基于腸道微生物調(diào)控大腦功能的磷酸化修飾和代謝機制探討
發(fā)布時間:2021-06-07 12:42
研究背景:抑郁癥(Major depression disorder,MDD)是一種基因與環(huán)境交互影響的重大精神疾病。全球抑郁癥的發(fā)生率約為3.1%,我國抑郁癥的患病率約為6.87%,約有9000萬抑郁癥患者。通過對抑郁癥發(fā)病機制的深入研究,發(fā)現(xiàn)抑郁癥不僅僅是與神經(jīng)遞質(zhì)紊亂相關(guān)的一種神經(jīng)精神系統(tǒng)疾病,而是一種多致病因素相互作用的復(fù)雜共病體系。腸道微生物紊亂在復(fù)雜疾病中的發(fā)病機制已成為近年來國際關(guān)注焦點。目前腸道微生物在精神病學(xué)、神經(jīng)發(fā)育、神經(jīng)再生及神經(jīng)退行性等疾病的病理生理機制方面探索方興未艾,腸道微生態(tài)對于維持生物體內(nèi)平衡的重要性已毋庸置疑,已有諸多研究證實,腸道微生物可與大腦進行雙向調(diào)控。我們項目組前期研究發(fā)現(xiàn)抑郁癥患者伴有腸道微生物紊亂,并通過糞便移植實驗建立了抑郁“人源化”動物模型,行為學(xué)測試結(jié)果提示移植抑郁癥患者糞便的無菌小鼠表現(xiàn)出抑郁樣行為,初步證實腸道微生物紊亂是抑郁癥的潛在病因,為抑郁癥研究提供了全新線索,然而其具體致病機制仍然不清楚。蛋白質(zhì)磷酸化修飾在生命體中具有十分重要的作用。磷酸化是通過蛋白質(zhì)激酶將ATP的磷酸基轉(zhuǎn)移到蛋白質(zhì)絲氨酸、蘇氨酸或酪氨酸殘基上的過程。磷酸...
【文章來源】:重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市
【文章頁數(shù)】:116 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
行為學(xué)測試結(jié)果(均值±標(biāo)準(zhǔn)誤)
31圖2實驗分析流程圖Figure2Stepwiseexperimentalflowchartdepictingtheanalysisofthisstudy我們發(fā)現(xiàn)在GF和SPF比較組中,大量的蛋白出現(xiàn)了磷酸化修飾改變。共計鑒定到2370個蛋白的6945個位點發(fā)生了磷酸化修飾,其中絲氨酸磷酸化位點6014個,占比最大,其值為86.6%;其次是蘇氨酸磷酸化位點860個,占比12.4%;然后是酪氨酸磷酸化位點71個,占比1.0%(見圖3A)。在FMT小鼠模型(“人源化”抑郁vs.“人源化”對照)中,我們共計鑒定到2580個蛋白的6787個位點發(fā)生了磷酸化修飾,其中絲氨酸磷酸化位點5811個,占比85.6%;蘇氨酸磷酸化位點875個,占比12.9%;酪氨酸磷酸化位點101個,占比1.5%(見圖3B),結(jié)果提示在腸道微生物紊亂情況下,具有絲氨酸磷酸化偏好性。我們進一步分析了每個蛋白發(fā)生磷酸化修飾的位點數(shù)量,發(fā)現(xiàn)超過一半的蛋白質(zhì)包含多個磷酸化修飾位點(見圖3C和D)。
32圖3無菌小鼠模型(GFvs.SPF)和腸道菌群重塑(“人源化”抑郁vs.“人源化”對照)小鼠海馬組織磷酸化蛋白組學(xué)分析。(A)無菌小鼠模型中定量的磷酸化位點分布餅圖;(B)腸道菌群重塑小鼠模型中定量的磷酸化位點分布餅圖;(C)無菌小鼠模型中每個蛋白磷酸化蛋白的修飾位點數(shù)量分布圖;(D)腸道菌群重塑中每個蛋白磷酸化蛋白的修飾位點數(shù)量分布圖。Figure3Globalphosphoproteomicanalysisofthehippocampusingerm-free(GF)andgutmicrobiomeremodeling(FMT)micemodel.(AandB)PiechartdepictingthephosphorylationsitesquantifiedinGFandFMTmicemodels,respectively.(CandD)ThenumberofmodifiedsiteswithineachphosphoproteininGFandFMTmicemodels,respectively.根據(jù)差異倍數(shù)>1.5或<0.67,且P值<0.05的篩選標(biāo)準(zhǔn),GF小鼠和SPF小鼠相比,25個蛋白的28個磷酸化位點上調(diào),216個蛋白的299個磷酸化位點下調(diào)(見表1)。此外,有4個蛋白同時具有上調(diào)和下調(diào)的磷酸化修飾位點。表1無菌鼠與無特定病原體小鼠比較的海馬差異磷酸化位點列表Table1Differentialhippocampalphosphositesbetweengerm-free(GF)andspecific-pathogen-free(SPF)miceUniProtKBACGenesymbolresiduesPositionFoldChange(GF/SPF)P-valueRegulatedTypeA2A690Tanc2S14800.620.001DownA2A690Tanc2S260.650.012DownA2A690Tanc2S220.410.032DownA2A9T0Tbkbp1S3360.650.002DownA2AAJ9ObscnS83720.560.020DownA2AH22Ambra1S12060.610.032Down
