五種斑潛蠅形態(tài)特征比較研究及重要種的遺傳結構分析
發(fā)布時間:2022-10-06 17:01
斑潛蠅屬Liriomyza種類繁多,約有160種可為害栽培作物和觀賞植物。由于這些昆蟲個體小或微。ㄩL1.3~2.1mm),形態(tài)特征相似,部分種類生態(tài)位重疊明顯,種間競爭與替代迅速,鑒定工作受蟲態(tài)和蟲體保存完整狀態(tài)的限制,因此其分類鑒定比較困難,在實際工作中容易造成混亂,給植物檢疫、測報和防治等工作帶來困難。2014-2017年作者調查采集了中國大陸11省、38市4771頭斑潛蠅屬昆蟲,經形態(tài)和分子鑒定種類共有5種,分別為三葉斑潛蠅L trifolii、美洲斑潛蠅L.sativae、南美斑潛蠅L.huidob、rensis番茄斑潛蠅L.bryoniae和蔥斑潛蠅L.chinensis,其中前三種是目前世界上最具為害性的入侵性斑潛蠅。為了進一步研究斑潛蠅屬昆蟲種間和種內的形態(tài)學特征變異和基因遺傳分化程度,給檢疫鑒定工作提供準確的依據(jù)和更便捷的鑒定方法,給斑潛蠅的分化、擴張、控制和防治工作提供理論研究基礎,本文對采集到的5種4771頭斑潛蠅個體形態(tài)特征做了詳細的比較分析,其中對5種285頭斑潛蠅個體的主要背面特征(詳見附錄Ⅰ)做了拍照記錄和線粒體COI基因檢測的驗證,以期探索更穩(wěn)定、快速和...
【文章頁數(shù)】:139 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要 ABSTRACT 第一章 文獻綜述
1 斑潛蠅屬的研究概況
1.1 斑潛蠅屬的分類研究簡史
1.2 斑潛蠅屬的形態(tài)分類
1.3 五種重要斑潛蠅的形態(tài)鑒別特征
1.3.1 三葉斑潛蠅
1.3.2 美洲斑潛蠅
1.3.3 南美斑潛蠅
1.3.4 番茄斑潛蠅
1.3.5 蔥斑潛蠅
1.4 五種重要斑潛蠅的研究概況
1.4.1 三葉斑潛蠅
1.4.2 美洲斑潛蠅
1.4.3 南美斑潛蠅
1.4.4 番茄斑潛蠅
1.4.5 蔥斑潛蠅
1.5 五種重要斑潛蠅的分子生物學研究
2 物種分化的方式
2.1 異域物種分化
2.2 同域物種分化
2.3 種群分化研究概述
2.4 昆蟲本身具備的種群分化的條件
2.5 斑潛蠅的種群分化研究
3 線粒體基因組學研究概況
3.1 線粒體簡介
3.2 動物線粒體基因組
3.3 線粒體DNA的進化
3.4 線粒體RNA二級結構變化
3.5 斑潛蠅線粒體基因組研究概況
4 微衛(wèi)星標記研究概況
4.1 微衛(wèi)星序列的概念和類型
4.2 微衛(wèi)星的功能
4.2.1 作為重組和復制密碼
4.2.2 參與結構基因的表達
4.2.3 作為染色質折疊密碼
4.2.4 與性別決定有關
4.2.5 與蛋白表達的劑量效應有關
4.2.6 參與組成端粒與著絲粒結構
4.3 微衛(wèi)星標記多態(tài)性形成的機理
4.3.1 滑鏈錯配假說
4.3.2 基因重組假說
4.4 微衛(wèi)星標記的特點
4.4.1 數(shù)量豐富
4.4.2 豐富的多態(tài)性
4.4.3 共顯性遺傳
4.4.4 具有一定的通用性
4.4.5 檢測的高效性
5 小結與討論 第二章 五種重要斑潛蠅的形態(tài)鑒定研究
1 材料與方法
1.1 供試樣本
1.2 主要試劑
1.3 主要儀器
1.4 觀察、解剖及拍攝方法
2 結果與分析
2.1 雄性外生殖器
2.2 內外項鬃著生區(qū)域顏色
2.3 翅脈M3+4脈比例
2.4 腹部背面觀
3 討論與小結 第三章 基于線粒體基因COI與核基因EF-1A的種群遺傳結構分析
1 材料與方法
1.1 供試樣本
1.2 主要試劑
