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苦瓜遺傳圖譜構(gòu)建及白粉病抗性的QTL定位

發(fā)布時間:2017-06-28 20:16

  本文關(guān)鍵詞:苦瓜遺傳圖譜構(gòu)建及白粉病抗性的QTL定位,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:苦瓜(Momordica charantia L.)對白粉病的抗性是苦瓜露地和設(shè)施栽培及抗病育種的重要性狀,其抗性的生理基礎(chǔ)、遺傳機(jī)制和QTL定位是尚未解決的重要科學(xué)問題。因此,本研究首先為篩選抗白粉病的苦瓜種質(zhì),開展抗病育種,探討苦瓜抗白粉病的生理基礎(chǔ),以21份來源不同的苦瓜種質(zhì)資源為試材,連續(xù)2年鑒定白粉病抗病性,并從中選出4份抗性不同的材料,研究了相關(guān)生理生化指標(biāo)的動態(tài)變化及葉片結(jié)構(gòu)與白粉病抗性之間的關(guān)系;其次采用主基因+多基因混合遺傳分離分析法對抗白粉病遺傳進(jìn)行研究;再次為了快速獲取高質(zhì)量的苦瓜基因組DNA,以進(jìn)行白粉病抗性基因分子標(biāo)記研究,探究了苦瓜基因組DNA提取的最佳方法和取樣的最適葉齡,對影響ISSR-PCR的主要因素進(jìn)行了優(yōu)化;然后采用多代自交的野生苦瓜04-17-3和栽培苦瓜25-1雜交產(chǎn)生的F2分離群體120株為構(gòu)圖群體,采用ISSR、SRAP和SSR標(biāo)記構(gòu)建苦瓜分子標(biāo)記遺傳連鎖圖譜;最后,以120個F2單株和F2單粒傳獲得的120個F2:3家系為白粉病抗性性狀調(diào)查群體,利用已構(gòu)建好的苦瓜遺傳圖譜對白粉病抗性進(jìn)行了QTL定位。本研究主要結(jié)果如下:1.不同來源的苦瓜品系之間白粉病發(fā)病程度表現(xiàn)出較大的差異和多樣性,28.57%的苦瓜種質(zhì)資源表現(xiàn)為抗病,28.57%表現(xiàn)為中抗,33.33%表現(xiàn)為感病,9.53%表現(xiàn)為高感;抗病品系可通過維持葉綠素質(zhì)量分?jǐn)?shù)水平,提高可溶性糖質(zhì)量分?jǐn)?shù),增強(qiáng)POD、PPO、PAL、SOD、CAT、APX酶活性清除因病菌侵染積累的H2O2和活性氧,使植物維持體內(nèi)的活性氧產(chǎn)生和清除的動態(tài)平衡,使細(xì)胞壁木質(zhì)化,阻止病原菌進(jìn)一步入侵,從而來提高對白粉病的抗性?共】喙掀废等~片的蠟質(zhì)含量顯著高于感病品系,蠟質(zhì)層是其抵抗和延遲病原菌侵入的一個有力結(jié)構(gòu)屏障。葉背面的氣孔及茸毛密度與病情指數(shù)呈顯著正相關(guān)關(guān)系。PAL、PPO、POD、SOD、CAT活性、可溶性糖含量及葉綠素質(zhì)量分?jǐn)?shù)、葉背面茸毛密度及氣孔密度、葉片蠟質(zhì)含量均可作為苦瓜對白粉病抗性早期鑒定的輔助指標(biāo)。2.苦瓜對白粉病的抗性遺傳符合2對加性-顯性-上位性主基因+加性-顯性多基因模型(E-1),抗病對感病為不完全隱性:2對主基因的加性效應(yīng)值均為-12.00;2對主基因分別具有正向部分顯性和正向超顯性作用,加性效應(yīng)值均大于其顯性效應(yīng)值,上位性效應(yīng)值(i+jab+jba+1)為負(fù)值。從遺傳率上看,回交世代和F2的主基因的值分別為55.14%、43.56%和95.22%,多基因的值分別為16.10%、26.57%和0,環(huán)境變異在4.78%-29.87%之間。主基因和多基因共同決定了苦瓜對白粉病的抗性,以主基因遺傳為主,同時還受到環(huán)境變異的部分影響。在白粉病抗性育種過程中,應(yīng)注意利用加性效應(yīng),選用白粉病抗性基因較多的材料作為親本,并在早代進(jìn)行選擇,尤其是F2代主基因選擇效率最高。3.采用改良CTAB法從苦瓜頂端嫩葉中提取的基因組DNA產(chǎn)量和純度均較高,效果較好。優(yōu)化后的ISSR-PCR反應(yīng)體系為:25μl 10×PCR buffer,2.5 mmol/L MgCl2,250 μmol/L dNTPs,10 ng模板DNA,0.75 U Taq酶,引物濃度0.7μmol/L,反應(yīng)總體積為25μl,引物UBC826最佳退火溫度為53℃C。