LncRNA HOTAIR/miR-1277-5p/COL5A1軸在胃癌發(fā)生發(fā)展中的作用及其機制研究
發(fā)布時間:2021-04-20 14:59
目的多個研究已經(jīng)證實lncRNA HOTAIR通過與miRNA相互作用調(diào)控靶基因的表達,進而參與胃癌的發(fā)生發(fā)展。而miR-1277-5p在胃癌發(fā)生發(fā)展中的作用尚不清楚,因此,本實驗以miR-1277-5p為中心,研究miR-1277-5p在胃癌發(fā)生發(fā)展中的作用及其機制。方法1.通過生物信息學的方法篩選出胃癌組織中高表達的lncRNA和基因,并采用Gene Ontology(GO)、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)pathway、String分析和Kaplan Meier plotter法分別篩選出一個lncRNA和靶基因。預(yù)測并篩選出的lncRNA和靶基因的靶向miRNA并篩選出其共同靶向miR-1277-5p,通過過表達和干擾上游lncRNA表達,采用實時定量PCR法檢測miR-1277-5p表達水平的變化,進一步驗證上游lncRNA和miR-1277-5p的調(diào)控關(guān)系。2.為了檢測lncRNA/miR-1277-5p/靶基因調(diào)控軸對胃癌發(fā)生發(fā)展的影響,采用Western blot和實時定量PCR法探究靶基因在胃癌細胞和組織中的...
【文章來源】:安徽醫(yī)科大學安徽省
【文章頁數(shù)】:117 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
英文縮略詞表
中文摘要
英文摘要
前言
第一部分 :胃癌差異性表達基因和LNCRNA篩選及其共同靶向IRNA的篩選
1.材料和方法
1.1 材料
1.2 方法
1.3 統(tǒng)計學處理
2.結(jié)果
2.1 胃癌中差異表達基因和lncRNA的篩選結(jié)果
2.2 GO分析和KEGG pathway分析結(jié)果
2.3 差異表達基因String分析結(jié)果
2.4 靶向miRNA的篩選及其與lncRNA HOTAIR和 COL5A1 之間靶向關(guān)系
2.5 lncRNA HOTAIR和 COL5A1 生存分析
2.6 LncRNA HOTAIR抑制miRNA表達
3.討論
4.結(jié)論
第二部分 :COL5A1 在胃癌細胞中的表達及對胃癌細胞增殖的影響
1.材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
1.3 統(tǒng)計學處理
2.結(jié)果
2.1 胃癌組織和五種胃癌細胞株中COL5A1 蛋白表達水平升高
2.2 體外實驗驗證COL5A1 對胃癌細胞增殖的影響
3.討論
4.結(jié)論
第三部分 MIRNA-1277-5P對胃癌生物學行為調(diào)控
1.材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2.結(jié)果
2.1 miRNA-1277-5p抑制胃癌細胞的增殖
2.2 miRNA-1277-5p抑制胃癌細胞的遷移和侵襲
2.3 miRNA-1277-5p抑制胃癌細胞的劃痕愈合
3.討論
4.結(jié)論
第四部分 MIRNA-1277-5P對胃癌生物學行為調(diào)控的機制研究
1.材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2.結(jié)果
2.1 雙熒光素酶報告基因?qū)嶒灲Y(jié)果證實miR-1277-5p與 lncRNA HOTAIR靶向結(jié)合
2.2 雙熒光結(jié)果證實hsa-miR-1277-5p與 COL5A1 靶向結(jié)合
2.3 LncRNA HOTAIR正性調(diào)控COL5A1 的表達而miR-1277-5p負性調(diào)控其表達
2.4 LncRNA HOTAIR促進胃癌細胞的增殖
2.5 LncRNA HOTAIR促進胃癌細胞的遷移和侵襲
2.6 LncRNA HOTAIR促進胃癌細胞的劃痕愈合
3.討論
4.結(jié)論
參考文獻
附錄
致謝
綜述
參考文獻
【參考文獻】:
期刊論文
[1]HOX transcript antisense intergenic RNA represses E-cadherin expression by binding to EZH2 in gastric cancer[J]. Wen-Ming Chen,Wei-Dong Chen,Xue-Mei Jiang,Xue-Feng Jia,Hong-Mei Wang,Qiu-Jie Zhang,Yong-Qian Shu,Hai-Bo Zhao. World Journal of Gastroenterology. 2017(33)
[2]CD97 promotes gastric cancer cell proliferation and invasion through exosome-mediated MAPK signaling pathway[J]. Chao Li,Da-Ren Liu,Guo-Gang Li,Hou-Hong Wang,Xiao-Wen Li,Wei Zhang,Yu-Lian Wu,Li Chen. World Journal of Gastroenterology. 2015(20)
[3]Inflammation-related factors predicting prognosis of gastric cancer[J]. Wen-Jun Chang,Yan Du,Xin Zhao,Li-Ye Ma,Guang-Wen Cao. World Journal of Gastroenterology. 2014(16)
