結直腸癌是最常見的惡性腫瘤之一�，F(xiàn)階段許多環(huán)境和遺傳因素已被證實與結直腸癌的發(fā)生和發(fā)展具有高度的相關性,但體細胞突變仍被認為是結直腸癌發(fā)生的主要原因。PTPN4/PTP-MEG1是一種廣泛表達的非受體蛋白酪氛酸磷酸酶。在過去的三十年中,人們對PTPN4進行了許多研究,發(fā)現(xiàn)其參與了眾多的生物過程。然而,PTPN4是否參與結直腸癌的發(fā)生尚不清楚,具體機制尚待闡明。在本研究中,我們使用全外顯子測序技術從一例直腸癌患者的腫瘤樣本中發(fā)現(xiàn)了一個PTPN4的無義突變,突變頻率為90.90%,該突變導致了 PTPN4基因功能的喪失。分析TCGA數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)的其他結直腸癌樣本中PTPN4也存體細胞突變,包括無義突變。而且我們發(fā)現(xiàn)直腸癌中PTPN4的低表達與預后不良密切相關。分子機制方面,我們發(fā)現(xiàn)PTPN4的過度表達抑制了結直腸癌細胞的生長,而PTPN4的缺失加速了結直腸癌細胞的生長,并促進了其克隆形成的能力。此外,我們還發(fā)現(xiàn)PTPN4的缺失促進了 NCM460細胞的裸鼠成瘤能力。分子機制方面,我們證明了 PTPN4能夠與STAT3相互作用并促進STAT3在Tyr705殘基處的去磷酸化,抑制STAT... 

【文章來源】：中國人民解放軍醫(yī)學院北京市

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【學位級別】：博士

【部分圖文】：

圖２．１雙靶點基因敲除系統(tǒng)由清華大學Ｈｅ?Ｈｕａｂｉｎ，?Ｍａ?Ｊｉｅｙｕ，?Ｄｉｎｇ?Ｌｉｄａｎ等繪制

３．１病例情況??患者信息：患者男性，４７歲，出生于安徽臨泉縣。??現(xiàn)病史：患者于２０１４年１１月底無明顯誘因出現(xiàn)大便帶血，鮮紅色，與大便混合，??量少。排便每天１次，大便成形。２０１４年１２月５日出現(xiàn)下腹部持續(xù)性絞痛，約２０??分鐘余，排粘液血便后腹痛緩解，后未再發(fā)作。于２０１４－１２－１１行腸鏡檢查，結果示：??距肛門約８ｃｍ可見環(huán)周隆起腫物，表面破潰，管腔狹窄，內鏡無法通過，活檢５塊，??組織脆，彈性差。２０１４－１２－１５查盆腔ＣＴ平掃＋增強：乙狀結腸區(qū)域腸壁彌漫異常改??變，病變累及腸壁全層和漿膜外，考慮：惡性腫瘤，結腸癌可能性最大。建議：腸鏡??活檢進一步確認和臨床治療后定期復查（圖３．１?）。２０１４－１２－１６查腹部ＭＲＩ平掃＋增強：??肝右葉散在微小異常信號結節(jié)，建議增強掃描進一步檢查。??

在Ｉｐｉｌｉｍｕｍａｂ免疫靶向治療前，對患者腫瘤（首次手術后？蠟樣品）和白細胞??進行全外顯子捕獲ＤＮＡ測序。捕獲的外顯子屬于３萬多個編碼基因。發(fā)現(xiàn)７５．１％腫??瘤染色體組發(fā)生拷貝數(shù)改變（圖３．２）；?９８個腫瘤基因突變導致蛋白序列改變；０．２５％??染色體組微衛(wèi)星不穩(wěn)定改變。其中腫瘤關鍵基因的突變包括：ＣＣＮＤ１擴增，ＴＰ５３??ｓｐｌｉｃｅ?ｓｉｔｅ?ｃ．９２－ｌＧ＞Ｃ，ＪＡＫ３?ｐ．Ｇ８２９Ｃ＆ｐ丄８２８Ｒ?（表?３．１?）。??全外顯測序將發(fā)生突變的ｒｅａｄｓ數(shù)除以全部回貼至相應片段的ｒｅａｄｓ數(shù)測得該位??點的突變頻率。表３．１顯示了該患者發(fā)生的所有影響蛋白表達的基因突變，圖３．３顯??示ＰＴＰＮ４，?ＭＥＴＲＮ及ＳＮＲＰＣ為突變頻率最高的３個基因，其突變頻率分別為：９０．９％，??７７．３％和６９．２％。這三個基因分別位于２號染色體，１６號染色體和６號染色體。本次??全外顯子測序的正常對照組為患者血液中的白細胞，因此測得的突變均為體細胞突變，??而非胚系突變。根據(jù)腫瘤干細胞理論及分子遺傳理論，頻率高的突變可能發(fā)生的時間??較早。ＰＴＰＮ４在該患者腫瘤組織中突變頻率為９０．９％

【參考文獻】：
期刊論文
[1]Metabolic regulation by protein tyrosine phosphatases[J]. Hilla Knobler,Ari Elson.  The Journal of Biomedical Research. 2014(03)



本文編號：3346588