寧夏地區(qū)豬流感流行病學(xué)調(diào)查及病毒分離株遺傳變異分析
本文選題:豬流感 切入點(diǎn):調(diào)查 出處:《甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)》2017年博士論文 論文類型:學(xué)位論文
【摘要】:豬流感(SI)是由A型流感病毒引起的一種急性、傳染性呼吸道疾病,其臨床癥狀表現(xiàn)為咳嗽、呼吸困難、發(fā)熱及衰竭;雖然該病的死亡率不高,但其影響豬的發(fā)育,延緩豬的生長及出欄時間,給養(yǎng)殖業(yè)帶來重大經(jīng)濟(jì)損失;同時豬被認(rèn)為是流感病毒的“中間宿主”和“混合器”,可同時感染禽流感病毒(AIV)和人流感病毒,并可重組產(chǎn)生具有新遺傳特性、致病性的具有大流行潛力的新病毒。因此,開展豬流感病毒(SIV)的監(jiān)測和遺傳進(jìn)化分析,對豬流感的防控及人間流感大流行的預(yù)測具有重要意義。本研究對2013-2014年寧夏11個市25個規(guī)模豬場采集的920份血清樣品和920份雙鼻孔拭子進(jìn)行血清學(xué)和病原學(xué)檢測。血清學(xué)檢測結(jié)果顯示,H1N1、H3N2亞型SIV抗體陽性率分別為21.2%和2.6%,H1N1+H3N2抗體陽性率為0.65%;病原學(xué)檢測結(jié)果顯示,SIV陽性樣品128份,陽性率13.9%。隨后,于2013-2014年走訪寧夏22個市的養(yǎng)豬場、屠宰場及部分散養(yǎng)戶,采集豬血清樣品及雙鼻孔拭子,進(jìn)行血清學(xué)、病原學(xué)檢測。血清學(xué)檢測結(jié)果顯示,1710份被檢血清中,H1亞型SI抗體陽性率(11.81%)明顯高于H3亞型SI抗體陽性率(0.46%),H1+H3亞型SI抗體陽性率為0.35%,H5、H9亞型抗體陽性率分別為0.06%和0.18%;病原學(xué)檢測結(jié)果表明,4230份雙鼻孔棉拭子樣品中,588份為SIV陽性,陽性率13.9%。監(jiān)測結(jié)果說明寧夏地區(qū)流行的SIV以H1N1亞型為主,同時存在H1N1和H3N2亞型混合感染和SIV隱性帶毒情況。為了研究寧夏地區(qū)豬流感病毒遺傳進(jìn)化特性,對分離到的5株H1N1亞型SIV和4株H3N2亞型進(jìn)行了M2基因遺傳進(jìn)化分析。結(jié)果顯示,5株H1N1亞型SIV中,4株病毒屬于北美H1N1 SIV分支,1株病毒屬于類人H1N1 SIV分支,說明寧夏流行的H1N1亞型SIV具有遺傳多樣性。分離的4株H3N2亞型SIV均屬于類人H3N2 SIV,與廣東、福建分離株同源性較高。為了進(jìn)一步研究H1N1亞型SIV的遺傳進(jìn)化特征,對2011年分離的5株H1N1亞型SIV進(jìn)行了基因組擴(kuò)增、遺傳進(jìn)化分析、關(guān)鍵氨基酸位點(diǎn)分析。結(jié)果表明,5株H1N1亞型SIV具有遺傳多樣性,1株病毒屬于類人H1N1 SIV分支,2株病毒屬于經(jīng)典H1N1 SIV分支,2株病毒為北美三源重組SIV(PB2、PB1、PA、NP、NS基因)與經(jīng)典H1N1 SIV(HA、NA、M基因)的重組病毒。5株H1N1病毒受體結(jié)合位點(diǎn)處氨基酸存在差異,且抗原位點(diǎn)處氨基酸具有分支特異性,其中,3株病毒具有PB2 E627K變異。為了滿足豬流感病毒檢測的需求,本研究建立了SIV通用型RT-PCR方法、H1和H3分型RT-PCR方法,以及焦磷酸測序方法。通用型RT-PCR方法對SI陽性樣品的擴(kuò)增條帶231bp,具有很好的特異性和重復(fù)性。分型RT-PCR方法可同時鑒定H1、H3、N1、N2亞型SIV,具有較好的特異性和重復(fù)性。焦磷酸測序反應(yīng)以通用型RT-PCR擴(kuò)增產(chǎn)物為模板,測序區(qū)域覆蓋豬流感病毒M2基因金剛烷胺耐藥性相關(guān)位點(diǎn),可用于病毒抗藥性的快速鑒定。本研究對寧夏地區(qū)SIV進(jìn)行系統(tǒng)監(jiān)測,并對分離株進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析、關(guān)鍵氨基酸位點(diǎn)分析,研究結(jié)果豐富了我國豬流感病毒流行病學(xué)數(shù)據(jù)庫,加深了對寧夏地區(qū)豬流感流行現(xiàn)狀的了解,為我國豬流感的科學(xué)防控提供理論基礎(chǔ)。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:S858.28
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,本文編號:1635920
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