4.構(gòu)建的遺傳連鎖圖總長為732.1 cM,共116個位點(diǎn),包含了47個ISSR標(biāo)記,53個SRAP標(biāo)記,16個SSR標(biāo)記,共13個連鎖群,平均圖距為6.31 cM,基本滿足QTL定位的要求。每條連鎖群上的標(biāo)記數(shù)為2-33個不等,距離在1.7~131.1 cM之間,偏分離比例為27.50%。5.在F2代中共檢測到6個QTL位點(diǎn),主要位于第1、第8和第10連鎖群上,貢獻(xiàn)率為0.65-12.15%,6個QTL位點(diǎn)的總貢獻(xiàn)率為39.02%。在F2:3家系中共檢測到11個QTL位點(diǎn),第一連鎖群上有3個位點(diǎn),第10連鎖群上有5個位點(diǎn)。這兩條連鎖群上位點(diǎn)比較集中,QTLs貢獻(xiàn)率為0.97%-12.16%,F2:3家系中的11個QTL位點(diǎn)貢獻(xiàn)率總和為62.86%。2年中有6個QTL在F2(2011年秋季)和F2:3家系(2012年春季)分別定位在了相同的基因座(Bz1.1/LG1,28.4cM;Bz1.2/LG1,77.3cM;Bz1.3/LG1,116.3cM; Bz8.1/LG8,18.0cM;Bz10.4/LG10,62.5cM;Bz10.5/LG10,103.2cM)。6個QTL位點(diǎn)的加性和顯性效應(yīng)的方向性比較一致。
【關(guān)鍵詞】:苦瓜 白粉病抗性 遺傳規(guī)律 遺傳圖譜 QTL定位
【學(xué)位授予單位】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:S436.429
【目錄】:
  • 摘要13-15
  • Abstract15-18
  • 第一章 前言18-34
  • 1.1 植物抗病的生理生化基礎(chǔ)18-23
  • 1.1.1 植物抗病性的化學(xué)因素18-22
  • 1.1.2 植物抗病性的物理因素22-23
  • 1.2 瓜類植物白粉病抗性的遺傳規(guī)律研究進(jìn)展23-24
  • 1.3 瓜類作物遺傳圖譜構(gòu)建的研究進(jìn)展24-28
  • 1.3.1 黃瓜遺傳圖譜構(gòu)建24-26
  • 1.3.2 西瓜遺傳圖譜構(gòu)建26
  • 1.3.3 甜瓜遺傳圖譜構(gòu)建26-27
  • 1.3.4 苦瓜遺傳圖譜構(gòu)建27-28
  • 1.4 瓜類作物主要性狀QTL定位及基因精細(xì)定位研究進(jìn)展28-31
  • 1.4.1 黃瓜主要性狀的基因定位28-29
  • 1.4.2 瓜主要性狀的基因定位29
  • 1.4.3 甜瓜主要性狀的基因定位29-30
  • 1.4.4 苦瓜QTL定位30-31
  • 1.5 瓜類作物標(biāo)記引物的開發(fā)31-32
  • 1.5.1 黃瓜31
  • 1.5.2 甜瓜31-32
  • 1.5.3 西瓜32
  • 1.5.4 苦瓜32
  • 1.6 目的和意義32-34
  • 第二章 苦瓜種質(zhì)資源白粉病抗性鑒定及抗性的生理基礎(chǔ)34-57
  • 2.1 材料與方法35-39
  • 2.1.1 材料35
  • 2.1.2 方法35-38
  • 2.1.3 數(shù)據(jù)分析38-39
  • 2.2 結(jié)果與分析39-51
  • 2.2.1 不同苦瓜種質(zhì)資源的抗白粉病能力39-40
  • 2.2.2 不同品系苦瓜的POD和SOD活性40-41
  • 2.2.3 不同品系苦瓜的CAT和PAL活性41-42
  • 2.2.4 不同品系苦瓜的PPO活性42-43
  • 2.2.5 葉綠素和可溶性糖質(zhì)量分?jǐn)?shù)與白粉病抗性的關(guān)系43-44
  • 2.2.6 可溶性蛋白和AsA質(zhì)量分?jǐn)?shù)與白粉病抗性的關(guān)系44-45
  • 2.2.7 APX活性與白粉病抗性的關(guān)系45-46
  • 2.2.8 生理生化指標(biāo)與白粉病抗性的相關(guān)性46-47
  • 2.2.9 不同抗感白粉病苦瓜品系葉片蠟質(zhì)含量和比葉重的比較47-48
  • 2.2.10 不同抗感白粉病苦瓜品系葉片氣孔密度和茸毛密度的比較48-49
  • 2.2.11 不同抗感白粉病苦瓜品系葉片橫切面結(jié)構(gòu)的比較49-51
