本文關(guān)鍵詞：KLF12、AIRE、AFF1、AFF3及ETS-1基因多態(tài)性與中國人群類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎遺傳易感性關(guān)聯(lián)研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：研究背景類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(rheumatoid arthritis,RA)是一種以累及周圍關(guān)節(jié)為主的系統(tǒng)性自身免疫病。臨床表現(xiàn)為受累關(guān)節(jié)腫痛,該病若不經(jīng)及時、規(guī)范治療,病情會進(jìn)行性發(fā)展而導(dǎo)致關(guān)節(jié)軟骨與骨質(zhì)破壞,進(jìn)而造成關(guān)節(jié)畸形與功能喪失,嚴(yán)重地影響患者生活質(zhì)量。RA的發(fā)病涉及多種因素,大量研究表明遺傳因素在RA的發(fā)生、發(fā)展中起重要作用,該病的遺傳度高達(dá)60%左右。近年來,從人類基因組水平探索基因單核苷酸多態(tài)性(single-nucleotide polymorphism,SNP)位點(diǎn)與疾病遺傳易感性之間聯(lián)系的全基因組關(guān)聯(lián)研究(genome-wide association study,GWAS)極大地豐富了我們對復(fù)雜疾病遺傳易感因素的認(rèn)識。迄今,已有多項GWAS發(fā)現(xiàn)并證實(shí)了幾十個與RA遺傳易感性相關(guān)的遺傳易感區(qū)域/位點(diǎn),但這些GWAS大多數(shù)是在歐美人群中開展的,尚未見我國RA的GWAS結(jié)果報道。一項在西班牙人群中開展的GWAS發(fā)現(xiàn)KLF12基因rs1324913位點(diǎn)與RA遺傳易感性相關(guān),此前,在英國人群中開展的GWAS發(fā)現(xiàn)KLF12基因rs1887346位點(diǎn)與RA遺傳易感性相關(guān),表明KLF12是RA的遺傳易感基因。一項在日本人群中開展的GWAS發(fā)現(xiàn)AIRE基因的兩個SNP位點(diǎn)(rs2075876和rs760426)與RA的遺傳易感性相關(guān),并且rs2075876位點(diǎn)與AIRE基因的轉(zhuǎn)錄水平相關(guān)。系統(tǒng)性紅斑狼瘡(systemic lupus erythematosus,SLE)與RA同屬系統(tǒng)性自身免疫病,由于RA與SLE臨床表型相似、家族聚集,表明RA與SLE可能存在共同的遺傳背景,大量疾病間的遺傳易感性驗(yàn)證研究也證實(shí)了RA與SLE確實(shí)具備相同的遺傳易感因素。一項在日本人群中開展的GWAS和多階段驗(yàn)證研究發(fā)現(xiàn)AFF1 rs340630與SLE遺傳易感性相關(guān)且該位點(diǎn)風(fēng)險等位基因A與AFF1基因轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)相關(guān)。此前,與AFF1基因同屬一個基因家族的AFF3基因啟動子區(qū)域的rs10865035位點(diǎn)被報道與RA遺傳易感性相關(guān),隨后一些研究也發(fā)現(xiàn)AFF3基因與RA遺傳易感性相關(guān)。一項在中國漢族人群開展的GWAS發(fā)現(xiàn)ETS-1rs6590330位點(diǎn)與SLE遺傳易感性相關(guān),另一項在亞洲人群中開展的GWAS發(fā)現(xiàn)ETS-1 rs1128334位點(diǎn)與SLE遺傳易感性相關(guān),該位點(diǎn)與rs6590330位點(diǎn)高度連鎖且位于3’-非翻譯區(qū)(untranslated region,UTR),其風(fēng)險等位基因A與正常人外周血單個核細(xì)胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)中ETS1基因的轉(zhuǎn)錄水平下調(diào)有關(guān),表明ETS-1 rs1128334位點(diǎn)是一個功能性SNP位點(diǎn)。