免疫、生長和繁殖都是豬育種中的重要數(shù)量性狀。闡明這些數(shù)量性狀的遺傳機制是豬育種工作者的重要研究任務(wù)之一。而隨著全基因組范圍內(nèi)的分子標(biāo)記檢測技術(shù)的發(fā)展,存在著大量的利用數(shù)量性狀基因座位(quantitative trait loci,QTL)定位、全基因組關(guān)聯(lián)分析(genome-wide association study,GWAS)來對這些性狀各自的分子遺傳機制進(jìn)行解析的研究。更重要的是,這些性狀并非相互獨立,而是存在關(guān)聯(lián)、相互影響的。比如,多種免疫因子被證實可以參與生長與繁殖過程;而免疫這類對于生命維持重要的生理過程會優(yōu)先消耗本該提供給生長與繁殖的能量,從而形成了它們之間此消彼長的關(guān)系。并且,我們發(fā)現(xiàn)我國每年從西方國家引進(jìn)的大量種豬到了國內(nèi)以后,由于豬場衛(wèi)生狀況較差、免疫程序復(fù)雜,出現(xiàn)了性能“退化”的現(xiàn)象,這可能是由于免疫對其他性狀的影響所致。但遺憾的是,從遺傳角度系統(tǒng)揭示免疫與生長、免疫與繁殖之間關(guān)聯(lián)機制的研究工作目前未見報道;而免疫程序、環(huán)境衛(wèi)生狀況的改變對生長、繁殖等這些生產(chǎn)相關(guān)性狀產(chǎn)生影響的具體機制尚不明確;此外,這種環(huán)境的變化持續(xù)下去是否可以形成免疫與生長、繁殖性狀的共進(jìn)化...

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【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

圖1-1不同類型的多效性[38]，包括（a）與（b）生物學(xué)多效性；（c）偽多效性；（d）介導(dǎo)多效性Figure1-1Differenttypesofpleiotropy[38],including(a)and(b)biologicalpleiotropy;(c)

1導(dǎo)論7進(jìn)化，但是與非特異性免疫相關(guān)的基因也會受到正向選擇的作用發(fā)生進(jìn)化。比如一類調(diào)控非特異性免疫的多肽——防御素，多個不同的研究均證實編碼防御素的基因序列dN要大于dS，即受到了正向選擇壓力的作用[34-36]。1.1.3免疫與生長、繁殖間的關(guān)系生物體是一個有機整體，因此各種性....

圖1-2選擇性掃除示意圖[125]

上海交通大學(xué)博士學(xué)位論文20將當(dāng)成未知變量與模型中的其他未知參數(shù)同時估計[121]，這種方法可能是估計EG的最優(yōu)方法，但是在數(shù)據(jù)量較大且模型更加復(fù)雜時，用于參數(shù)估計的馬爾科夫鏈蒙特卡洛（MarkovChainMonteCarlo）過程很難收斂。③先利用普通的線性混合模型估計不同環(huán)....

圖2-1免疫與生長、繁殖性狀之間多效基因與基因集挖掘流程

上海交通大學(xué)博士學(xué)位論文26胞計數(shù)、細(xì)胞因子與補體等多種免疫活性物質(zhì)的水平等等；生長性狀則屬于豬的生產(chǎn)相關(guān)性狀，包括生長速度、胴體重等各類生長相關(guān)的具體表型；繁殖性狀則包括了調(diào)控繁殖的激素、生殖器官、衡量繁殖能力的指標(biāo)（比如產(chǎn)仔數(shù)、乳頭數(shù)等）等各個表型。所有這些性狀的具體名稱與縮....

圖2-2交集QTL區(qū)段在免疫、生長與繁殖QTL中的分布情況

上海交通大學(xué)博士學(xué)位論文302.2.1QTL交集區(qū)段免疫與生長、免疫與繁殖性狀之間的QTL交集在各個性狀QTL中的具體數(shù)量分布如圖2-2所示。由圖可見，大部分生長與繁殖性狀的QTL都與免疫QTL存在交集現(xiàn)象，其中，14.6%的生長QTL與免疫QTL存在交集，7.0%的繁殖QTL與....

本文編號：3932058