  • 2.3 結(jié)論與討論51-57
  • 2.3.1 不同苦瓜種質(zhì)資源白粉病抗性的鑒定51
  • 2.3.2 白粉病抗性的生理生化基礎(chǔ)51-54
  • 2.3.3 葉片結(jié)構(gòu)與白粉病抗性的關(guān)系54-56
  • 2.3.4 小結(jié)56-57
  • 第三章 苦瓜白粉病抗性的主基因+多基因混合遺傳模型分析57-64
  • 3.1 材料與方法58-59
  • 3.1.1 材料58
  • 3.1.2 試驗(yàn)方法58
  • 3.1.3 數(shù)據(jù)分析58-59
  • 3.2 結(jié)果與分析59-62
  • 3.2.1 不同世代中白粉病病情指數(shù)的次數(shù)分布59
  • 3.2.2 遺傳模型的選擇和檢驗(yàn)59-61
  • 3.2.3 遺傳參數(shù)的估計(jì)61-62
  • 3.3 結(jié)論與討論62-64
  • 第四章 苦瓜基因組DNA的提取及ISSR擴(kuò)增體系的優(yōu)化64-73
  • 4.1 材料與方法64-68
  • 4.1.1 材料64-65
  • 4.1.2 基因組DNA提取方法65
  • 4.1.3 DNA的檢測65-66
  • 4.1.4 原初擴(kuò)增條件及擴(kuò)增程序66
  • 4.1.5 ISSR-PCR反應(yīng)體系的優(yōu)化試驗(yàn)設(shè)計(jì)66-68
  • 4.1.6 優(yōu)化體系的驗(yàn)證68
  • 4.2 結(jié)果與分析68-71
  • 4.2.1 不同DNA提取方法的比較68-69
  • 4.2.2 不同部位葉片基因組DNA提取效果的比較69
  • 4.2.3 退火溫度對ISSR-PCR的影響69-70
  • 4.2.4 各組成成分濃度對ISSR-PCR的影響70-71
  • 4.3 結(jié)論與討論71-73
  • 第五章 苦瓜分子標(biāo)記遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建73-84
  • 5.1 材料與方法74-76
  • 5.1.1 材料74-75
  • 5.1.2 方法75-76
  • 5.2 結(jié)果與分析76-81
  • 5.2.1 親本間表現(xiàn)多態(tài)性引物的篩選76-77
  • 5.2.2 F_2群體中分子標(biāo)記的分離77-78
  • 5.2.3 苦瓜分子標(biāo)記遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建78-81
  • 5.3 結(jié)論與討論81-84
  • 5.3.1 苦瓜遺傳連鎖圖譜的比較及飽和度分析81-82
  • 5.3.2 作圖親本及分離群體類型的選擇82
  • 5.3.3 分子標(biāo)記種類的選擇82-83
  • 5.3.4 偏分離分析83
  • 5.3.5 結(jié)論83-84
  • 第六章 苦瓜白粉病抗性的QTL定位84-91
  • 6.1 材料與方法84-85
  • 6.1.1 材料84-85
  • 6.1.2 方法85
  • 6.2 結(jié)果與分析85-89
  • 6.2.1 不同年份兩親本和F_2及F_(2:3)的性狀變異分析85-86
  • 6.2.2 對白粉病病情指數(shù)的QTL定位86-89
  • 6.3 結(jié)論與討論89-91
  • 6.3.1 討論89-90
  • 6.3.2 結(jié)論90-91
  • 第七章 結(jié)論與展望91-94
  • 7.1 結(jié)論91-93
  • 7.1.1 苦瓜種質(zhì)資源白粉病抗性鑒定及其抗性的生理生化基礎(chǔ)91
  • 7.1.2 苦瓜白粉病抗性的遺傳特性91
  • 7.1.3 苦瓜DNA提取及ISSR擴(kuò)增體系的優(yōu)化91-92
  • 7.1.4 苦瓜遺傳連鎖圖譜構(gòu)建92
  • 7.1.5 苦瓜白粉病抗性的QTL定位92-93
  • 7.2 展望93-94
  • 參考文獻(xiàn)94-108
  • 附錄108-110
  • 致謝110-111
  • 攻讀博士學(xué)位期間發(fā)表的論文111

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