MiR-101-3p通過(guò)靶基因STC1對(duì)奶山羊卵巢顆粒細(xì)胞調(diào)控機(jī)理的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-07-28 02:23
MicroRNAs是一系列進(jìn)化保守的單鏈小非編碼RNA分子,廣泛存在于生物體各個(gè)部位,并參與調(diào)節(jié)機(jī)體的生長(zhǎng)、發(fā)育、凋亡等生理過(guò)程。在眾多miRNA中,miR-101-3p是一種腫瘤抑制因子,參與了許多與腫瘤相關(guān)的生物學(xué)過(guò)程,包括增殖、凋亡、血管生成、耐藥性、侵襲和轉(zhuǎn)移。課題組前期研究結(jié)果表明miR-101-3p在產(chǎn)單羔和多羔奶山羊的卵巢中差異表達(dá)顯著,表明miR-101-3p對(duì)卵泡的生長(zhǎng)發(fā)育有重要的調(diào)控作用。但miR-101-3p及它的靶基因是如何調(diào)控卵巢顆粒細(xì)胞的增殖、凋亡和分泌功能的尚未見(jiàn)報(bào)道。因此,本試驗(yàn)以關(guān)中奶山羊卵巢顆粒細(xì)胞為研究對(duì)象,利用高通量測(cè)序、ELISA、CCK-8、EdU、流式細(xì)胞術(shù)、熒光探針原位雜交、免疫組化、HE染色等技術(shù),通過(guò)干擾、過(guò)表達(dá)以及共表達(dá)方法研究了miR-101-3p通過(guò)靶基因STC1調(diào)控顆粒細(xì)胞激素分泌、細(xì)胞增殖、細(xì)胞凋亡的機(jī)理。主要研究結(jié)果如下:1.過(guò)表達(dá)miR-101-3p的卵巢顆粒細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序在顆粒細(xì)胞中過(guò)表達(dá)miR-101-3p,通過(guò)高通量測(cè)序和生物信息學(xué)分析獲得142個(gè)差異表達(dá)的miRNA。GO和KEGG富集分析獲得對(duì)卵泡發(fā)育有調(diào)控作用...
【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:161 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
技術(shù)路線
在做差異表達(dá)分析之前,應(yīng)先檢查樣品間基因的表達(dá)模式相關(guān)性,相關(guān)系數(shù)越接近1,表明樣品間的表達(dá)模式越相似。生物學(xué)重復(fù)的樣本之間相關(guān)系數(shù)過(guò)低,會(huì)影響分析結(jié)果,應(yīng)去除此類(lèi)樣本。如圖2-2所示,從樣品間相關(guān)系數(shù)的熱圖中顯示,來(lái)源于同
因條件為:表達(dá)倍數(shù)差異 |fold change| > 2 ,顯著性 Pvalue<0.05 。結(jié)果表明,與對(duì)照組相比,處理組共得到差異表達(dá)的mRNA(DEG)142個(gè),包括下調(diào)78個(gè),其中特異表達(dá)3個(gè),上調(diào)64個(gè),其中特異表達(dá)6個(gè)(圖2-3)。表達(dá)量最高的前10個(gè)DGS和表達(dá)差異倍數(shù)最高的前20個(gè)DEGs如表2-7,2-8所示,其中表達(dá)量最高的五個(gè)mRNA是STC1,NDUFA4L2,F(xiàn)SHβ,KRT7,C4BPA;表達(dá)差異倍數(shù)最大的五個(gè)mRNA是C3H1orf168,LOC102187646,LC108633912
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]miR-101通過(guò)抑制DNA甲基轉(zhuǎn)移酶3a抑制乳腺癌細(xì)胞的增殖和遷移[J]. 劉健,龐亞梅,王黃震,李艷波,孫欣,徐菲,任宏,劉大鵬. 細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志. 2016(03)
[2]Genes Differentially Expressed in Human Lung Fibroblast Cells Transformed by Glycidyl Methacrylate[J]. XUE-JUN YIN *,#,3, JIAN-NING XU #, CHANG-QI ZOU #, FENG-SHENG HE #, AND FU-DE FANG*,2 *Institute of Basic Medical Sciences, Chinese Academy of Medical Sciences, Beijing 100005, China; #Institute of Occupational Health and Poisoning Control, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing 100050, China. Biomedical and Environmental Sciences. 2004(04)
博士論文
[1]PI3K p110delta催化亞基在小鼠卵巢卵泡生長(zhǎng)中的功能研究[D]. 李倩.南京醫(yī)科大學(xué) 2013
本文編號(hào):3307006
【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:161 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
技術(shù)路線
在做差異表達(dá)分析之前,應(yīng)先檢查樣品間基因的表達(dá)模式相關(guān)性,相關(guān)系數(shù)越接近1,表明樣品間的表達(dá)模式越相似。生物學(xué)重復(fù)的樣本之間相關(guān)系數(shù)過(guò)低,會(huì)影響分析結(jié)果,應(yīng)去除此類(lèi)樣本。如圖2-2所示,從樣品間相關(guān)系數(shù)的熱圖中顯示,來(lái)源于同
因條件為:表達(dá)倍數(shù)差異 |fold change| > 2 ,顯著性 Pvalue<0.05 。結(jié)果表明,與對(duì)照組相比,處理組共得到差異表達(dá)的mRNA(DEG)142個(gè),包括下調(diào)78個(gè),其中特異表達(dá)3個(gè),上調(diào)64個(gè),其中特異表達(dá)6個(gè)(圖2-3)。表達(dá)量最高的前10個(gè)DGS和表達(dá)差異倍數(shù)最高的前20個(gè)DEGs如表2-7,2-8所示,其中表達(dá)量最高的五個(gè)mRNA是STC1,NDUFA4L2,F(xiàn)SHβ,KRT7,C4BPA;表達(dá)差異倍數(shù)最大的五個(gè)mRNA是C3H1orf168,LOC102187646,LC108633912
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]miR-101通過(guò)抑制DNA甲基轉(zhuǎn)移酶3a抑制乳腺癌細(xì)胞的增殖和遷移[J]. 劉健,龐亞梅,王黃震,李艷波,孫欣,徐菲,任宏,劉大鵬. 細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志. 2016(03)
[2]Genes Differentially Expressed in Human Lung Fibroblast Cells Transformed by Glycidyl Methacrylate[J]. XUE-JUN YIN *,#,3, JIAN-NING XU #, CHANG-QI ZOU #, FENG-SHENG HE #, AND FU-DE FANG*,2 *Institute of Basic Medical Sciences, Chinese Academy of Medical Sciences, Beijing 100005, China; #Institute of Occupational Health and Poisoning Control, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing 100050, China. Biomedical and Environmental Sciences. 2004(04)
博士論文
[1]PI3K p110delta催化亞基在小鼠卵巢卵泡生長(zhǎng)中的功能研究[D]. 李倩.南京醫(yī)科大學(xué) 2013
本文編號(hào):3307006
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