[4]p16 promoter hypermethylation:A useful serum marker for early detection of gastric cancer[J]. Mohammad Reza Abbaszadegan,Omeed Moaven,Hamid Reza Sima,Kamran Ghafarzadegan,Azadeh A’rabi,Mohammad Naser Forghani,Hamid Reza Raziee,Ali Mashhadinejad,Mostafa Jafarzadeh,Ehsan Esmaili-Shandiz,Ezzat Dadkhah. World Journal of Gastroenterology. 2008(13)
本文編號:3149900
【文章來源】:安徽醫(yī)科大學安徽省
【文章頁數(shù)】:117 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
英文縮略詞表
中文摘要
英文摘要
前言
第一部分 :胃癌差異性表達基因和LNCRNA篩選及其共同靶向IRNA的篩選
1.材料和方法
1.1 材料
1.2 方法
1.3 統(tǒng)計學處理
2.結(jié)果
2.1 胃癌中差異表達基因和lncRNA的篩選結(jié)果
2.2 GO分析和KEGG pathway分析結(jié)果
2.3 差異表達基因String分析結(jié)果
2.4 靶向miRNA的篩選及其與lncRNA HOTAIR和 COL5A1 之間靶向關(guān)系
2.5 lncRNA HOTAIR和 COL5A1 生存分析
2.6 LncRNA HOTAIR抑制miRNA表達
3.討論
4.結(jié)論
第二部分 :COL5A1 在胃癌細胞中的表達及對胃癌細胞增殖的影響
1.材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
1.3 統(tǒng)計學處理
2.結(jié)果
2.1 胃癌組織和五種胃癌細胞株中COL5A1 蛋白表達水平升高
2.2 體外實驗驗證COL5A1 對胃癌細胞增殖的影響
3.討論
4.結(jié)論
第三部分 MIRNA-1277-5P對胃癌生物學行為調(diào)控
1.材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2.結(jié)果
2.1 miRNA-1277-5p抑制胃癌細胞的增殖
2.2 miRNA-1277-5p抑制胃癌細胞的遷移和侵襲
2.3 miRNA-1277-5p抑制胃癌細胞的劃痕愈合
3.討論
4.結(jié)論
第四部分 MIRNA-1277-5P對胃癌生物學行為調(diào)控的機制研究
1.材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2.結(jié)果
2.1 雙熒光素酶報告基因?qū)嶒灲Y(jié)果證實miR-1277-5p與 lncRNA HOTAIR靶向結(jié)合
2.2 雙熒光結(jié)果證實hsa-miR-1277-5p與 COL5A1 靶向結(jié)合
2.3 LncRNA HOTAIR正性調(diào)控COL5A1 的表達而miR-1277-5p負性調(diào)控其表達
2.4 LncRNA HOTAIR促進胃癌細胞的增殖
2.5 LncRNA HOTAIR促進胃癌細胞的遷移和侵襲
2.6 LncRNA HOTAIR促進胃癌細胞的劃痕愈合
3.討論
4.結(jié)論
參考文獻
附錄
致謝
綜述
參考文獻
【參考文獻】:
期刊論文
[1]HOX transcript antisense intergenic RNA represses E-cadherin expression by binding to EZH2 in gastric cancer[J]. Wen-Ming Chen,Wei-Dong Chen,Xue-Mei Jiang,Xue-Feng Jia,Hong-Mei Wang,Qiu-Jie Zhang,Yong-Qian Shu,Hai-Bo Zhao. World Journal of Gastroenterology. 2017(33)
[2]CD97 promotes gastric cancer cell proliferation and invasion through exosome-mediated MAPK signaling pathway[J]. Chao Li,Da-Ren Liu,Guo-Gang Li,Hou-Hong Wang,Xiao-Wen Li,Wei Zhang,Yu-Lian Wu,Li Chen. World Journal of Gastroenterology. 2015(20)
[3]Inflammation-related factors predicting prognosis of gastric cancer[J]. Wen-Jun Chang,Yan Du,Xin Zhao,Li-Ye Ma,Guang-Wen Cao. World Journal of Gastroenterology. 2014(16)
[4]p16 promoter hypermethylation:A useful serum marker for early detection of gastric cancer[J]. Mohammad Reza Abbaszadegan,Omeed Moaven,Hamid Reza Sima,Kamran Ghafarzadegan,Azadeh A’rabi,Mohammad Naser Forghani,Hamid Reza Raziee,Ali Mashhadinejad,Mostafa Jafarzadeh,Ehsan Esmaili-Shandiz,Ezzat Dadkhah. World Journal of Gastroenterology. 2008(13)
本文編號:3149900
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