北京鴨GBS平臺構建及部分經(jīng)濟性狀全基因組關聯(lián)分析
發(fā)布時間:2023-04-04 02:47
北京鴨是我國著名的肉鴨品種,研究其采食性狀的表型規(guī)律和遺傳基礎有助改良其飼料轉化效率,提高生產(chǎn)性能,全面提升本土北京鴨品種的市場競爭力。本研究中,我們選擇并使用自動采食記錄系統(tǒng)記錄了 358只雄性北京鴨的采食行為數(shù)據(jù),并且比較了不同剩余采食量水平的肉鴨采食行為上的差異。結果表明,總采食時間、日采食量和每次平均采食量與飼料轉化效率(RFI,FCR)性狀之間存在很強的正相關關系;每次平均采食量和體重之間同樣被發(fā)現(xiàn)存在顯著的相關關系(R = 0.32,0.36;P<0.01);日平均采食速度和每餐時間與飼料效率之間有微弱的相關關系(R = 0.14~0.15,P<0.01);采食間隔與飼料利用率之間并沒有發(fā)現(xiàn)顯著相關。我們分析了每天采食行為的變化,發(fā)現(xiàn)高RFI水平的北京鴨在整個飼養(yǎng)期內都保持較高的飼料消耗,并在日采食次數(shù)與其他RFI水平肉鴨上有明顯不同,并且隨著年齡的增長,這些差異也逐漸擴大,但在每日有效采食次數(shù)不同RFI組別(高、中、低組)之間沒有顯著差異。本研究結果表明,自動采食記錄系統(tǒng)能夠準確記錄北京鴨采食行為,同時部分采食行為對飼料轉化效率有顯著影響,有望用于新的育種指標...
【文章頁數(shù)】:98 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略詞
第一章 文獻綜述
1.1 飼料轉化效率研究進展
1.1.1 飼料轉化效率概述
1.1.2 飼料轉化效率遺傳基礎研究
1.1.3 采食行為概述
1.1.4 全自動種鴨生產(chǎn)性能測定系統(tǒng)
1.2 簡化基因組分型技術
1.2.1 測序技術的發(fā)展
1.2.2 分子標記的發(fā)展與應用
1.2.3 標記輔助選擇技術發(fā)展
1.2.4 簡化基因組測序
1.3 本文的研究目的與意義
第二章 北京鴨采食行為研究
2.1 前言
2.2 材料與方法
2.2.1 實驗群體
2.2.2 數(shù)據(jù)記錄與處理
2.2.3 飼料轉化效率性狀計算
2.2.4 統(tǒng)計分析
2.3 結果
2.3.1 表型統(tǒng)計
2.3.2 表型相關
2.3.3 不同RFI水平北京鴨采食行為差異
2.3.4 采食行為隨時間變化的規(guī)律
2.3.5 北京鴨采食行為與空間位置的關系
2.3.6 北京鴨每日的采食行為分布
2.4 討論
2.4.1 標準采食間隔
2.4.2 北京鴨采食習性
2.4.3 北京鴨飼料轉化效率與采食行為的關系
第三章 北京鴨GBS基因分型
3.1 前言
3.2 材料與方法
3.2.1 主要試驗儀器
3.2.2 主要試驗試劑和溶液
3.2.3 血液基因組提取
3.2.4 基因組消化以及測序
3.2.5 生物信息學分析
3.2.6 RFLP-PCR驗證
3.3 結果
3.3.2 測序及分型結果
3.3.3 驗證分型結果
3.4 討論
第四章 北京鴨部分經(jīng)濟性狀基因組關聯(lián)分析
4.1 前言
4.2 材料與方法
4.2.1 主要試驗儀器
4.2.2 主要試驗試劑和溶液
4.2.3 表型收集
4.2.4 簡化基因組測序
4.2.5 數(shù)據(jù)分析
4.2.6 單點關聯(lián)分析
4.2.7 基因關聯(lián)分析
4.2.8 統(tǒng)計分析
4.2.9 功能注釋
4.3 結果與分析
4.3.1 表型信息描述
4.3.2 數(shù)據(jù)處理
4.3.3 遺傳參數(shù)
4.3.4 單位點關聯(lián)分析
4.3.5 基因模型關聯(lián)分析
4.3.6 功能注釋
4.4 討論
4.4.1 北京鴨飼料轉化效率遺傳參數(shù)估計
4.4.2 北京鴨飼料轉化效率性狀全基因組關聯(lián)分析
第五章 結論
參考文獻
致謝
附錄
個人簡歷
本文編號:3781639
【文章頁數(shù)】:98 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略詞
第一章 文獻綜述
1.1 飼料轉化效率研究進展
1.1.1 飼料轉化效率概述
1.1.2 飼料轉化效率遺傳基礎研究
1.1.3 采食行為概述
1.1.4 全自動種鴨生產(chǎn)性能測定系統(tǒng)
1.2 簡化基因組分型技術
1.2.1 測序技術的發(fā)展
1.2.2 分子標記的發(fā)展與應用
1.2.3 標記輔助選擇技術發(fā)展
1.2.4 簡化基因組測序
1.3 本文的研究目的與意義
第二章 北京鴨采食行為研究
2.1 前言
2.2 材料與方法
2.2.1 實驗群體
2.2.2 數(shù)據(jù)記錄與處理
2.2.3 飼料轉化效率性狀計算
2.2.4 統(tǒng)計分析
2.3 結果
2.3.1 表型統(tǒng)計
2.3.2 表型相關
2.3.3 不同RFI水平北京鴨采食行為差異
2.3.4 采食行為隨時間變化的規(guī)律
2.3.5 北京鴨采食行為與空間位置的關系
2.3.6 北京鴨每日的采食行為分布
2.4 討論
2.4.1 標準采食間隔
2.4.2 北京鴨采食習性
2.4.3 北京鴨飼料轉化效率與采食行為的關系
第三章 北京鴨GBS基因分型
3.1 前言
3.2 材料與方法
3.2.1 主要試驗儀器
3.2.2 主要試驗試劑和溶液
3.2.3 血液基因組提取
3.2.4 基因組消化以及測序
3.2.5 生物信息學分析
3.2.6 RFLP-PCR驗證
3.3 結果
3.3.2 測序及分型結果
3.3.3 驗證分型結果
3.4 討論
第四章 北京鴨部分經(jīng)濟性狀基因組關聯(lián)分析
4.1 前言
4.2 材料與方法
4.2.1 主要試驗儀器
4.2.2 主要試驗試劑和溶液
4.2.3 表型收集
4.2.4 簡化基因組測序
4.2.5 數(shù)據(jù)分析
4.2.6 單點關聯(lián)分析
4.2.7 基因關聯(lián)分析
4.2.8 統(tǒng)計分析
4.2.9 功能注釋
4.3 結果與分析
4.3.1 表型信息描述
4.3.2 數(shù)據(jù)處理
4.3.3 遺傳參數(shù)
4.3.4 單位點關聯(lián)分析
4.3.5 基因模型關聯(lián)分析
4.3.6 功能注釋
4.4 討論
4.4.1 北京鴨飼料轉化效率遺傳參數(shù)估計
4.4.2 北京鴨飼料轉化效率性狀全基因組關聯(lián)分析
第五章 結論
參考文獻
致謝
附錄
個人簡歷
本文編號:3781639
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