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33個基因座復合擴增體系的構建及其法醫(yī)學應用研究

發(fā)布時間:2018-01-06 16:21

  本文關鍵詞:33個基因座復合擴增體系的構建及其法醫(yī)學應用研究 出處:《南方醫(yī)科大學》2017年博士論文 論文類型:學位論文


  更多相關文章: STR Y-STR 復合擴增 遺傳多態(tài)性 法醫(yī)物證


【摘要】:研究背景:當一個刑事案件或治安案件發(fā)生時,在法醫(yī)物證檢驗中常染色體STR和Y染色體STR通常是分開兩次檢驗的。然而,現(xiàn)有的STR分型技術因受到物證檢材的狀態(tài)、STR基因座復合擴增的個數(shù)、擴增體系耐受能力的大小等因素的影響,常染色體和Y染色體分開檢驗的常規(guī)方式因為對檢測時間、模板狀態(tài)等因素的硬性要求導致不能快速高效全面的提供DNA線索,從而可能導致失去有效偵查的最佳機會。此外,復雜的犯罪現(xiàn)場環(huán)境如高溫、潮濕、微生物等因素可導致收集的現(xiàn)場物證常出現(xiàn)DNA降解、多個個體DNA混合、DNA極其微量等情況,使得常規(guī)檢驗不能獲得良好的分型結果,F(xiàn)有的檢測體系已無法滿足日益增加的刑事案件對于法醫(yī)DNA快速現(xiàn)場檢驗的要求,因此研發(fā)同時檢測常染色體STR和Y染色體STR的復合擴增體系,是目前法醫(yī)DNA檢案的一種迫切需求。目的:構建18個常染色體STR、14個Y-STR和性別鑒定Amelogenin等33個基因座的熒光復合擴增體系,并對該體系進行系統(tǒng)效能驗證和法醫(yī)學參數(shù)評估,以期為法醫(yī)物證檢驗提供一種更高通量、更穩(wěn)定可靠的STR復合擴增和檢測系統(tǒng),從而滿足公安系統(tǒng)實際檢案中對于微量DNA、降解DNA、混合DNA等疑難檢材的檢測需求。方法:本研究利用高效的熱啟動Taq DNA聚合酶、多重復合擴增及六色熒光檢測技術,在18個常染色體STR和1個性別鑒定基因座Amelogenin的基礎上,加入14個Y-STR基因座,引入mini-STR引物設計,優(yōu)化復合擴增反應體系和PCR反應程序,構建了 33個基因座的熒光復合擴增體系,并對該體系進行系統(tǒng)效能驗證和法醫(yī)學應用價值評估。結果與結論:本研究成功構建了 33個基因座的熒光復合擴增體系。該體系包含有13個mini-STR,靈敏度高,特異性好,重復性高,分型準確。該體系在廣東漢族、廣西壯族、廣西瑤族和廣西仡佬族四個群體中的累計匹配概率(CMP)分別為2.39×10-29、1.16×10-28、5.05×10-26 和 2.09×10-28,可為法醫(yī)學應用提供可靠、穩(wěn)定和高信息量的技術保障,特別是為公安系統(tǒng)微量、降解、混合等疑難現(xiàn)場檢材DNA檢驗提供了一種新的高效的技術手段。意義:1、在一個反應體系中將常染色體STR和Y染色體STR兩種遺傳標記同時檢測,可提高檢驗通量、減少檢驗時間和降低檢驗成本;2、在一個反應體系中同時檢測常染色體STR基因座及更多高多態(tài)性的Y染色體STR基因座,既能根據(jù)Y染色體基因座信息進行嫌疑人的快速排查,又能根據(jù)常染色體基因座信息鎖定嫌疑人;3、通過在常染色體STR基因座復合擴增體系加入14個Y-STR基因座,可更好的解決現(xiàn)場案件檢材中混合樣本的男性成分來源個體數(shù)量及分型問題;4、在反應體系中加入的Y-STR基因座可以很好的解決Amelogenin-Y等位基因缺失而造成的性別錯判問題;5、通過引入mini-STR引物設計,并對PCR反應體系進行優(yōu)化,可以提高熒光復合擴增體系的靈敏度以及對降解檢材的檢出成功率;6、該體系系統(tǒng)效能高,具有很好的兼容性和可靠性,可以為公安系統(tǒng)實際案件中DNA檢驗和數(shù)據(jù)庫建設提供一種新的技術手段。
[Abstract]:In order to provide a more efficient and reliable multiplex amplification system for forensic DNA , it is an urgent need to develop a multiplex amplification system for the detection of DNA , degradation of DNA and mixed DNA . in particular to provide a novel high - efficiency technical means for detecting that DNA of the STR and Y chromosome STR at the same time in a reaction system , which can improve the detection flux , reduce the inspection time and reduce the inspection cost ;

【學位授予單位】:南方醫(yī)科大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:D919

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本文編號:1388628

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