核盤菌兩個新型RNA病毒基因組的分子生物學(xué)特性研究
發(fā)布時間:2022-01-09 18:26
核盤菌(Sclerotinia sclerotiorum(Lib.)de Bary)是一種危害嚴(yán)重的死體營養(yǎng)型病原真菌,它能夠侵染并危害的植物達(dá)75科450多種,在世界范圍內(nèi)都有分布。從湖北、陜西、四川省各地的發(fā)病油菜植株采集的3,600多個菌核中分離獲得3,000多株核盤菌菌株,其中自湖北荊門菌株JMTJ14及湖北荊州的菌株JZJL2為菌核缺陷型。本論文以此二菌株研究材料,以核盤菌菌株Ep-1PNA367及1980為參考菌株,對菌落形態(tài)、菌絲生長速度、菌絲干重、和致病力等生物學(xué)特性進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)它們在菌落形態(tài)、生長速率和致病力等方面不存在顯著的差異,菌核形成相關(guān)基因與草酸降解相關(guān)基因間的表達(dá)等方面同樣也不存在顯著的差異。目前,在核盤菌中也發(fā)現(xiàn)許多真菌病毒,其中有部分弱毒相關(guān)病毒,使用弱毒相關(guān)病毒、拮抗和/或寄生微生物如盾殼霉生物防治由核盤菌引起病害是比較重要的方法。在本文的研究中,我們確定了菌株JMTJ14和JZJL2均攜帶有ds RNA片段,對存在的ds RNA片段進(jìn)行了克隆研究。核盤菌菌株JMTJ14攜帶一種新的RNA病毒,命名為核盤菌Sclerotinia sclerotior...
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:104 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
略縮詞表
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 核盤菌研究進(jìn)展
1.1.1 核盤菌的生物學(xué)特性
1.1.2 核盤菌的寄主范圍及其危害
1.1.3 核盤菌菌核的形成過程
1.1.4 核盤菌的生活史及病害循環(huán)
1.1.5 菌核病的防治
1.2 真菌病毒的研究進(jìn)展
1.2.1 真菌病毒
1.2.2 真菌病毒的起源及進(jìn)化
1.2.3 真菌病毒分類
1.2.4 真菌病毒的傳播
1.2.5 真菌病毒與其寄主真菌的關(guān)系
1.2.6 真菌病毒在生物防治應(yīng)用上的相關(guān)研究
1.3 本研究的目的意義
第二章 核盤菌菌核缺陷型菌株的篩選及其原因初探
2.1 引言
2.2 材料和方法
2.2.1 材料
2.2.2 核盤菌產(chǎn)菌核缺陷菌株的篩選
2.2.3 菌株JMTJ14 和JZJL2 酸性物質(zhì)分泌能力檢測
2.2.4 菌株JMTJ14 和JZJL2 的菌核形成相關(guān)基因的表達(dá)
2.2.5 菌株JMTJ14 和JZJL2 產(chǎn)生菌核能力
2.2.6 菌株 JMTJ14 和 JZJL2 核酸的提取
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 菌株的菌落形態(tài)及篩選
2.3.2 JMTJ14 和JZJL2 菌株的分類地位
2.3.3 菌株JMTJ14 和JZJL2 的酸性物質(zhì)定性測定及草酸相關(guān)基因分析
2.3.4 核盤菌菌株JMTJ14 和JZJL2 的菌核形成相關(guān)基因分析
2.3.5 JMTJ14 和JZJL2 菌株菌核的誘導(dǎo)
2.3.6 菌株JMTJ14 和JZJL2 攜帶有dsRNA因子
2.4 結(jié)論與討論
第三章 SsFV1 全長cDNA克隆及對菌株Ep-1PNA367 和1980的影響
3.1 引言
3.2 材料與方法
3.2.1 材料
3.2.2 菌株JMTJ14 中dsRNA因子的提取
3.2.3 dsRNA因子全長cDNA克隆
3.2.4 dsRNA因子全長cDNA序列的拼接及序列分析
3.2.5 dsRNA Northern雜交鑒定
3.2.6 JMTJ14 與Ep-1PNA367 和1980菌株的營養(yǎng)親和性檢測
3.2.7 菌株JMTJ14 中的dsRNA因子水平傳播
3.2.8 菌株JMTJ14 中的dsRNA因子對核盤菌生物學(xué)特性的影響
3.2.9 基于基因表達(dá)水平的分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 dsRNA因子全長cDNA克隆策略及拼接
3.3.2 dsRNA因子cDNA全長序列同源性分析
3.3.3 JMTJ14 菌株中的SsFV1 Northern雜交驗證
3.3.4 菌株JMTJ14 與Ep-1PNA367R和 1980R的營養(yǎng)親和性檢測
3.3.5 SsFV1 的水平傳播
3.3.6 基于基因表達(dá)水平的差異顯著基因篩選(DEGs)
3.4 結(jié)論與討論
第四章 SsEV1 全長cDNA克隆分析及對菌株Ep-1PNA367 和1980的影響
4.1 引言
4.2 材料與方法
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 SsEV1 cDNA全長克隆
4.3.2 SsEV1 全長cDNA序列分析
