血清miRNA作為胃癌和食管鱗癌診斷標(biāo)志物的研究
本文選題:胃癌 + 血清miRNA。 參考:《南京醫(yī)科大學(xué)》2017年博士論文
【摘要】:背景:胃癌是全球發(fā)病率及死亡率較高的惡性腫瘤之一。由于胃癌患者早期缺乏特異性臨床表現(xiàn),且我國(guó)普查手段尚未全面推廣,大多數(shù)患者往往就診不及時(shí),確診時(shí)已處于進(jìn)展期?紤]到傳統(tǒng)腫瘤標(biāo)志物敏感性和特異性的相對(duì)不足,本研究通過(guò)對(duì)胃癌患者血清miRNA在較大樣本中的系統(tǒng)性分析,旨在尋找對(duì)胃癌具有潛在診斷價(jià)值的血清miRNA標(biāo)志。方法:運(yùn)用Exiqon miRNA qPCR panel進(jìn)行初篩,以初步獲取胃癌患者與正常對(duì)照人群靜脈血清pool中差異表達(dá)的miRNA,隨后進(jìn)一步通過(guò)qRT-PCR技術(shù)分別在訓(xùn)練集和驗(yàn)證集兩個(gè)獨(dú)立樣本中驗(yàn)證所獲得的結(jié)果。并在組織樣本、動(dòng)脈血清以及血清外泌體中對(duì)表達(dá)差異的miRNA進(jìn)行驗(yàn)證,同時(shí)在組織中進(jìn)一步探索了 miRNA的預(yù)后價(jià)值。結(jié)果:初篩階段,通過(guò)芯片共獲得58個(gè)差異表達(dá)的候選miRNA,其中包括在胃癌血清pool中高表達(dá)的51個(gè)miRNA和7個(gè)低表達(dá)miRNA。通過(guò)qRT-PCR在訓(xùn)練集和驗(yàn)證集中對(duì)候選miRNA行進(jìn)一步驗(yàn)證,結(jié)果表明miR-10b-5p、miR-132-3p、miR-185-5p、miR-195-5p、miR-20a-3p 和 miR-296-5p 在胃癌患者血清中呈明顯高表達(dá)。同時(shí),這6個(gè)miRNA組成的分子標(biāo)簽可以作為區(qū)分胃癌患者和正常對(duì)照人群的分子標(biāo)志物。通過(guò)受試者工作特征曲線(ROC)分析,該分子標(biāo)簽在訓(xùn)練集和驗(yàn)證集所對(duì)應(yīng)的曲線下面積(AUC)分別為0.764和0.702。除了 miR-132-3p,另外5個(gè)miRNA在胃癌組織均呈高表達(dá),miR-10b-5p和miR-296-5p具有統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性差異。并且在未接受化療的胃癌患者中,組織中miR-10b-5p和miR-296-5p相對(duì)高表達(dá)的患者預(yù)后欠佳。另外,在胃癌患者血清外泌體中,miR-10b-5p、miR-195-5p、miR-20a-3p 和 miR-296-5p 均呈明顯高表達(dá)。然而,這6個(gè)miRNA在動(dòng)靜脈血中的表達(dá)并未呈現(xiàn)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。結(jié)論:血清 miR-10b-5p、miR-132-3p、miR-185-5p、miR-195-5p、miR-20a-3p和miR-296-5p可作為胃癌的潛在診斷標(biāo)志物,且這6個(gè)miRNA所組成的分子標(biāo)簽?zāi)軌蛴行У膮^(qū)分胃癌患者和正常人群。背景:食管癌是全球常見的惡性消化道腫瘤之一,中國(guó)更是食管癌高發(fā)國(guó)家。食管鱗癌是我國(guó)食管癌的主要病理類型。根治性手術(shù)是最主要的能治愈食管鱗癌的手段,但由于患者往往就診不及時(shí),食管鱗癌患者術(shù)后復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移的幾率仍較高,預(yù)后并不理想。目前尚無(wú)理想、可靠的食管鱗癌診斷標(biāo)志物。因此,尋找能早期診斷食管鱗癌的分子標(biāo)志物,或可為食管鱗癌診斷和預(yù)后的改善提供新的策略。本研究通過(guò)對(duì)食管鱗癌患者的血清miRNA進(jìn)行篩選分析,以期為血清miRNA更好地成為診斷食管鱗癌的標(biāo)志物提供證據(jù)。方法:本研究通過(guò)多個(gè)階段的獨(dú)立試驗(yàn)對(duì)血清miRNA進(jìn)行篩選。運(yùn)用Exiqon miRNA qPCR panel獲取食管鱗癌患者與正常對(duì)照人群靜脈血清pool中差異表達(dá)的miRNA,隨后在訓(xùn)練集、驗(yàn)證集以及額外驗(yàn)證集中,通過(guò)qRT-PCR相對(duì)定量法進(jìn)一步驗(yàn)證初篩得到的miRNA。另外,在組織樣本、動(dòng)脈血清、血清外泌體中對(duì)篩選的miRNA進(jìn)行血清中存在形式的分析。