目的鑒于種族間的遺傳異質(zhì)性、RA與SLE具備共同的遺傳易感因素,且尚未見國內(nèi)有研究報道KLF12 rs1324913、KLF12 rs1887346、AIRE rs2075876、AIRE rs760426、AFF1 rs340630、AFF3 rs10865035及ETS-1 rs1128334位點(diǎn)與中國人群RA遺傳易感性之間的關(guān)系,故本研究擬采用病例對照研究,通過檢測RA患者與對照中上述SNP位點(diǎn),分析各SNP位點(diǎn)基因型頻率分布與等位基因頻率分布在RA病例組與對照組間的差異,并進(jìn)一步分析各位點(diǎn)風(fēng)險等位基因在不同遺傳模型(顯性遺傳模型與隱性遺傳模型)下與RA遺傳易感性之間的關(guān)系,以期為我國人群RA遺傳易感性研究提供本底資料,并為進(jìn)一步開展相關(guān)分子致病機(jī)制研究提供科學(xué)依據(jù)。方法本課題采用病例對照研究設(shè)計,RA病例為安徽省六安市人民醫(yī)院風(fēng)濕免疫科的門診RA患者,所有病例均符合美國風(fēng)濕病協(xié)會(American College of Rheumatology,ACR)1987年修訂的RA分類標(biāo)準(zhǔn)。對照為六安市人民醫(yī)院骨科門診因外傷就診者。研究對象知情同意后,按照性別與年齡信息的一般人口學(xué)特征,收集RA患者的資料,同時抽取外周靜脈血5ml,提取研究對象基因組DNA。運(yùn)用專業(yè)SNa Pshot SNP技術(shù)檢測基因多態(tài)位點(diǎn)。采用Excel 2003軟件錄入資料。運(yùn)用STATA12.0軟件評估對照組中各SNP位點(diǎn)的基因型頻率分布是否符合哈迪-溫伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)。使用SPSS 11.0軟件進(jìn)行t檢驗(yàn)、卡方檢驗(yàn)和logistic回歸分析。關(guān)聯(lián)強(qiáng)度以比值比(odds ratio,OR)及其95%置信區(qū)間(confidence interval,CI)表示。以α=0.05為一類檢驗(yàn)水準(zhǔn),采用Bonferroni法在多重比較時對檢驗(yàn)水準(zhǔn)進(jìn)行矯正,因本次研究共有7個SNP位點(diǎn),所以矯正后的檢驗(yàn)水準(zhǔn)為0.05/7=7.14×10-3。結(jié)果(1)研究對象一般情況:本研究共納入RA患者232例,對照313例。RA患者中男性45例,女性187例,年齡最小者14歲,最大者80歲,平均年齡為(48.69±14.18)歲。RA患者中RF陽性154例,RF陰性78例;CCP陽性228例,CCP陰性4例。對照組中男性197例,女性116例,年齡最小者2歲,最大者91歲,平均年齡為(47.02±16.34)歲。RA病例組與對照組的性別構(gòu)成有統(tǒng)計學(xué)差異(χ2=102.33,P0.01),而平均年齡無統(tǒng)計學(xué)差異(t=1.28,P=0.20);(2)HWE檢驗(yàn):7個基因多態(tài)性位點(diǎn)在對照組中的基因型頻率分布均符合HWE(KLF12 rs1324913位點(diǎn):c2=0.34,P=0.56;KLF12 rs1887346位點(diǎn):c2=2.67,P=0.10;AIRE rs2075876位點(diǎn):c2=0.11,P=0.74;AIRE rs760426位點(diǎn):c2=0.02,P=0.89;AFF1 rs340630位點(diǎn):c2=4.20,P=0.04;AFF3rs10865035位點(diǎn):c2=4.76,P=0.03;EST-1 