1.3 主要儀器
1.4 基因組DNA的提取
1.5 引物設計和PCR反應
1.6 PCR產物檢測及測序
1.7 序列整理及數(shù)據(jù)分析
2 結果與分析
2.1 基因片段的序列分析
2.1.1 三葉斑潛蠅種群COI基因片段的序列分析
2.1.2 三葉斑潛蠅種群EF-1a基因片段的序列分析
2.2 五種斑潛蠅遺傳多樣性的分析
2.2.1五種斑潛蠅COI基因各種群內的遺傳多樣性分析
2.2.2 五種斑潛蠅EF-1a基因各種群內的遺傳多樣性分析
2.3 三葉斑潛蠅種群間遺傳多樣性的分析
2.3.1 三葉斑潛蠅種群間遺傳分化
2.3.2 分子變異分析
2.4 5種斑潛蠅單倍型系統(tǒng)發(fā)育
2.4.1 5種斑潛蠅系統(tǒng)發(fā)育樹
2.4.2 三葉斑潛蠅種群系統(tǒng)發(fā)育樹
2.5 單倍型網(wǎng)絡圖
2.5.1 三葉斑潛蠅單倍型的網(wǎng)狀圖
3 小結與討論 第四章 基于微衛(wèi)星標記的三葉斑潛蠅及近似種種群遺傳結構對比分析
1 材料與方法
1.1 供試樣本
1.2 主要試劑及主要儀器
1.3 基因組DNA的提取
1.4 微衛(wèi)星序列的檢測與引物設計
1.5 微衛(wèi)星標記的多態(tài)性檢測
1.6 微衛(wèi)星位點擴增
1.7 基因分型
1.8 數(shù)據(jù)分析
2 結果與分析
2.1 基因組DNA提取結果
2.2 引物篩選結果
2.3 微衛(wèi)星位點多態(tài)性檢測結果
2.4 種群的遺傳多樣性
2.4.1 位點間的遺傳多樣性
2.4.2 種群間的遺傳多樣性
2.4.3 種群間的遺傳分化
2.5 種群遺傳結構
2.6 瓶頸效應的檢測
3 小結與討論 第五章 蔥斑潛蠅線粒體基因組
1 材料和方法
1.1 樣品和DNA提取
1.2 PCR擴增和測序反應
1.3 測序組裝、注釋和分析
1.4 系統(tǒng)進化分析
2 結果與分析
2.1 核苷酸組成
2.2 蛋白質編碼基因
2.3 轉運tRNA基因
2.4 核糖體rRNA基因
2.5 控制區(qū)(A+T富含區(qū))
2.6 系統(tǒng)進化分析
3 小結與討論 參考文獻 附錄 致謝 攻讀學位期間發(fā)表的學術論文目錄
【參考文獻】:
期刊論文
[1]三葉斑潛蠅幼蟲種群空間格局及抽樣技術研究[J]. 常亞文,何婭婷,沈媛,龔偉榮,田子華,杜予州. 環(huán)境昆蟲學報. 2016(04)
[2]江蘇地區(qū)三葉斑潛蠅和美洲斑潛蠅的發(fā)生危害及種群動態(tài)[J]. 常亞文,沈媛,董長生,龔偉榮,田子華,杜予州. 應用昆蟲學報. 2016(04)
[3]半翅目昆蟲線粒體基因組學研究進展[J]. 郭仲龍,袁明龍. 中國科學:生命科學. 2016(02)
[4]江蘇地區(qū)三葉斑潛蠅發(fā)生規(guī)律與綜合防控技術[J]. 龔偉榮,褚姝頻,胡婕,杜予州. 江蘇農業(yè)科學. 2013(10)
[5]雙翅目昆蟲線粒體基因組結構特點及其測序通用引物的設計和應用[J]. 張乃心,張玉娟,余果,陳斌. 昆蟲學報. 2013(04)
[6]江蘇省三葉斑潛蠅發(fā)生調查及分子檢測[J]. 楊飛,曹婧曼,杜予州. 植物保護. 2010(06)
[7]美洲斑潛蠅不同寄主種群及地理種群間的β-tubulin基因序列分析[J]. 杜予州,王莉萍,陸亞娟,鄭福山,陸自強. 中國農業(yè)科學. 2008(05)
[8]三葉斑潛蠅在中國的適生區(qū)預測[J]. 雷仲仁,姚君明,朱燦健,王海鴻. 植物保護. 2007(05)
[9]不同地理種群美洲斑潛蠅及近緣種的rDNA-ITS1序列分析和比較[J]. 王莉萍,杜予州,何婭婷,陸亞娟,陸自強. 昆蟲學報. 2007(06)
