陸地棉體細胞胚胎發(fā)生過程中miRNAs及其靶標的鑒定和GhmiR157a/GhSPL10功能分析
發(fā)布時間:2021-12-22 07:39
體細胞胚胎發(fā)生體系是研究已分化組織和器官脫分化和再分化的良好模型,也是植物轉(zhuǎn)基因技術(shù)的重要依托,對于其機制的研究具有重要的理論和應(yīng)用價值。micro RNAs(mi RNAs)是一類長度通常為19-25個核苷酸(nt)的內(nèi)源非編碼RNA,在植物的生長發(fā)育,激素信號轉(zhuǎn)導,逆境脅迫響應(yīng)等方面起著重要的作用。然而棉花中關(guān)于mi RNAs的研究較少;本研究基于實驗室前期篩選的一個高效體細胞胚胎發(fā)生的材料YZ1,利用小RNA測序結(jié)合降解組測序,鑒定棉花體細胞胚胎發(fā)生過程中的小RNA及其靶標基因,研究他們在體細胞胚胎發(fā)生過程中的動態(tài)調(diào)控,綜合闡述小RNA及其靶標基因在棉花體細胞胚胎發(fā)生中的調(diào)控作用;并進一步探討棉花中Ghmi R157a及其靶標Gh SPL10在棉花脫分化過程中的生物學功能。主要研究結(jié)果如下:1、棉花體細胞胚胎發(fā)生相關(guān)mi RNAs及其靶標基因的挖掘與鑒定本研究構(gòu)建了YZ1胚性愈傷(EC)和下胚軸(CK,對照)的小RNA測序文庫。發(fā)現(xiàn)36個家族的保守mi RNAs在兩個樣品間差異表達,發(fā)現(xiàn)屬于19個家族的29條保守mi RNAs的前體,同時發(fā)現(xiàn)了25個新的mi RNAs及其前體。這...
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:142 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
棉花體細胞胚胎發(fā)生過程(Yangetal2012)Figure1.1SEprocesseincotton(Yangetal2012)
華中農(nóng)業(yè)大學 2017 屆博士研究生學位論文10圖1.2 miRNAs生物合成的動態(tài)過程(Achkar et al 2016)Figure1.2 Cotranscriptional Assembly of the miRNA Processing Complex (Achkar et al 2016)
iRNAs 及其靶標的鑒定和 GhmiR157a/GhSPL10 功能分析15圖1.3 miRNAs介導的基因沉默(Rogers and Chen 2013)Figure 1.3 Overview of miRNA-Mediated Gene Silencing (Rogers and Chen 2013)1.2.3 MIR 基因的進化關(guān)于 MIR 基因在進化上是如何產(chǎn)生的?目前主要有兩種假說:第一種假說認為MIR 基因是由靶標基因的反向復(fù)制演化而來(Allen et al 2004),即始祖基因經(jīng)過反向復(fù)制,導致完整或部分基因序列形成頭對頭,或者尾對尾的排列,并且在復(fù)制過程中有可能形成新的啟動子,轉(zhuǎn)錄之后形成折疊結(jié)構(gòu)作為 DCL 的底物產(chǎn)生 siRNA 從而對始祖基因或其成員造成基因沉默。該假說的主要依據(jù)是在擬南芥中發(fā)現(xiàn)一些MIR基因在miRNA/miRNA*區(qū)域外的側(cè)翼序列與其靶標的基因序列存在一定程度的相似性(Allen et al 2004)。這種假說已被實驗所證實,比如:ath-miR822、ath-miR839和 ath-miR869 的前體即是被 DCL4 作用形成了 siRNAs (Ben Amor et al 2009;Rajagopalan et al 2006b)。隨著進化的過程不斷進行,在 DCL1 識別區(qū)域以外逐漸產(chǎn)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Molecular characterization and expression analysis of Triticum aestivum squamosa-promoter binding protein-box genes involved in ear development[J]. Bin Zhang,Xia Liu,Guangyao Zhao,Xinguo Mao,Ang Li,Ruilian Jing. Journal of Integrative Plant Biology. 2014(06)
[2]兩種常用激素組合下棉花體細胞胚胎發(fā)生過程的組織學觀察[J]. 朱華國,張獻龍,金雙俠,劉冠澤. 棉花學報. 2012(02)
[3]一種適合于cDNA文庫構(gòu)建的高質(zhì)量棉花RNA的簡單抽提法(英文)[J]. 朱龍付,涂禮莉,曾范昌,劉迪秋,張獻龍. 作物學報. 2005(12)
