本文關(guān)鍵詞：新疆地區(qū)TB合并HIV感染流行病學(xué)分析及耐藥結(jié)核分子機(jī)制研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：研究背景及目的:我國(guó)目前結(jié)核病疫情仍十分嚴(yán)重,艾滋病感染率呈現(xiàn)逐年增多,兩者合并感染的機(jī)會(huì)顯著增加,使結(jié)核或艾滋病治療和控制愈加困難,死亡危險(xiǎn)性更高。因此,對(duì)高危人群進(jìn)行HIV感染早期篩查,并同時(shí)在HIV感染者中篩查結(jié)核病患者,為早期治療、改善預(yù)后以及有效地防控結(jié)核感染和與HIV合并感染的傳播提供科學(xué)依據(jù)。然而,結(jié)核疫情防治更為嚴(yán)峻的是結(jié)核耐藥菌株不斷增多,結(jié)核的發(fā)病率逐年增加,嚴(yán)重威脅著人們的身體健康;因此,開展新疆地區(qū)的耐藥分布情況的調(diào)查分析十分重要。初步的科學(xué)研究顯示結(jié)核菌耐藥與其基因的突變有關(guān),從基因水平上了解結(jié)核耐藥的分子機(jī)制,有利于建立一種特異、敏感檢測(cè)方法用于結(jié)核感染篩查和耐藥患者治療方案篩選;尤其受到環(huán)境因素的影響,不同地區(qū)的結(jié)核耐藥菌株的基因突變情況可能存在較大差異。因此,研究一個(gè)地區(qū)的結(jié)核桿菌基因突變及結(jié)核菌的耐藥突變基因情況,探討細(xì)胞因子誘導(dǎo)SRC同源2域蛋白(Cytokine-inducible SRC homology 2(SH2)domain protein,CISH)對(duì)機(jī)體結(jié)核感染易感性,了解新疆地區(qū)維吾爾族人群CISH基因多態(tài)性對(duì)當(dāng)?shù)厝巳航Y(jié)核發(fā)病的影響;可為結(jié)核病有效防控提供科學(xué)依據(jù)。研究方法:采用流行病學(xué)橫斷面調(diào)查方法,通過對(duì)新疆地區(qū)TB/HIV雙重感染患者的流行病學(xué)特征以及危險(xiǎn)因素進(jìn)行分析,了解我國(guó)西部邊疆少數(shù)民族地區(qū)TB合并HIV感染情況。采用分子流行病學(xué)方法,收集了2012-2013年烏魯木齊市四區(qū)登記的結(jié)核菌培養(yǎng)陽(yáng)性的菌株,并對(duì)菌株進(jìn)行藥敏檢測(cè),對(duì)藥物耐藥情況進(jìn)行分析,觀察在初治和復(fù)治患者中的結(jié)核耐藥菌株分布情況。采用改良羅氏培養(yǎng)基比例法計(jì)算菌株的耐藥百分比,基因測(cè)序法進(jìn)行測(cè)序,采用Lasergene軟件中的GeneAlign將測(cè)序結(jié)果與標(biāo)準(zhǔn)菌株H37Rv的基因序列進(jìn)行比對(duì),確定基因突變位點(diǎn)。采用病例對(duì)照研究方法,通過Haploview軟件選擇CISH基因SNP位點(diǎn),利用SnapShot法進(jìn)行SNP基因型的檢測(cè),并構(gòu)建SNPs單倍型。研究結(jié)果:1.本次調(diào)查共登記結(jié)核病人3657例,檢測(cè)HIV抗體2645例,HIV抗體檢測(cè)率為72.3%,HIV抗體陽(yáng)性者128例,陽(yáng)性檢出率為4.8%�！�35歲的結(jié)核病患者感染HIV的風(fēng)險(xiǎn)為18-35歲患者的0.26倍(95%CI:0.18-0.40),痰涂片呈陽(yáng)性的肺結(jié)核患者、肺外結(jié)核患者感染HIV的風(fēng)險(xiǎn)分別是痰涂片陰性患者的0.43倍(95%CI:0.28-0.66)和1.79倍(95%CI:1.09-2.94)。此次調(diào)查共登記HIV感染/AIDS病人2714例,隨訪到1284例,其中進(jìn)行結(jié)核病篩查1195例,篩查率為93.1%,共發(fā)現(xiàn)結(jié)核病感染91例,感染率為7.6%。男性HIV感染者/AIDS病人感染結(jié)核桿菌的風(fēng)險(xiǎn)為女性的12.2倍(95%CI:6.4-23.1),CD4細(xì)胞數(shù)量≤200的HIV感染者/AIDS病人感染結(jié)核桿菌的風(fēng)險(xiǎn)為CD4細(xì)胞數(shù)量200的20.4倍(95%CI:11.8-35.3)。2.新疆地區(qū)結(jié)核菌株除對(duì)AMK的耐藥率低于20%外,對(duì)其它一線及二線抗結(jié)核藥物的耐藥率都高于30%。