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甘藍(lán)型油菜結(jié)角層厚度性狀的表觀遺傳途徑調(diào)控研究

發(fā)布時(shí)間:2021-04-17 09:13
  甘藍(lán)型油菜(Brassica napus L.,2n=38,genome AACC)是世界上主要的油料作物之一,可以作為人類食用油和動(dòng)物蛋白飼料,具有重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。隨著世界人口的逐年增加,可利用耕地面積逐漸減少,增加產(chǎn)量仍然是作物育種的主要目標(biāo)之一。對于馴化作物,育種工作者們提出了一個(gè)增加產(chǎn)量的有效策略——―理想株型育種‖。結(jié)角層厚度指植株最下部有效角果(有飽滿種子的角果)到最上部有效角果的空間厚度,是一個(gè)復(fù)雜的綜合株型性狀,不但與經(jīng)濟(jì)產(chǎn)量密切相關(guān),還與多個(gè)株型性狀有重要聯(lián)系,例如,株高、莖高、結(jié)角起點(diǎn)高度、結(jié)角終點(diǎn)高度、主花序有效長度、一次有效分枝高度、一次有效分枝數(shù)量、一次無效分枝數(shù)量等。油菜結(jié)角層結(jié)構(gòu)還與有效光合面積、透光率、抗倒伏性等具有重要聯(lián)系。油菜是我國第一大油料作物,其主產(chǎn)區(qū)長江流域占全國種植面積85%以上。此區(qū)域品種為冬油菜,因此不與水稻、玉米等作物爭地,可與這些作物錯(cuò)季種植,從而充分利用土地。但長江流域油菜大面積生產(chǎn)平均產(chǎn)量約120150 kg/畝,少數(shù)高產(chǎn)示范才可突破200 kg/畝,單產(chǎn)的進(jìn)一步提高仍是主要育種目標(biāo)。因此,通過改良結(jié)角層厚度... 

【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:146 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

甘藍(lán)型油菜結(jié)角層厚度性狀的表觀遺傳途徑調(diào)控研究


甘藍(lán)型油菜結(jié)角層厚度與多個(gè)株型性狀相關(guān)Figure1.1TheTPCrelatedtoarchitecturetraitsinB.napus.

流程圖,作物,產(chǎn)量,流程圖


第1章文獻(xiàn)綜述3情況(Chapmanetal.2007)。然而,研究表明小麥產(chǎn)量在70~100cm的株高范圍內(nèi)達(dá)到最大化(Flinthametal.1997;BOTWRIGHTetal.2005)。圖1.2作物高度如何影響產(chǎn)量的流程圖Figure1.2Flowchartshowinghowcropheightinfluencesyield.ThefigureisderivedfromLiuetal.(2018)水稻株高主要受1~3個(gè)主要基因控制,但受次要基因調(diào)控(Liuetal.2008)。大多數(shù)―秈型‖品種的自然或人工誘導(dǎo)的矮稈突變體都是半矮稈基因sd1的純合突變體,很少受兩個(gè)以上基因控制。日本水稻品種也存在類似的情況(Liuetal.2008)。水稻矮稈基因的命名已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化,其中d為矮稈,sd為半矮稈(Mitsunagaetal.1994)。這些基因已根據(jù)發(fā)現(xiàn)的年代進(jìn)行編號,其中62個(gè)d和15個(gè)sd基因已注冊(T.1995)。它們大致可分為三類:(1)與sd1位點(diǎn)相同;(2)與sd1共享一個(gè)復(fù)雜位點(diǎn);(3)與sd1位點(diǎn)不共位(Muraietal.1990)。玉米株高分為高(2.5m以上)、中(1.8~2.5m)和矮(1.8m以下)三種類型,由單基因或多基因控制(Liuetal.2018a)。目前,在玉米中共發(fā)現(xiàn)了20個(gè)矮化基因,但只有17個(gè)被定位。除了DWARF8(D8),DWARF9(D9)andDWARF8(D11)之外,這些基因大多是隱性的,且具有單基因特征(Lawitetal.2010;Wangetal.2013)。小麥株高受主要基因控制,并受其他幾個(gè)修飾基因調(diào)控。在小麥中,矮化基因主要屬于Rht家族,共鑒定出26個(gè)矮化基因。其中9個(gè)基因已經(jīng)在遺傳圖譜上被繪制出來,5個(gè)基因是隱性的(McintoshR1988)。大多數(shù)研究集中在Rht1、Rht2、Rht3、Rht8、Rht9、Rht10、Rht12和Rht13,它們對產(chǎn)量的影響各不相同。多品種比較表明,攜帶Rht1和Rht2基因的半矮稈栽培品種比較高莖干商業(yè)品種產(chǎn)量更高(MirallesandSlafer1995;Beharavetal.1998;BOTWRIGHTetal.2005;Rebetzkeetal.2011;Rebetzkeetal.2012;Wangeta

