一步對(duì)與EBLN2表達(dá)高相關(guān)的基因功能進(jìn)行GO功能分析（圖1.4B和C）。GO功能分析發(fā)現(xiàn)，與EBLN2表達(dá)高相關(guān)的基因生物學(xué)功能主要富集在：對(duì)血管管徑的調(diào)節(jié)、調(diào)節(jié)血管大孝血管直徑調(diào)節(jié)、抗原受體介導(dǎo)的信號(hào)通路調(diào)控、氯離子跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)、被動(dòng)跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白活性、G蛋白偶聯(lián)神經(jīng)遞質(zhì)受體活性等，提示EBLN2可能通過(guò)參與調(diào)控腫瘤血管生成途徑進(jìn)而在膠質(zhì)瘤的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮作用。


本文編號(hào)：3440553