本文關(guān)鍵詞：人腸癌細(xì)胞外泌體磷酸化蛋白質(zhì)組中新磷酸化位點的發(fā)現(xiàn)　出處：《暨南大學(xué)》2017年博士論文　論文類型：學(xué)位論文

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【摘要】：全面了解蛋白質(zhì)的翻譯后修飾是以染色體為中心的人類蛋白質(zhì)組計劃(ChromosomeCentric Human Proteome Project,C-HPP)的主要目標(biāo)之一。已知外泌體(exosome)可攜帶磷酸化蛋白質(zhì),并在腫瘤微環(huán)境中扮演重要角色。但由于大量外泌體提純、微量磷酸化肽段富集等難題,尚未見外泌體磷酸化蛋白質(zhì)組的報道。我們認(rèn)為外泌體中可能存在人類新的磷酸化蛋白質(zhì)形式。本研究中,我們實現(xiàn)了高純度SW620外泌體的大量提取,優(yōu)化了微量磷酸化蛋白質(zhì)組的質(zhì)譜分析。我們整合了磷酸化位點數(shù)據(jù)庫dbPTM、PhosphoSitePlus?和SubPhosDB,得到包含42,143個蛋白質(zhì)(及其變體)和184,804個磷酸化位點的多磷酸化蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫。以該數(shù)據(jù)庫為參照,經(jīng)嚴(yán)格的數(shù)據(jù)質(zhì)控,共鑒定到高可信度的313個SW620外泌體磷酸化蛋白質(zhì)及其上的924個磷酸化位點,其中202個為新磷酸化位點。我們發(fā)現(xiàn)外泌體磷酸化蛋白質(zhì)顯著富集于11號染色體,與細(xì)胞磷酸化蛋白質(zhì)具顯著不同的染色體分布特征。另外,SW620外泌體的酪氨酸(Y)-磷酸化位點占6.4%,高于細(xì)胞組分10倍以上;進(jìn)而,我們以HCT116細(xì)胞為驗證,得到相同趨勢。通路分析表明,外泌體Y-磷酸化蛋白質(zhì)不僅顯著調(diào)控外泌體的生命周期,并可顯著調(diào)控ephrin通路引導(dǎo)的細(xì)胞骨架重塑及細(xì)胞緊密連接。綜上,本研究報道了首個高覆蓋度的人細(xì)胞外泌體磷酸化蛋白質(zhì)組,提供符合C-HPP標(biāo)準(zhǔn)的高可信的新磷酸化位點和蛋白質(zhì)磷酸化形式。本研究證明了外泌體是重要的磷酸化信號轉(zhuǎn)運(yùn)者,并可攜帶人類新磷酸化蛋白質(zhì)。
【學(xué)位授予單位】：暨南大學(xué)
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號】：R3416

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