4.3.3 菌株JZJL2 與Ep-1PNA367R和 1980R隸屬于不同的營養(yǎng)親和群
4.3.4 Ep-1PNA367R/SsEV1 和 1980R/SsEV1 的dsRNA鑒定
4.3.5 Ep-1PNA367R/SsEV1 和 1980R/SsEV1 菌株中SsEV1 的RT-PCR鑒定
4.3.6 SsEV1 對Ep-1PNA367R和 1980R的影響
4.4 結(jié)論與討論
全文總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀博士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
本文編號:3579224
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:104 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
略縮詞表
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 核盤菌研究進(jìn)展
1.1.1 核盤菌的生物學(xué)特性
1.1.2 核盤菌的寄主范圍及其危害
1.1.3 核盤菌菌核的形成過程
1.1.4 核盤菌的生活史及病害循環(huán)
1.1.5 菌核病的防治
1.2 真菌病毒的研究進(jìn)展
1.2.1 真菌病毒
1.2.2 真菌病毒的起源及進(jìn)化
1.2.3 真菌病毒分類
1.2.4 真菌病毒的傳播
1.2.5 真菌病毒與其寄主真菌的關(guān)系
1.2.6 真菌病毒在生物防治應(yīng)用上的相關(guān)研究
1.3 本研究的目的意義
第二章 核盤菌菌核缺陷型菌株的篩選及其原因初探
2.1 引言
2.2 材料和方法
2.2.1 材料
2.2.2 核盤菌產(chǎn)菌核缺陷菌株的篩選
2.2.3 菌株JMTJ14 和JZJL2 酸性物質(zhì)分泌能力檢測
2.2.4 菌株JMTJ14 和JZJL2 的菌核形成相關(guān)基因的表達(dá)
2.2.5 菌株JMTJ14 和JZJL2 產(chǎn)生菌核能力
2.2.6 菌株 JMTJ14 和 JZJL2 核酸的提取
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 菌株的菌落形態(tài)及篩選
2.3.2 JMTJ14 和JZJL2 菌株的分類地位
2.3.3 菌株JMTJ14 和JZJL2 的酸性物質(zhì)定性測定及草酸相關(guān)基因分析
2.3.4 核盤菌菌株JMTJ14 和JZJL2 的菌核形成相關(guān)基因分析
2.3.5 JMTJ14 和JZJL2 菌株菌核的誘導(dǎo)
2.3.6 菌株JMTJ14 和JZJL2 攜帶有dsRNA因子
2.4 結(jié)論與討論
第三章 SsFV1 全長cDNA克隆及對菌株Ep-1PNA367 和1980的影響
3.1 引言
3.2 材料與方法
3.2.1 材料
3.2.2 菌株JMTJ14 中dsRNA因子的提取
3.2.3 dsRNA因子全長cDNA克隆
3.2.4 dsRNA因子全長cDNA序列的拼接及序列分析
3.2.5 dsRNA Northern雜交鑒定
3.2.6 JMTJ14 與Ep-1PNA367 和1980菌株的營養(yǎng)親和性檢測
3.2.7 菌株JMTJ14 中的dsRNA因子水平傳播
3.2.8 菌株JMTJ14 中的dsRNA因子對核盤菌生物學(xué)特性的影響
3.2.9 基于基因表達(dá)水平的分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 dsRNA因子全長cDNA克隆策略及拼接
3.3.2 dsRNA因子cDNA全長序列同源性分析
3.3.3 JMTJ14 菌株中的SsFV1 Northern雜交驗證
3.3.4 菌株JMTJ14 與Ep-1PNA367R和 1980R的營養(yǎng)親和性檢測
3.3.5 SsFV1 的水平傳播
3.3.6 基于基因表達(dá)水平的差異顯著基因篩選(DEGs)
3.4 結(jié)論與討論
第四章 SsEV1 全長cDNA克隆分析及對菌株Ep-1PNA367 和1980的影響
4.1 引言
4.2 材料與方法
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 SsEV1 cDNA全長克隆
4.3.2 SsEV1 全長cDNA序列分析
4.3.3 菌株JZJL2 與Ep-1PNA367R和 1980R隸屬于不同的營養(yǎng)親和群
4.3.4 Ep-1PNA367R/SsEV1 和 1980R/SsEV1 的dsRNA鑒定
4.3.5 Ep-1PNA367R/SsEV1 和 1980R/SsEV1 菌株中SsEV1 的RT-PCR鑒定
4.3.6 SsEV1 對Ep-1PNA367R和 1980R的影響
4.4 結(jié)論與討論
全文總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀博士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
本文編號:3579224
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