腸道微生態(tài)影響蘭州熊蜂蜂王生殖機理研究
【文章頁數(shù)】:98 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1.1技術(shù)路線
1.6.3技術(shù)路線1.6.4研究意義
圖2.1聯(lián)合6種基因利用貝葉斯法和最大似然法構(gòu)建熊蜂屬的系統(tǒng)發(fā)育樹(“BG”種類采自我國,BG054為蘭州熊蜂;后面有黑點表明在之前的進(jìn)化樹中沒有的種;右邊為各亞屬名稱;LF:長臉型;SF:短臉型;進(jìn)化樹的頂部是外群)
我們利用采集的26個熊蜂種,參考Cameron(2007)研究中的183個熊蜂種以及10個外群種為研究對象,總共209個熊蜂種類,38個亞屬。通過聯(lián)合2種線粒體基因(COI和16SrRNA)和4種核基因(Argk、Opsin、EF-1α和PEPCK)序列,利用貝葉斯分析法和最....
圖3.2三組蜂王腸道菌樣本中共有和特有的OTU分布情況(UQ:未交配蜂王;MQ:交配蜂王;OQ:產(chǎn)卵蜂王)
原始數(shù)據(jù)經(jīng)過去除引物序列、PEreads拼接、過濾掉低質(zhì)量的序列以及去除嵌合體后,最后我們從86個蜂王腸道樣本中總共得到2,107,642條EffectiveTags,平均每個樣本中的EffectiveTags為24,507±961(Mean±SE),單個樣品中的Effec....
圖3.3不同生理狀態(tài)蜂王腸道樣本之間的PCoA分析(Oviposition queen:產(chǎn)卵蜂王;Mated queen:交配蜂王;Unmated queen:未交配蜂王)
β多樣性分析是針對不同樣品之間的分析,在物種注釋結(jié)果和OTU豐富度信息的基礎(chǔ)上,通過計算Bray-curtis距離來反映出不同樣品間微生物群落的結(jié)構(gòu)差異。同時基于這種計算的距離矩陣,通過主坐標(biāo)分析(PCoA)進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)并挖掘樣品間微生物群落結(jié)構(gòu)的差異(圖3.3),其中圖中不同顏色....
本文編號:4022930
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