本文關(guān)鍵詞：深圳地區(qū)諾如病毒感染及其與宿主受體相互作用的分子流行病學(xué)研究　出處：《南方醫(yī)科大學(xué)》2017年博士論文　論文類型：學(xué)位論文

  更多相關(guān)文章： 諾如病毒 腹瀉 暴發(fā) 溯源 基因型 人類組織血型抗原

【摘要】：目的:對(duì)深圳地區(qū)諾如病毒感染進(jìn)行分子流行病學(xué)研究。對(duì)水和牡蠣中諾如病毒進(jìn)行檢測(cè),進(jìn)行暴發(fā)的溯源研究。并利用暴發(fā)研究諾如病毒感染與宿主受體組織血型抗原相互作用,預(yù)測(cè)諾如病毒的流行強(qiáng)度。方法:收集深圳地區(qū)2005-2016年腹瀉糞便樣本9580份,用GⅠ和GⅡ型諾如病毒Real-time RT-PCR、RT-PCR方法以及杯狀病毒核酸三重RT-PCR進(jìn)行檢測(cè);通過(guò)測(cè)定基因序列,對(duì)諾如病毒進(jìn)行基因進(jìn)化分析和基因分型。建立簡(jiǎn)易的吸附-洗脫法對(duì)水體的諾如病毒進(jìn)行濃縮,還建立了牡蠣中諾如病毒的濃縮方法。另外,對(duì)諾如病毒暴發(fā)進(jìn)行組織血型抗原表型分析和HBGAs結(jié)合區(qū)分析。結(jié)果:(1)深圳地區(qū)散發(fā)NoV的檢出率在12.24-25.37%之間。病毒基本呈隔年增高的趨勢(shì),每年的7-8月份達(dá)到最高峰。各年齡段NoV檢出率在12.58-21.32%。6月齡至3歲的兒童和20歲以上的成人是高危人群。(2)139起腹瀉暴發(fā)疫情中有122起是由諾如病毒引起。諾如病毒性腹瀉全年均可暴發(fā),冬春季是諾如病毒暴發(fā)的高峰。深圳諾如病毒暴發(fā)主要集中在南山區(qū),以幼兒園、學(xué)校及社區(qū)為主要場(chǎng)所。(3)在四起水源性腹瀉暴發(fā)疫情的病人糞便中和可疑水樣中均檢出諾如病毒,NoVGⅡ.4/Den_Haag_2006b和NoVGⅡ.3各兩起,分別由于諾如病毒污染飲用水源、地下蓄水池、山泉水和二次供水所致。還四次從牡蠣中檢測(cè)出諾如病毒。(4)四株諾如病毒全基因組序列同源性為86.8%-99.1%,氨基酸序列的同源性為94.6-99.2%,發(fā)現(xiàn)SZ2012054毒株三個(gè)位點(diǎn)發(fā)生有義突變。通過(guò)Simplot重組分析,發(fā)現(xiàn)SZ2012054、SZ2012049與SZ2010422株在ORF1/ORF2重疊區(qū)發(fā)生重組。935株散發(fā)諾如病毒核苷酸序列同源性及系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,NoV GI毒株間的同源性為62.1%-100.0%,NoVGII為67.4%-100.0%。43株諾如病毒屬于GI,包括GI.1-6、GI.8,共7種基因型;892 株諾如病毒屬于 GII,分別為:GII.4Sydney_2012、GII.4Den_Hagg_2006b、GII.4/Hunter_2004、GII.4/Asia_2003、GII.4/New_Orleans_2009、GII.3、GII.2、GII.5～7、GII.12～14、GII.17和GII.21,共15種基因型,還有部分GII.4不能進(jìn)一步分型。(5)在諾如病毒暴發(fā)疫情中,GI.3、GI.6所致的疫情各兩起,NoVGII所致的疫情118起,包括10個(gè)基因亞型,分別是GII.1-3、6、8、17、21GII.4/Sydney_2012、GII.4/Den_Haag_2006b、GII.4Asia2003,另有 28 起 GII疫情未能定型。2012年7月首次在散發(fā)病例中發(fā)現(xiàn)NoV GII.4/Sydney_2012株,并對(duì)暴發(fā)疫情進(jìn)行了預(yù)警預(yù)測(cè)。深圳地區(qū)的NoV散發(fā)和暴發(fā)的優(yōu)勢(shì)株均為GII.4 Sydney_2012、GII.4 Den_Hagg_2006b、GII.3。(6)對(duì)兩起諾如病毒腹瀉暴發(fā)研究發(fā)現(xiàn),分泌型個(gè)體對(duì)諾如病毒是易感的,且能與非分泌型唾液和抗原結(jié)合。結(jié)論:諾如病毒是深圳地區(qū)腹瀉散發(fā)和暴發(fā)疫情的重要病原,深圳地區(qū)每年都有一個(gè)流行的優(yōu)勢(shì)株和次優(yōu)勢(shì)株,當(dāng)新毒株的出現(xiàn)后逐步取代以往的流行株而成為新的流行株,2005-2016深圳地區(qū)優(yōu)勢(shì)株為GII.4 Sydney_2012、GII.4 Den_Hagg_2006b、GII.3。散發(fā)病例中諾如病毒有22種基因型,暴發(fā)疫情有12種基因型,部分諾如病毒不能分型。還開展溯源研究,從四起疫情的水樣和四批次的牡蠣中檢測(cè)到諾如病毒。通過(guò)研究諾如病毒感染與宿主受體組織血型抗原相互作用,發(fā)現(xiàn)分泌型和非分泌型個(gè)體對(duì)GII.4和GII.3型諾如病毒都易感,GII.4可能和Cairo1有相似的HBGA受體。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：南方醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：R512.5;R181.3

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