白皮松（Pinus bungeana Zucc.ex Endl.）為我國特有樹種,具有重要的文化價值,生態(tài)價值和經(jīng)濟(jì)價值,在我國造林、園林綠化、生態(tài)工程等廣泛使用。為豐富白皮松分子水平數(shù)據(jù),并分析矮化性狀變異的分子調(diào)控機(jī)制,本研究以白皮松新品種的矮化性狀為切入點,利用白皮松矮化性狀變異新品種和普通白皮松品種作為對比材料,通過高通量測序技術(shù)建立白皮松轉(zhuǎn)錄組文庫,并對差異基因利用GO,KEGG數(shù)據(jù)庫進(jìn)行功能富集與分析,篩選出與白皮松樹形矮化有關(guān)的unigenes,并使用RT-q PCR加以驗證;再利用代謝組學(xué)的方法對代謝物進(jìn)行研究,分析其差異代謝物;在上述基礎(chǔ)上,測定兩個差異品種的激素含量的水平;最后,利用RACE對關(guān)鍵基因進(jìn)行了克隆,并利用生物信息學(xué)手段對序列進(jìn)行了分析。得到的主要研究結(jié)論如下:（1）對矮化變異的灌木狀白皮松和普通白皮松進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,共獲得了88 092個平均長度為758 bp的unigenes。此外,通過BLAST,42 667個unigenes（48.43%）與已知的蛋白數(shù)據(jù)庫具有的相似性。差異表達(dá)分析表明,共有98個上調(diào)unigenes和60個下調(diào)unigenes... 

【文章來源】：中國林業(yè)科學(xué)研究院北京市

【文章頁數(shù)】：142 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

圖2-1兩種白皮松的株型示意

第二章白皮松轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析23P=1.02E-7P=3.09E-24P=2.06E-2P=3.25E-4P=1.17E-8a.小枝長度（mm）b.針葉長度（mm）c.針葉束數(shù)（束）9號樹盆仙9號樹盆仙9號樹盆仙9號樹盆仙9號樹盆仙d.小枝直徑（mm）e.針葉平均間距（mm/束）圖2-2白皮松表型的比較Figure2-2comparisonofphenotypesofpinusponderosa

第二章白皮松轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析25表2-3測序所得的unigenes的長度分布Table2-3UnigenesQuantityandPercentageofLengthUnigenes的長度UnigenesLength總量TotalNumber比例Percentage200-3003178336.08%300-5002002022.73%500-10001691719.20%1000-20001178413.38%2000+75888.61%總數(shù)目TotalNumber88092總長度TotalLength66791509N50長度N50Length1357平均長度MeanLength758圖2-3測序得到的unigenes長度分布圖Figure2-3Thelengthdistributionsoftheunigenes2.2.2.2基因功能注釋使用BLAST工具進(jìn)行unigenes功能注釋，控制E-value的臨界值為10-5，與NCBI的Nr、Pfam、Swiss-Prot，和KEGG數(shù)據(jù)庫、COG數(shù)據(jù)庫、KOG、GO數(shù)據(jù)庫。最終，48.43%的unigenes比對成功，51.57%仍然未知。在所有已注釋的unigenes中，41504個與Nr數(shù)據(jù)庫匹配，29287個與Pfam數(shù)據(jù)庫匹配，25679個與GO數(shù)據(jù)庫匹配，27426

【參考文獻(xiàn)】：
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本文編號：3572769