[4]棉花體細胞胚胎發(fā)生和植株再生的影響因素[J]. 遲吉娜,李喜煥,王省芬,張桂寅,馬峙英. 棉花學報. 2004(01)
[5]不同激素誘導陸地棉體細胞胚胎發(fā)生的效應(yīng)[J]. 張獻龍,王武,劉金蘭,孫濟中. 華中農(nóng)業(yè)大學學報. 1991(03)
[6]不同基因型棉花下胚軸離體培養(yǎng)胚狀體發(fā)生的研究[J]. 董合忠. 萊陽農(nóng)學院學報. 1991(02)
博士論文
[1]海島棉microRNA及其靶標的鑒定和功能分析[D]. 劉念.華中農(nóng)業(yè)大學 2016
本文編號:3546019
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:142 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
棉花體細胞胚胎發(fā)生過程(Yangetal2012)Figure1.1SEprocesseincotton(Yangetal2012)
華中農(nóng)業(yè)大學 2017 屆博士研究生學位論文10圖1.2 miRNAs生物合成的動態(tài)過程(Achkar et al 2016)Figure1.2 Cotranscriptional Assembly of the miRNA Processing Complex (Achkar et al 2016)
iRNAs 及其靶標的鑒定和 GhmiR157a/GhSPL10 功能分析15圖1.3 miRNAs介導的基因沉默(Rogers and Chen 2013)Figure 1.3 Overview of miRNA-Mediated Gene Silencing (Rogers and Chen 2013)1.2.3 MIR 基因的進化關(guān)于 MIR 基因在進化上是如何產(chǎn)生的?目前主要有兩種假說:第一種假說認為MIR 基因是由靶標基因的反向復(fù)制演化而來(Allen et al 2004),即始祖基因經(jīng)過反向復(fù)制,導致完整或部分基因序列形成頭對頭,或者尾對尾的排列,并且在復(fù)制過程中有可能形成新的啟動子,轉(zhuǎn)錄之后形成折疊結(jié)構(gòu)作為 DCL 的底物產(chǎn)生 siRNA 從而對始祖基因或其成員造成基因沉默。該假說的主要依據(jù)是在擬南芥中發(fā)現(xiàn)一些MIR基因在miRNA/miRNA*區(qū)域外的側(cè)翼序列與其靶標的基因序列存在一定程度的相似性(Allen et al 2004)。這種假說已被實驗所證實,比如:ath-miR822、ath-miR839和 ath-miR869 的前體即是被 DCL4 作用形成了 siRNAs (Ben Amor et al 2009;Rajagopalan et al 2006b)。隨著進化的過程不斷進行,在 DCL1 識別區(qū)域以外逐漸產(chǎn)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Molecular characterization and expression analysis of Triticum aestivum squamosa-promoter binding protein-box genes involved in ear development[J]. Bin Zhang,Xia Liu,Guangyao Zhao,Xinguo Mao,Ang Li,Ruilian Jing. Journal of Integrative Plant Biology. 2014(06)
[2]兩種常用激素組合下棉花體細胞胚胎發(fā)生過程的組織學觀察[J]. 朱華國,張獻龍,金雙俠,劉冠澤. 棉花學報. 2012(02)
[3]一種適合于cDNA文庫構(gòu)建的高質(zhì)量棉花RNA的簡單抽提法(英文)[J]. 朱龍付,涂禮莉,曾范昌,劉迪秋,張獻龍. 作物學報. 2005(12)
[4]棉花體細胞胚胎發(fā)生和植株再生的影響因素[J]. 遲吉娜,李喜煥,王省芬,張桂寅,馬峙英. 棉花學報. 2004(01)
[5]不同激素誘導陸地棉體細胞胚胎發(fā)生的效應(yīng)[J]. 張獻龍,王武,劉金蘭,孫濟中. 華中農(nóng)業(yè)大學學報. 1991(03)
[6]不同基因型棉花下胚軸離體培養(yǎng)胚狀體發(fā)生的研究[J]. 董合忠. 萊陽農(nóng)學院學報. 1991(02)
博士論文
[1]海島棉microRNA及其靶標的鑒定和功能分析[D]. 劉念.華中農(nóng)業(yè)大學 2016
本文編號:3546019
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