NGS-SNPs體系對腫瘤組織個體識別的法醫(yī)學應用研究
發(fā)布時間:2021-07-14 14:19
腫瘤組織溯源鑒定是國內(nèi)外腫瘤臨床工作中經(jīng)常遇到的難題。腫瘤患者與被切除腫瘤組織的同一性識別對腫瘤患者的準確診斷及精準治療的實施尤其重要。惡性腫瘤高發(fā),腫瘤組織錯誤標記、混淆和污染的情況在醫(yī)院病理科時有發(fā)生,這不僅導致醫(yī)療糾紛的發(fā)生,影響醫(yī)院的正常運行,甚至困擾腫瘤病人的治療,影響腫瘤臨床醫(yī)學的發(fā)展。隨著腫瘤發(fā)病率和死亡率的增高,涉及腫瘤組織的法醫(yī)學鑒定案件也越來越多。目前,已有大量研究報道在腫瘤組織中法醫(yī)學常用的短串聯(lián)重復序列(short tandem repeats,STRs)易發(fā)生突變,使同一個體正常組織和腫瘤組織的STRs基因型不一致,得出錯誤的排除性結(jié)論。在本實驗室對多個系統(tǒng)腫瘤組織STRs的檢測結(jié)果也證實這一現(xiàn)象。因此,需要檢測突變率低的遺傳標記進行腫瘤組織個體識別。與STRs相比,單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)突變率低(~10-8)和擴增片段短(~100bp)的特點使其更適用于腫瘤組織法醫(yī)學鑒定。然而,由于SNPs的二等位基因現(xiàn)象,需要檢測大量SNPs位點才能獲得與STR相似的效能,達到個體識...
【文章來源】:河北醫(yī)科大學河北省
【文章頁數(shù)】:184 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
IonTorrentSuite的測序情況總結(jié)Fig.1RunsummaryonIonTorrentSuite
44圖3P256基因座上游引物區(qū)Sanger測序序列Fig.3ForwardprimersequenceinSNPP256bySangersequencingThebasewithunderlinewasthemutation.圖4rs2319818基因座的上游引物區(qū)Sanger測序序列Fig.4ForwardprimersequenceinSNPrs2319818bySangersequencingThebaseswithunderlinewerethemutationsandthesquarewasthebasedeletion.
44圖3P256基因座上游引物區(qū)Sanger測序序列Fig.3ForwardprimersequenceinSNPP256bySangersequencingThebasewithunderlinewasthemutation.圖4rs2319818基因座的上游引物區(qū)Sanger測序序列Fig.4ForwardprimersequenceinSNPrs2319818bySangersequencingThebaseswithunderlinewerethemutationsandthesquarewasthebasedeletion.
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Cancer incidence and mortality in China, 2014[J]. Wanqing Chen,Kexin Sun,Rongshou Zheng,Hongmei Zeng,Siwei Zhang,Changfa Xia,Zhixun Yang,He Li,Xiaonong Zou,Jie He. Chinese Journal of Cancer Research. 2018(01)
[2]微單倍型遺傳標記及其法醫(yī)遺傳學應用[J]. 饒旼,李彩霞,趙釗,胡勝,趙鵬,聶勝潔,王樂. 刑事技術. 2017(04)
[3]婦科腫瘤和乳腺癌組織常染色體和X染色體STR的突變分析[J]. 孫麗娟,李淑瑾,付光平,白梅,董春楠,楊波,陳平忍,王占東,付麗紅,叢斌. 中國法醫(yī)學雜志. 2017(04)
[4]基于二代測序平臺的90個常染色體SNP分型研究[J]. 李海燕,張楚楚,唐振亞,李燃,陳紅英,童大躍,孫宏鈺. 中國法醫(yī)學雜志. 2016(06)
[5]二代測序技術在法醫(yī)學中的應用進展[J]. 張素華,邊英男,趙琪,李成濤. 法醫(yī)學雜志. 2016(04)
[6]應用Ion Torrent PGMTM平臺檢測中國漢族124個身份鑒定SNPs[J]. 宋鶴,周懿舒,劉鋒,沈紅纓,于蛟,趙金玲,趙斌,郭飛,姜先華. 中國法醫(yī)學雜志. 2016(04)
[7]二代測序技術及其在法醫(yī)遺傳學中的應用[J]. 王樂,葉健,白雪,楊帆,趙興春. 刑事技術. 2015(05)
[8]腫瘤個體化治療相關基因突變檢測試劑實驗室性能評估要求解析[J]. 何靜云,李耀華. 中國醫(yī)藥生物技術. 2015(05)
[9]測序新技術Ion Torrent PGM及其法醫(yī)學應用[J]. 劉宇軒,張文瓊,黃代新. 中國法醫(yī)學雜志. 2015(01)