【參考文獻】:
期刊論文
[1]神經(jīng)精神疾病微生物組研究現(xiàn)狀和展望[J]. 潘俊希,謝鵬. 生命科學(xué). 2017(07)
碩士論文
[1]基于無菌小鼠研究腸道微生物對抑郁行為的作用[D]. 杜向禹.重慶醫(yī)科大學(xué) 2016
本文編號:3216596
【文章來源】:重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市
【文章頁數(shù)】:116 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
行為學(xué)測試結(jié)果(均值±標(biāo)準(zhǔn)誤)
31圖2實驗分析流程圖Figure2Stepwiseexperimentalflowchartdepictingtheanalysisofthisstudy我們發(fā)現(xiàn)在GF和SPF比較組中,大量的蛋白出現(xiàn)了磷酸化修飾改變。共計鑒定到2370個蛋白的6945個位點發(fā)生了磷酸化修飾,其中絲氨酸磷酸化位點6014個,占比最大,其值為86.6%;其次是蘇氨酸磷酸化位點860個,占比12.4%;然后是酪氨酸磷酸化位點71個,占比1.0%(見圖3A)。在FMT小鼠模型(“人源化”抑郁vs.“人源化”對照)中,我們共計鑒定到2580個蛋白的6787個位點發(fā)生了磷酸化修飾,其中絲氨酸磷酸化位點5811個,占比85.6%;蘇氨酸磷酸化位點875個,占比12.9%;酪氨酸磷酸化位點101個,占比1.5%(見圖3B),結(jié)果提示在腸道微生物紊亂情況下,具有絲氨酸磷酸化偏好性。我們進一步分析了每個蛋白發(fā)生磷酸化修飾的位點數(shù)量,發(fā)現(xiàn)超過一半的蛋白質(zhì)包含多個磷酸化修飾位點(見圖3C和D)。
32圖3無菌小鼠模型(GFvs.SPF)和腸道菌群重塑(“人源化”抑郁vs.“人源化”對照)小鼠海馬組織磷酸化蛋白組學(xué)分析。(A)無菌小鼠模型中定量的磷酸化位點分布餅圖;(B)腸道菌群重塑小鼠模型中定量的磷酸化位點分布餅圖;(C)無菌小鼠模型中每個蛋白磷酸化蛋白的修飾位點數(shù)量分布圖;(D)腸道菌群重塑中每個蛋白磷酸化蛋白的修飾位點數(shù)量分布圖。Figure3Globalphosphoproteomicanalysisofthehippocampusingerm-free(GF)andgutmicrobiomeremodeling(FMT)micemodel.(AandB)PiechartdepictingthephosphorylationsitesquantifiedinGFandFMTmicemodels,respectively.(CandD)ThenumberofmodifiedsiteswithineachphosphoproteininGFandFMTmicemodels,respectively.根據(jù)差異倍數(shù)>1.5或<0.67,且P值<0.05的篩選標(biāo)準(zhǔn),GF小鼠和SPF小鼠相比,25個蛋白的28個磷酸化位點上調(diào),216個蛋白的299個磷酸化位點下調(diào)(見表1)。此外,有4個蛋白同時具有上調(diào)和下調(diào)的磷酸化修飾位點。表1無菌鼠與無特定病原體小鼠比較的海馬差異磷酸化位點列表Table1Differentialhippocampalphosphositesbetweengerm-free(GF)andspecific-pathogen-free(SPF)miceUniProtKBACGenesymbolresiduesPositionFoldChange(GF/SPF)P-valueRegulatedTypeA2A690Tanc2S14800.620.001DownA2A690Tanc2S260.650.012DownA2A690Tanc2S220.410.032DownA2A9T0Tbkbp1S3360.650.002DownA2AAJ9ObscnS83720.560.020DownA2AH22Ambra1S12060.610.032Down
【參考文獻】:
期刊論文
[1]神經(jīng)精神疾病微生物組研究現(xiàn)狀和展望[J]. 潘俊希,謝鵬. 生命科學(xué). 2017(07)
碩士論文
[1]基于無菌小鼠研究腸道微生物對抑郁行為的作用[D]. 杜向禹.重慶醫(yī)科大學(xué) 2016
本文編號:3216596
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