而且復(fù)治患者的結(jié)核菌耐藥率明顯高于初治患者的結(jié)核菌耐藥率。對(duì)一線抗結(jié)核藥物的耐藥率為54.9%,初治患者對(duì)一線抗結(jié)核藥物的耐藥率為35.7%,復(fù)治患者對(duì)一線抗結(jié)核藥物耐藥率為81.6%。在4種一線抗結(jié)核藥物中對(duì)INH的耐藥率最高為46.1%。對(duì)EMB的耐藥率最低為26.8%。對(duì)二線抗結(jié)核藥物的耐藥率為46.1%,初治患者對(duì)二線抗結(jié)核藥物的耐藥率為33.3%。復(fù)治患者對(duì)二線抗結(jié)核藥物的耐藥率為64.3%。在3種二線抗結(jié)核藥物中,對(duì)OFLX的耐藥率最高為36.7%,對(duì)AMK的耐藥率最低為16.2%。3.rpoB基因突變率為59.77%。突變范圍為從505位密碼子至572位密碼子,共有11個(gè)位點(diǎn)和14個(gè)類型。52例突變菌株中有1例為密碼子CAC-TGC的雙堿基突變,剩余的都是密碼子單堿基突變。基因突變類型有點(diǎn)突變和兩個(gè)密碼子的聯(lián)合突變。其中52例突變菌株中點(diǎn)突變有44株(84.6%)。突變的密碼子為505、516、526、531、533等5個(gè)密碼子,531位密碼子突變最常見。排在第二位的是526位密碼子的突變。剩余的8例突變結(jié)核菌株為存在兩個(gè)密碼子的聯(lián)合突變。有18例突變菌株存在katG或inhA基因突變,或兩者同時(shí)突變。4.與健康對(duì)照組相比,CISH基因多態(tài)性位點(diǎn)rs17051025在結(jié)核病組中的等位基因A的頻率高于對(duì)照組(P0.05),基因型AA在結(jié)核病組中的頻率也是高于健康對(duì)照組(P0.05)。與健康對(duì)照組相比,CISH基因多態(tài)性位點(diǎn)rs2239751在結(jié)核病組中等位基因A的頻率較高(P0.05)。主要的6種單倍體中有三種單倍體(TCCG,ACAG,TCAG)因?yàn)槠漕l率小于5%,所以沒有進(jìn)行相關(guān)統(tǒng)計(jì)。還有三種單倍體組間沒有差異。結(jié)論:新疆地區(qū)結(jié)核合并HIV雙重感染的比例較高,≥35歲/涂片呈陽(yáng)性/肺外結(jié)核的結(jié)核病患者和男性/CD4細(xì)胞數(shù)量≤200的HIV感染者為高危人群。應(yīng)進(jìn)行TB/HIV雙向篩查。新疆地區(qū)結(jié)核菌株對(duì)一線及二線抗結(jié)核藥物的耐藥率較高。新疆地區(qū)大部分結(jié)核菌株耐藥基因的突變類型與以往的研究結(jié)果是一致的。我國(guó)維吾爾族人群中CISH基因SNPs與結(jié)核易感性相關(guān),在4個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)中rs17051025及rs2239751是危險(xiǎn)因素。建議加強(qiáng)我國(guó)西部邊疆少數(shù)民族地區(qū)TB和HIV以及耐藥的防控工作,尤其要重視TB合并HIV感染以及耐藥結(jié)核分子機(jī)制方面的探索。
【關(guān)鍵詞】：肺結(jié)核 HIV 耐藥結(jié)核 分子機(jī)制 流行病學(xué)
【學(xué)位授予單位】：青島大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：R52;R512.91
【目錄】：

• 摘要2-4
• ABSTRACT4-10
• 引言10-13
• 第一章 新疆地區(qū)結(jié)核分枝桿菌與艾滋病病毒雙重感染的流行病學(xué)調(diào)查13-27
• 1 材料與方法16-22
• 1.1 研究對(duì)象16
• 1.2 調(diào)查方法16-20
• 1.2.1 相關(guān)診斷標(biāo)準(zhǔn)17
• 1.2.2 艾滋病的診斷標(biāo)準(zhǔn)17
• 1.2.3 結(jié)核病合并艾滋病雙重感染的界定17-18
• 1.2.4 雙向篩查技術(shù)18-20
• 1.3 質(zhì)量控制20-21
• 1.3.1 調(diào)查人員的培訓(xùn)20-21
• 1.3.2 預(yù)調(diào)查21
• 1.3.3 調(diào)查過程21
• 1.3.4 資料錄入過程21
• 1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析21
• 1.5 倫理學(xué)考慮21-22
• 2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果22-24