[10]中國斑潛蠅屬種類和2新紀錄種記述(雙翅目,潛蠅科)[J]. 陳文龍,李子忠,顧丁,柳瓊友. 西南大學學報(自然科學版). 2007(04)
博士論文
[1]幾種入侵斑潛蠅線粒體全基因組序列分析及種群分化研究[D]. 王帥宇.中國農業(yè)科學院 2010
碩士論文
[1]水稻大螟種群遺傳結構研究[D]. 湯小天.揚州大學 2016
[2]江蘇地區(qū)番茄斑潛蠅的生物學及生態(tài)學研究[D]. 何婭婷.揚州大學 2008
[3]美洲斑潛蠅的種群分化研究[D]. 陸亞娟.揚州大學 2003
本文編號:3687028
【文章頁數(shù)】:139 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要 ABSTRACT 第一章 文獻綜述
1 斑潛蠅屬的研究概況
1.1 斑潛蠅屬的分類研究簡史
1.2 斑潛蠅屬的形態(tài)分類
1.3 五種重要斑潛蠅的形態(tài)鑒別特征
1.3.1 三葉斑潛蠅
1.3.2 美洲斑潛蠅
1.3.3 南美斑潛蠅
1.3.4 番茄斑潛蠅
1.3.5 蔥斑潛蠅
1.4 五種重要斑潛蠅的研究概況
1.4.1 三葉斑潛蠅
1.4.2 美洲斑潛蠅
1.4.3 南美斑潛蠅
1.4.4 番茄斑潛蠅
1.4.5 蔥斑潛蠅
1.5 五種重要斑潛蠅的分子生物學研究
2 物種分化的方式
2.1 異域物種分化
2.2 同域物種分化
2.3 種群分化研究概述
2.4 昆蟲本身具備的種群分化的條件
2.5 斑潛蠅的種群分化研究
3 線粒體基因組學研究概況
3.1 線粒體簡介
3.2 動物線粒體基因組
3.3 線粒體DNA的進化
3.4 線粒體RNA二級結構變化
3.5 斑潛蠅線粒體基因組研究概況
4 微衛(wèi)星標記研究概況
4.1 微衛(wèi)星序列的概念和類型
4.2 微衛(wèi)星的功能
4.2.1 作為重組和復制密碼
4.2.2 參與結構基因的表達
4.2.3 作為染色質折疊密碼
4.2.4 與性別決定有關
4.2.5 與蛋白表達的劑量效應有關
4.2.6 參與組成端粒與著絲粒結構
4.3 微衛(wèi)星標記多態(tài)性形成的機理
4.3.1 滑鏈錯配假說
4.3.2 基因重組假說
4.4 微衛(wèi)星標記的特點
4.4.1 數(shù)量豐富
4.4.2 豐富的多態(tài)性
4.4.3 共顯性遺傳
4.4.4 具有一定的通用性
4.4.5 檢測的高效性
5 小結與討論 第二章 五種重要斑潛蠅的形態(tài)鑒定研究
1 材料與方法
1.1 供試樣本
1.2 主要試劑
1.3 主要儀器
1.4 觀察、解剖及拍攝方法
2 結果與分析
2.1 雄性外生殖器
2.2 內外項鬃著生區(qū)域顏色
2.3 翅脈M3+4脈比例
2.4 腹部背面觀
3 討論與小結 第三章 基于線粒體基因COI與核基因EF-1A的種群遺傳結構分析
1 材料與方法
1.1 供試樣本
1.2 主要試劑
1.3 主要儀器
1.4 基因組DNA的提取
1.5 引物設計和PCR反應
1.6 PCR產物檢測及測序
1.7 序列整理及數(shù)據(jù)分析
2 結果與分析
2.1 基因片段的序列分析
2.1.1 三葉斑潛蠅種群COI基因片段的序列分析
2.1.2 三葉斑潛蠅種群EF-1a基因片段的序列分析
2.2 五種斑潛蠅遺傳多樣性的分析
2.2.1五種斑潛蠅COI基因各種群內的遺傳多樣性分析
2.2.2 五種斑潛蠅EF-1a基因各種群內的遺傳多樣性分析
2.3 三葉斑潛蠅種群間遺傳多樣性的分析
2.3.1 三葉斑潛蠅種群間遺傳分化
2.3.2 分子變異分析
2.4 5種斑潛蠅單倍型系統(tǒng)發(fā)育
2.4.1 5種斑潛蠅系統(tǒng)發(fā)育樹
