棉花作為世界上最重要的天然纖維作物之一,在我國國民經(jīng)濟中占據(jù)著重要的地位。近年來,隨著人民生活水平的提高和紡織技術(shù)的發(fā)展,人們對棉纖維品質(zhì)的要求越來越高。現(xiàn)有陸地棉品種遺傳基礎(chǔ)比較狹窄,限制了其纖維品質(zhì)的進(jìn)一步改良。棉屬中豐富的品種資源為陸地棉育種和遺傳改良提供了遺傳物質(zhì)基礎(chǔ),種間雜交策略在棉花育種過程中得到了廣泛應(yīng)用。棉花主要的農(nóng)藝性狀如產(chǎn)量、纖維品質(zhì)等重要性狀均為數(shù)量性狀,其表現(xiàn)受環(huán)境和多基因共同作用影響,利用傳統(tǒng)育種方法進(jìn)行改良進(jìn)展緩慢。目前,棉花基因組信息不斷完善,在全基因組水平上將性狀與QTL相結(jié)合,有助于解析相關(guān)性狀的遺傳基礎(chǔ),為棉花品質(zhì)育種提供借鑒和補充。本研究以纖維品質(zhì)優(yōu)異的J02-508和品質(zhì)差的ZRI015兩個陸地棉為親本組配群體,結(jié)合簡化基因組（GBS）測序技術(shù),從全基因組水平對纖維產(chǎn)量及品質(zhì)性狀進(jìn)行QTL定位;并以J02-508為研究材料,對纖維長度相關(guān)候選基因進(jìn)行預(yù)測分析與功能驗證;同時對群體中的偏分離現(xiàn)象進(jìn)行分析,結(jié)合親本J02-508的復(fù)雜遺傳背景信息加以研究,以解析優(yōu)異纖維品質(zhì)的遺傳基礎(chǔ)。主要結(jié)果如下:1.對J02-508與ZRI015兩個親本的鈴重、衣... 

【文章來源】：山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省

【文章頁數(shù)】：121 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

檢驗下親本間纖維產(chǎn)量和品質(zhì)性狀差異顯著性n代表重復(fù)個數(shù)

陸地棉優(yōu)異種質(zhì)J02-508纖維相關(guān)性狀QTL定位及偏分離分析28圖2纖維產(chǎn)量與品質(zhì)同一性狀在不同世代間的相關(guān)性Fig.2Correlationbetweenthesametraitsoffiberyieldandqualityindifferentgenerations3.1.4群體纖維產(chǎn)量與品質(zhì)性狀間的相關(guān)性分析綜合所有群體的表型數(shù)據(jù)，分別進(jìn)行不同性狀同一群體的相關(guān)性分析，結(jié)果見表2。產(chǎn)量性狀鈴重與衣分之間相關(guān)性不顯著；纖維品質(zhì)性狀之間，纖維長度與纖維強度在四個世代間均呈現(xiàn)極顯著正相關(guān)，纖維長度與馬克隆值在F4、F5和F6三個世代中呈現(xiàn)極顯著負(fù)相關(guān)。其余品質(zhì)性狀間僅在部分世代中相關(guān)，相關(guān)性不穩(wěn)定。產(chǎn)量與品質(zhì)性狀之間，鈴重與纖維長度、伸長率和馬克隆值在兩個世代中呈現(xiàn)顯著或極顯著相關(guān)，與纖維強度不相關(guān)；衣分與纖維長度和馬克隆值在三個世代中正相關(guān)，與伸長率在兩個世代中極顯著正相關(guān)，與纖維強度在大多數(shù)世代不相關(guān)。因此在我們的后代群體中，一定程度上削弱了纖維產(chǎn)量與品質(zhì)特別是與纖維強度間的負(fù)相關(guān)性，引起這一結(jié)果的原因或作用機理有待進(jìn)一步研究。

陸地棉優(yōu)異種質(zhì)J02-508纖維相關(guān)性狀QTL定位及偏分離分析30表3親本和子代各樣品測序數(shù)據(jù)均值統(tǒng)計表Table3Themeanvalueofthesequencingdataofparentsandoffspring樣品Sample有效數(shù)據(jù)Cleanreads有效比對數(shù)據(jù)MappedreadsQ30百分?jǐn)?shù)Q30(%)GC含量GCcontent(%)平均深度Averagedepth(X)J02-50813,904,443.613,870,976.890.9937.0219.73ZRI01513,791,624.013,758,426.990.7137.2219.64OffspringF55,566,657.65,550,941.889.2338.0111.063.2.2SNP標(biāo)記的開發(fā)與染色體分布基于親本基因型檢測結(jié)果，進(jìn)行親本間多態(tài)性標(biāo)記開發(fā)，總共得到115,544個標(biāo)記位點。進(jìn)一步對這些標(biāo)記位點進(jìn)行完整度（0.75）過濾后，獲得30,000個標(biāo)記位點。根據(jù)比對到參考基因組的結(jié)果，去掉比對到未成功組裝的染色體scaffold上的標(biāo)記后，得到25,018個SNP標(biāo)記位于陸地棉26條染色體上。由圖3可以看出，所有的SNP標(biāo)記在26條染色體上的分布不均等。位于D08染色體上的多態(tài)性SNP標(biāo)記密度最高，而A04、A10、A13、D06等染色體上有較大的區(qū)間內(nèi)未得到多態(tài)性SNP標(biāo)記。圖3多態(tài)性SNP標(biāo)記在染色體上的分布和密度不同梯度顏色代表了標(biāo)記間不同的密度值。黑色意味著該區(qū)域內(nèi)沒有標(biāo)記。Fig.3ThedistributionanddensityofthepolymorphicmarkersonchromosomesThegradientcolorsrepresenteddifferentdensityvaluesofmakers.Theblackmeanttherewerenomarkerinthisregion.3.2.3高密度遺傳圖譜構(gòu)建隨后，我們對25,018個SNP標(biāo)記位點過濾掉偏分離P值小于0.001的標(biāo)記后，最終獲得了7,071個標(biāo)記用于遺傳圖譜構(gòu)建。使用Joinmap4.0軟件對前面獲得的7,071個標(biāo)記進(jìn)行連鎖群劃分，得最終的圖譜結(jié)果（圖4）。遺傳連鎖圖譜包含4,060個標(biāo)記，

【參考文獻(xiàn)】：
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碩士論文
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本文編號：3324965