• 2.1 結(jié)核病人HIV感染特點(diǎn)及危險(xiǎn)因素22-23
• 2.2 HIV感染者/AIDS病人結(jié)核病感染特點(diǎn)及危險(xiǎn)因素23-24
• 3 討論24-25
• 4 結(jié)論25-27
• 第二章 新疆地區(qū)結(jié)核分枝桿菌的耐藥現(xiàn)狀的研究27-38
• 1 材料與方法30-33
• 1.1 菌株及病例來(lái)源30
• 1.2 主要試劑及儀器30-31
• 1.2.1 主要試劑30
• 1.2.2 主要儀器30-31
• 1.3 實(shí)驗(yàn)方法31-33
• 1.3.1 標(biāo)本懫集31
• 1.3.2 結(jié)核分枝桿菌培養(yǎng)31-32
• 1.3.3 結(jié)核分枝桿菌菌種鑒定32
• 1.3.4 藥敏試驗(yàn)32-33
• 2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果33-35
• 2.1 納入病例一般情況分析33
• 2.2 藥敏敏感性試驗(yàn)結(jié)果33-35
• 3 討論35-37
• 4 結(jié)論37-38
• 第三章 新疆地區(qū)結(jié)核病耐藥基因突變特征研究38-48
• 1 材料與方法39-41
• 1.1 耐藥基因突變分析病例納入39-40
• 1.2 菌種鑒定和藥敏試驗(yàn)40
• 1.3 菌基因組DNA提取40
• 1.4 實(shí)驗(yàn)材料和試劑40
• 1.4.1 主要實(shí)驗(yàn)試劑及配制40
• 1.4.2 主要儀器設(shè)備40
• 1.5 耐藥基因擴(kuò)增及測(cè)序40-41
• 1.5.1 耐藥基因擴(kuò)增及測(cè)序40-41
• 1.5.2 測(cè)序結(jié)果比對(duì)41
• 1.5.3 數(shù)據(jù)處理與分析41
• 2 結(jié)果41-44
• 2.1 耐藥基因序列比對(duì)結(jié)果41
• 2.2 耐多藥結(jié)核分枝桿菌rpoB基因突變特征41-42
• 2.3 耐多藥結(jié)核分枝桿菌katG基因突變特征42-43
• 2.4 inhA基因突變及其特點(diǎn)43
• 2.5 katG基因與inhA基因聯(lián)合突變43
• 2.6 基因突變與藥敏的關(guān)系43-44
• 3 討論44-48
• 第四章 新疆地區(qū)結(jié)核病患者CISH基因遺傳易感性研究48-60
• 1 材料和方法49-54
• 1.1 研究對(duì)象49-50
• 1.2 實(shí)驗(yàn)試劑和儀器50-51
• 1.2.1 主要試劑、試劑盒50
• 1.2.2 實(shí)驗(yàn)儀器50
• 1.2.3 溶液配制50
• 1.2.4 瓊脂糖凝膠的配置50-51
• 1.3 實(shí)驗(yàn)方法51-54
• 1.3.1 血液基因組DNA的提取51
• 1.3.2 CISH基因SNP位點(diǎn)的選擇51-52
• 1.3.3 遺傳平衡定律52
• 1.3.4 SNP基因型的檢測(cè)52-53
• 1.3.5 構(gòu)建SNPs的單倍型53
• 1.3.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析53-54
• 2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果54-57
• 2.1 樣本DNA質(zhì)量檢測(cè)54
• 2.2 Hardy-Weinberg遺傳平衡檢驗(yàn)54
• 2.3 病例-對(duì)照人群SNP等位基因及其基因型比較54-57
• 2.4 病例-對(duì)照人群?jiǎn)伪缎捅容^57
• 3 討論57-59
• 4 結(jié)論59-60
• 參考文獻(xiàn)60-69
• 綜述一69-82
• 參考文獻(xiàn)77-82
• 綜述二82-99
• 參考文獻(xiàn)94-99
• 攻讀博士學(xué)位期間的研究成果99-102
• 附錄102-107
• 致謝107-108

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前8條

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  本文關(guān)鍵詞：新疆地區(qū)TB合并HIV感染流行病學(xué)分析及耐藥結(jié)核分子機(jī)制研究，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號(hào)：276092