2.4.2 三葉斑潛蠅種群系統(tǒng)發(fā)育樹
2.5 單倍型網(wǎng)絡圖
2.5.1 三葉斑潛蠅單倍型的網(wǎng)狀圖
3 小結與討論 第四章 基于微衛(wèi)星標記的三葉斑潛蠅及近似種種群遺傳結構對比分析
1 材料與方法
1.1 供試樣本
1.2 主要試劑及主要儀器
1.3 基因組DNA的提取
1.4 微衛(wèi)星序列的檢測與引物設計
1.5 微衛(wèi)星標記的多態(tài)性檢測
1.6 微衛(wèi)星位點擴增
1.7 基因分型
1.8 數(shù)據(jù)分析
2 結果與分析
2.1 基因組DNA提取結果
2.2 引物篩選結果
2.3 微衛(wèi)星位點多態(tài)性檢測結果
2.4 種群的遺傳多樣性
2.4.1 位點間的遺傳多樣性
2.4.2 種群間的遺傳多樣性
2.4.3 種群間的遺傳分化
2.5 種群遺傳結構
2.6 瓶頸效應的檢測
3 小結與討論 第五章 蔥斑潛蠅線粒體基因組
1 材料和方法
1.1 樣品和DNA提取
1.2 PCR擴增和測序反應
1.3 測序組裝、注釋和分析
1.4 系統(tǒng)進化分析
2 結果與分析
2.1 核苷酸組成
2.2 蛋白質編碼基因
2.3 轉運tRNA基因
2.4 核糖體rRNA基因
2.5 控制區(qū)(A+T富含區(qū))
2.6 系統(tǒng)進化分析
3 小結與討論 參考文獻 附錄 致謝 攻讀學位期間發(fā)表的學術論文目錄
【參考文獻】:
期刊論文
[1]三葉斑潛蠅幼蟲種群空間格局及抽樣技術研究[J]. 常亞文,何婭婷,沈媛,龔偉榮,田子華,杜予州. 環(huán)境昆蟲學報. 2016(04)
[2]江蘇地區(qū)三葉斑潛蠅和美洲斑潛蠅的發(fā)生危害及種群動態(tài)[J]. 常亞文,沈媛,董長生,龔偉榮,田子華,杜予州. 應用昆蟲學報. 2016(04)
[3]半翅目昆蟲線粒體基因組學研究進展[J]. 郭仲龍,袁明龍. 中國科學:生命科學. 2016(02)
[4]江蘇地區(qū)三葉斑潛蠅發(fā)生規(guī)律與綜合防控技術[J]. 龔偉榮,褚姝頻,胡婕,杜予州. 江蘇農業(yè)科學. 2013(10)
[5]雙翅目昆蟲線粒體基因組結構特點及其測序通用引物的設計和應用[J]. 張乃心,張玉娟,余果,陳斌. 昆蟲學報. 2013(04)
[6]江蘇省三葉斑潛蠅發(fā)生調查及分子檢測[J]. 楊飛,曹婧曼,杜予州. 植物保護. 2010(06)
[7]美洲斑潛蠅不同寄主種群及地理種群間的β-tubulin基因序列分析[J]. 杜予州,王莉萍,陸亞娟,鄭福山,陸自強. 中國農業(yè)科學. 2008(05)
[8]三葉斑潛蠅在中國的適生區(qū)預測[J]. 雷仲仁,姚君明,朱燦健,王海鴻. 植物保護. 2007(05)
[9]不同地理種群美洲斑潛蠅及近緣種的rDNA-ITS1序列分析和比較[J]. 王莉萍,杜予州,何婭婷,陸亞娟,陸自強. 昆蟲學報. 2007(06)
[10]中國斑潛蠅屬種類和2新紀錄種記述(雙翅目,潛蠅科)[J]. 陳文龍,李子忠,顧丁,柳瓊友. 西南大學學報(自然科學版). 2007(04)
博士論文
[1]幾種入侵斑潛蠅線粒體全基因組序列分析及種群分化研究[D]. 王帥宇.中國農業(yè)科學院 2010
碩士論文
[1]水稻大螟種群遺傳結構研究[D]. 湯小天.揚州大學 2016
[2]江蘇地區(qū)番茄斑潛蠅的生物學及生態(tài)學研究[D]. 何婭婷.揚州大學 2008
[3]美洲斑潛蠅的種群分化研究[D]. 陸亞娟.揚州大學 2003
本文編號:3687028
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