[10]人肺癌組織19個常染色體STR及性別基因座變異分析[J]. 鐘巧娥,王景舟,王紅梅,張建華,陳麗琴. 中國法醫(yī)學雜志. 2015(01)
碩士論文
[1]下一代測序技術在混合DNA分析中的應用研究[D]. 劉奇.河北醫(yī)科大學 2017
[2]腫瘤組織SNP突變分析及其MPS技術應用初探[D]. 鄧佩佩.河北醫(yī)科大學 2017
[3]腫瘤間質(zhì)比在非小細胞肺癌中的預后作用研究[D]. 徐軍.山東大學 2016
[4]乳腺癌及婦科腫瘤組織常染色體SNP突變分析[D]. 白梅.河北醫(yī)科大學 2016
本文編號:3284310
【文章來源】:河北醫(yī)科大學河北省
【文章頁數(shù)】:184 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
IonTorrentSuite的測序情況總結(jié)Fig.1RunsummaryonIonTorrentSuite
44圖3P256基因座上游引物區(qū)Sanger測序序列Fig.3ForwardprimersequenceinSNPP256bySangersequencingThebasewithunderlinewasthemutation.圖4rs2319818基因座的上游引物區(qū)Sanger測序序列Fig.4ForwardprimersequenceinSNPrs2319818bySangersequencingThebaseswithunderlinewerethemutationsandthesquarewasthebasedeletion.
44圖3P256基因座上游引物區(qū)Sanger測序序列Fig.3ForwardprimersequenceinSNPP256bySangersequencingThebasewithunderlinewasthemutation.圖4rs2319818基因座的上游引物區(qū)Sanger測序序列Fig.4ForwardprimersequenceinSNPrs2319818bySangersequencingThebaseswithunderlinewerethemutationsandthesquarewasthebasedeletion.
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Cancer incidence and mortality in China, 2014[J]. Wanqing Chen,Kexin Sun,Rongshou Zheng,Hongmei Zeng,Siwei Zhang,Changfa Xia,Zhixun Yang,He Li,Xiaonong Zou,Jie He. Chinese Journal of Cancer Research. 2018(01)
[2]微單倍型遺傳標記及其法醫(yī)遺傳學應用[J]. 饒旼,李彩霞,趙釗,胡勝,趙鵬,聶勝潔,王樂. 刑事技術. 2017(04)
[3]婦科腫瘤和乳腺癌組織常染色體和X染色體STR的突變分析[J]. 孫麗娟,李淑瑾,付光平,白梅,董春楠,楊波,陳平忍,王占東,付麗紅,叢斌. 中國法醫(yī)學雜志. 2017(04)
[4]基于二代測序平臺的90個常染色體SNP分型研究[J]. 李海燕,張楚楚,唐振亞,李燃,陳紅英,童大躍,孫宏鈺. 中國法醫(yī)學雜志. 2016(06)
[5]二代測序技術在法醫(yī)學中的應用進展[J]. 張素華,邊英男,趙琪,李成濤. 法醫(yī)學雜志. 2016(04)
[6]應用Ion Torrent PGMTM平臺檢測中國漢族124個身份鑒定SNPs[J]. 宋鶴,周懿舒,劉鋒,沈紅纓,于蛟,趙金玲,趙斌,郭飛,姜先華. 中國法醫(yī)學雜志. 2016(04)
[7]二代測序技術及其在法醫(yī)遺傳學中的應用[J]. 王樂,葉健,白雪,楊帆,趙興春. 刑事技術. 2015(05)
[8]腫瘤個體化治療相關基因突變檢測試劑實驗室性能評估要求解析[J]. 何靜云,李耀華. 中國醫(yī)藥生物技術. 2015(05)
[9]測序新技術Ion Torrent PGM及其法醫(yī)學應用[J]. 劉宇軒,張文瓊,黃代新. 中國法醫(yī)學雜志. 2015(01)
[10]人肺癌組織19個常染色體STR及性別基因座變異分析[J]. 鐘巧娥,王景舟,王紅梅,張建華,陳麗琴. 中國法醫(yī)學雜志. 2015(01)
碩士論文
[1]下一代測序技術在混合DNA分析中的應用研究[D]. 劉奇.河北醫(yī)科大學 2017
[2]腫瘤組織SNP突變分析及其MPS技術應用初探[D]. 鄧佩佩.河北醫(yī)科大學 2017
[3]腫瘤間質(zhì)比在非小細胞肺癌中的預后作用研究[D]. 徐軍.山東大學 2016
[4]乳腺癌及婦科腫瘤組織常染色體SNP突變分析[D]. 白梅.河北醫(yī)科大學 2016
本文編號:3284310
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