目的:隨著社會經(jīng)濟(jì)的逐漸發(fā)展2型糖尿病發(fā)病逐年升高,與此同時全球膀胱癌的發(fā)病率和病死率也在增加。2型糖尿病是膀胱癌的獨立危險因素,會明顯增加膀胱癌的發(fā)生率及死亡率。雖然二者許多共同的危險因素,但其內(nèi)在聯(lián)系機(jī)制至今仍不非常明確,因此找到糖尿病與膀胱癌相關(guān)性背后的原因迫在眉睫。基因芯片一種常用技術(shù)手段,其可用于檢測不同狀態(tài)下差異基因表達(dá)情況。本研究旨在通過檢測高糖及低糖條件下膀胱癌細(xì)胞差異基因表達(dá)情況,篩選目的基因加以驗證,并通過進(jìn)一步的細(xì)胞學(xué)實驗了解其可能的作用機(jī)制,了解2型糖尿病易并發(fā)腫瘤的分子機(jī)制,為2型糖尿病預(yù)防膀胱癌的發(fā)生和靶向治療提供實驗依據(jù)。方法:一、基因芯片研究:膀胱癌T24細(xì)胞分別于5.5mmol/L（低糖）和25mmol/L（高糖）葡萄糖濃度下培養(yǎng),使用Affymetrix人類Clariom D,Hu芯片系統(tǒng)地檢測CircRNAs、LncRNA、miRNA和mRNA的表達(dá),篩選差異倍數(shù)≥1.5的差異RNA。利用生物信息學(xué)靶定與高糖密切相關(guān)基因變化,篩選出目標(biāo)基因。二、人群驗證:我們回顧并收集天津醫(yī)科大學(xué)第二醫(yī)院泌尿外科就診所有新發(fā)的膀胱癌癌患者的醫(yī)療資料,將46例膀胱癌... 

【文章來源】：天津醫(yī)科大學(xué)天津市 211工程院校

【文章頁數(shù)】：138 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

HG組與LG組差異基因的柱形圖

圖 1.1 HG 組與 LG 組差異基因的柱形圖 圖 1.2HG 組與 LG 組差異基因的散點圖1.3.3T24 細(xì)胞 HG 組與 LG 組相比差異 CircRNAs、Lnc RNA、miRNA、m RN表達(dá)情況分析基因芯片時，需要設(shè)定合適的差異倍數(shù)，減少芯片結(jié)果中的假陰性率幫助縮小篩選范圍選擇出合適的差異基因進(jìn)行后續(xù)研究。既往研究顯示差異數(shù)篩選標(biāo)準(zhǔn)是 1.5 時，可以減少結(jié)果的假陰性率，我們經(jīng)過分析將差異倍數(shù)篩標(biāo)準(zhǔn)設(shè)定為 2 或 3 以便更好的減少篩選結(jié)果的假陰性率。我們的研究結(jié)果顯示HG 組與對照組相比，設(shè)定差異倍數(shù)≥1.5 時，CircRNAs、Lnc RNA、miRNA、RNA 分別有 3203、9355、1571、4792 條在兩組樣品間表達(dá)差異明顯（圖 1.3）我們的研究以上調(diào) mRNA 為切入點，故列出 FC≥3 的差異 mRNA 為 18 個差基因（表 1.2）。

天津醫(yī)科大學(xué)博士學(xué)位論文12圖 1.1 HG 組與 LG 組差異基因的柱形圖 圖 1.2HG 組與 LG 組差異基因的散點圖1.3.3T24 細(xì)胞 HG 組與 LG 組相比差異 CircRNAs、Lnc RNA、miRNA、m RNA表達(dá)情況分析基因芯片時，需要設(shè)定合適的差異倍數(shù)，減少芯片結(jié)果中的假陰性率，幫助縮小篩選范圍選擇出合適的差異基因進(jìn)行后續(xù)研究。既往研究顯示差異倍數(shù)篩選標(biāo)準(zhǔn)是 1.5 時，可以減少結(jié)果的假陰性率，我們經(jīng)過分析將差異倍數(shù)篩選標(biāo)準(zhǔn)設(shè)定為 2 或 3 以便更好的減少篩選結(jié)果的假陰性率。我們的研究結(jié)果顯示，HG 組與對照組相比，設(shè)定差異倍數(shù)≥1.5 時，CircRNAs、Lnc RNA、miRNA、mRNA 分別有 3203、9355、1571、4792 條在兩組樣品間表達(dá)差異明顯（圖 1.3）。我們的研究以上調(diào) mRNA 為切入點，故列出 FC≥3 的差異 mRNA 為 18 個差異基因（表 1.2）。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Diabetes mellitus increases the prevalence of anemia in patients with chronic kidney disease:A nested case-control study[J]. Charalampos Loutradis,Alexandra Skodra,Panagiotis Georgianos,Panagiota Tolika,Dimitris Alexandrou,Afroditi Avdelidou,Pantelis A Sarafidis.  World Journal of Nephrology. 2016(04)
[2]Adipokines as a novel link between obesity and atherosclerosis[J]. Hye Jin Yoo,Kyung Mook Choi.  World Journal of Diabetes. 2014(03)
[3]Hyperglycemia is a significant prognostic factor of hepatocellular carcinoma after curative therapy[J]. Takanori Hosokawa,Masayuki Kurosaki,Kaoru Tsuchiya,Shuya Matsuda,Masaru Muraoka,Yuichiro Suzuki,Nobuharu Tamaki,Yutaka Yasui,Toru Nakata,Takashi Nishimura,Shoko Suzuki,Ken Ueda,Hiroyuki Nakanishi,Jun Itakura,Yuka Takahashi,Namiki Izumi.  World Journal of Gastroenterology. 2013(02)



本文編號：3289983