電泳圖,電泳圖,樣品,甘藍(lán)


第2章甘藍(lán)型油菜結(jié)角層厚度轉(zhuǎn)錄組分析17圖2.1部分樣品總RNA電泳圖Figure2.1ElectrophoresisphotosoftotalRNAsofselectedsamples2.3.3通過RNA-seq篩選差異基因根據(jù)連續(xù)三年的結(jié)角層性狀調(diào)查,我們選擇了兩組極端材料作為轉(zhuǎn)錄組測序研究對象。YC4和YC33是厚的結(jié)角層材料,而YC11和YC33是選定的薄的結(jié)角層材料。YC4、YC33、YC11和YC15連續(xù)三年結(jié)角層厚度平均值分別為105.9cm、98.4cm、75.8cm和62.9cm(表2.1)。每個(gè)材料取兩個(gè)部位,包括莖尖和附近的幼蕾,用于轉(zhuǎn)錄組測序分析(IlluminaHiSeq2000,Illumina,SanDiego,CA,USA)?傆(jì)8個(gè)樣品,單樣品產(chǎn)生39.96~50.53百萬條干凈reads,平均每個(gè)樣品產(chǎn)生約43.47百萬條干凈reads。每個(gè)樣品兩個(gè)生物學(xué)重復(fù)。所有樣品與甘藍(lán)型油菜參考基因組的比對率約為83.9%(Chalhoubetal.2014)。詳細(xì)比對信息見表2.3和表2.4。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]甘藍(lán)型油菜莖高QTL定位及株高相關(guān)位點(diǎn)整合[J]. 魏麗娟,劉瑞影,張莉,陳志友,楊鴻,霍強(qiáng),李加納.  作物學(xué)報(bào). 2019(06)
[2]甘藍(lán)型雜交油菜主花序長度與植株性狀的相關(guān)分析[J]. 戴祥來,趙繼獻(xiàn),向陽,任廷波,程國平.  中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2018(05)
[3]利用DH和IF2群體檢測甘藍(lán)型油菜株高相關(guān)性狀QTL[J]. 賀亞軍,吳道明,傅鷹,錢偉.  作物學(xué)報(bào). 2018(04)
[4]超量表達(dá)水稻miRNA 167a調(diào)控株型的研究[J]. 韋懿,陳志輝,陳國興,熊立仲,吳昌銀.  分子植物育種. 2011(04)

博士論文
[1]甘藍(lán)型油菜株型與角果相關(guān)性狀的QTL分析[D]. 漆麗萍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014

碩士論文
[1]甘藍(lán)型油菜主花序長度和莖高相關(guān)基因的定位分析[D]. 張莉.西南大學(xué) 2018
[2]甘藍(lán)型油菜株高和角果長及其相關(guān)性狀QTL定位[D]. 陰濤.西南大學(xué) 2015
[3]油菜株型相關(guān)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 段秀建.西南大學(xué) 2015
[4]甘藍(lán)型油菜主要株型性狀的遺傳分析和QTL初步定位[D]. 張倩.西南大學(xué) 2013



本文編號:3143195

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