rs1128334位點(diǎn):c2=2.26×10-3,P=0.95);(3)各基因多態(tài)性位點(diǎn)與RA遺傳易感性之間的關(guān)聯(lián)研究結(jié)果:考慮到RA病例組與對照組間性別構(gòu)成存在統(tǒng)計學(xué)差異,我們在分析RA病例組與對照組間的基因型頻率分布差異、風(fēng)險等位基因在不同遺傳模型(隱性遺傳模型與顯性遺傳模型)下與RA遺傳易感性的關(guān)聯(lián)情況時在性別上進(jìn)行了矯正,研究結(jié)果顯示AIRE rs2075876位點(diǎn)的基因型頻率分布(χ2=8.22,P=0.02)與等位基因頻率分布(A vs.G:χ2=5.30,P=0.02,OR=1.33,95%CI 1.04-1.69)在RA病例組與對照組間均存在統(tǒng)計學(xué)差異,且該位點(diǎn)風(fēng)險等位基因在顯性遺傳模型下與RA遺傳易感性之間存在統(tǒng)計學(xué)關(guān)聯(lián)(A/A+G/A vs.G/G:χ2=7.24,P=7.15×10-3,OR=1.78,95%CI 1.17-2.70);AIRE rs760426位點(diǎn)的基因型頻率分布在RA病例組與對照組間存在統(tǒng)計學(xué)差異(χ2=6.46,P=0.04),且該位點(diǎn)風(fēng)險等位基因G在隱性遺傳模型下與RA遺傳易感性之間存在統(tǒng)計學(xué)關(guān)聯(lián)(G/G vs.G/A+A/A:χ2=5.38,P=0.02,OR=1.73,95%CI 1.09-2.76)。然而,經(jīng)Bofferroni法矯正后僅有AIRE rs2075876位點(diǎn)A等位基因在顯性遺傳模型下與RA遺傳易感性之間的關(guān)聯(lián)結(jié)果經(jīng)Bonferroni法矯正后邊緣顯著。未發(fā)現(xiàn)其余5個基因多態(tài)性位點(diǎn)與RA遺傳易感性相關(guān)。結(jié)論本研究發(fā)現(xiàn)AIRE rs2075876位點(diǎn)、AIRE rs760426位點(diǎn)與我國人群RA遺傳易感性相關(guān),但經(jīng)Bofferroni法矯正后僅有AIRE rs2075876位點(diǎn)A等位基因在顯性遺傳模型下與RA遺傳易感性之間的關(guān)聯(lián)結(jié)果經(jīng)Bonferroni法矯正后邊緣顯著。AIRE基因可能是我國人群RA的一個遺傳易感基因,將來有必要采用大樣本研究來證實(shí)AIRE是否確實(shí)是我國人群RA的遺傳易感基因。本研究尚未發(fā)現(xiàn)KLF12rs1324913、KLF12 rs1887346、AFF1 rs340630、AFF3 rs10865035及ETS-1 rs1128334位點(diǎn)與我國人群RA遺傳易感性相關(guān),這些基因是否與我國人群RA遺傳易感性相關(guān)有待將來采用大樣本的精細(xì)定位研究進(jìn)行驗(yàn)證。
【關(guān)鍵詞】：類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎 KLF12 AIRE AFF1 AFF3 ETS1 基因 易感性
【學(xué)位授予單位】：安徽醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R593.22
【目錄】：

• 英文縮略詞表5-6
• 中文摘要6-10
• 英文摘要10-15
• 前言15-17
• 材料與方法17-25
• 結(jié)果25-38
• 討論38-45
• 結(jié)論45-46
• 參考文獻(xiàn)46-58
• 附錄58-59
• 致謝59-60
• 綜述60-83
• 參考文獻(xiàn)72-83

  本文關(guān)鍵詞：KLF12、AIRE、AFF1、AFF3及ETS-1基因多態(tài)性與中國人群類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎遺傳易感性關(guān)聯(lián)研究，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號：254545