結(jié)果:在芯片初篩階段,共篩選出36個(gè)miRNA成為候選miRNA,其中33個(gè)miRNA在食管鱗癌患者血清poo1中高表達(dá),3個(gè)miRNA低表達(dá)。通過(guò)qRT-PCR技術(shù)在訓(xùn)練集和驗(yàn)證集兩個(gè)階段對(duì)候選的miRNA進(jìn)行進(jìn)一步檢測(cè)驗(yàn)證,最終結(jié)果證實(shí) miR-20b-5p、miR-28-3p、miR-192-5p、miR-223-3p 和 miR-296-5p 在食管鱗癌患者血清中呈明顯高表達(dá)。獨(dú)立的額外驗(yàn)證集實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證了這5個(gè)高表達(dá)的血清miRNA。另外,我們將這5個(gè)miRNA整合為一個(gè)分子標(biāo)簽,發(fā)現(xiàn)該標(biāo)簽具有鑒別食管鱗癌患者和正常對(duì)照人群的能力。隨后我們通過(guò)受試者工作特征曲線(receiver operating characteristic curve,ROC)分析,得出該分子標(biāo)簽在訓(xùn)練集、驗(yàn)證集和額外驗(yàn)證集三個(gè)階段所對(duì)應(yīng)的曲線下面積(Area Under ROC Curve,AUC)分別為 0.753、0.763 和 0.966。同時(shí) 5 個(gè)候選 miRNA在食管鱗癌組織均呈一致性高表達(dá),并且miR-20b-5p、miR-28-3p和miR-192-5p具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,而miR-296-5p在食管鱗癌患者血清外泌體中表達(dá)明顯上調(diào)。這5個(gè)miRNA在食管鱗癌患者動(dòng)靜脈血清中的表達(dá)無(wú)明顯差異。結(jié)論:本研究發(fā)現(xiàn) 了血清 miR-20b-5p、miR-28-3p、miR-192-5p、miR-223-3p和miR-296-5p在食管鱗癌患者中呈顯著高表達(dá),由這5個(gè)miRNA所組成的分子標(biāo)簽可作為食管鱗癌的潛在診斷標(biāo)志物。
[Abstract]:Background : Gastric cancer is one of the most common malignant tumors with high morbidity and mortality . The results are as follows : In addition , the expression of miR - 10b - 5p , miR - 133 - 5p , miR - 10b - 5p and miR - 296 - 5p in the serum pool of gastric cancer is highly expressed by using Exiqon miRNA qPCR panel . The results showed that the expression of miR - 20b - 5p , miR - 28 - 3P , miR - 192 - 5p , miR - 223 - 3P and miR - 296 - 5p in esophageal squamous cell carcinoma was detected by qRT - PCR . The results showed that the expression of miR - 20b - 5p , miR - 28 - 3P , miR - 192 - 5p , miR - 223 - 3P and miR - 296 - 5p in esophageal squamous cell carcinoma was significantly higher . miR - 28 - 3P , miR - 192 - 5p , miR - 223 - 3P and miR - 296 - 5p are highly expressed in esophageal squamous cell carcinoma , and the molecular label composed of these five miRNA can be used as a potential diagnostic marker for esophageal squamous cell carcinoma .
【學(xué)位授予單位】:南京醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:R735
【參考文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):1889025
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